Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-183530" >
A protocol for char...
-
Generó, Magalí Martí,1983-Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten
(författare)
A protocol for characterization of extremely preterm infant gut microbiota in double-blind clinical trials
- Artikel/kapitelEngelska2021
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Cambridge, MA, United States :Cell press,2021
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-183530
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-183530URI
-
https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.100652DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Funding: the Lions Forskningsfond mot folksjukdomar (Lions LiU-2019-03041), the Swedish Research Council (grant number 921.2014-7060), the Swedish Society for Medical Research, the Swedish Society of Medicine, the Research Council for South-East Sweden, ALF Grants, Region Östergötland, and BioGaia AB, Stockholm, Sweden.
-
16S rRNA gene sequencing enables microbial community profiling, but recovering fecal DNA from extremely premature infants is challenging. Here, we describe an optimized protocol for fecal DNA isolation, library preparation for 16S rRNA gene sequencing, taxonomy assignation, and statistical analyses. The protocol is complemented with a quantitative PCR for probiotic L. reuteri identification. This protocol describes how to characterize preterm infant gut microbiota and relate it to probiotic supplementation and clinical outcomes. It is customizable for other clinical trials. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Martí et al. (2021) and Spreckels et al. (2021).
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Spreckels, Johanne,1992-Linköpings universitet,Medicinska fakulteten,Avdelningen för inflammation och infektion,Department of Genetics, University Medical Centre Groningen, Groningen, the Netherlands(Swepub:liu)johsp90
(författare)
-
Jenmalm, Maria,1971-Linköpings universitet,Avdelningen för inflammation och infektion,Medicinska fakulteten(Swepub:liu)marje18
(författare)
-
Abrahamsson, Thomas,1968-Linköpings universitet,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus(Swepub:liu)thoab97
(författare)
-
Linköpings universitetAvdelningen för barns och kvinnors hälsa
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:STAR ProtocolsCambridge, MA, United States : Cell press2:32666-1667
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas