Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-29432" >
Constructing and an...
-
Gustafsson, Mika,1977-Linköpings universitet,Institutionen för teknik och naturvetenskap,Tekniska högskolan
(författare)
Constructing and analyzing a large-scale gene-to-gene regulatory network Lasso-constrained inference and biological validation
- Artikel/kapitelEngelska2005
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-29432
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-29432URI
-
https://doi.org/10.1109/TCBB.2005.35DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
We construct a gene-to-gene regulatory network from time-series data of expression levels for the whole genome of the yeast Saccharomyces cerevisae, in a case where the number of measurements is much smaller than the number of genes in the network. This network is analyzed with respect to present biological knowledge of all genes (according to the Gene Ontology database), and we find some of its large-scale properties to be in accordance with known facts about the organism. The linear modeling employed here has been explored several times, but due to lack of any validation beyond investigating individual genes, it has been seriously questioned with respect to its applicability to biological systems. Our results show the adequacy of the approach and make further investigations of the model meaningful.
Ämnesord och genrebeteckningar
-
TECHNOLOGY
-
TEKNIKVETENSKAP
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Hörnquist, Michael,1969-Linköpings universitet,Institutionen för teknik och naturvetenskap,Tekniska högskolan(Swepub:liu)micho58
(författare)
-
Lombardi, Anna,1965-Linköpings universitet,Institutionen för teknik och naturvetenskap,Tekniska högskolan(Swepub:liu)annlo98
(författare)
-
Linköpings universitetInstitutionen för teknik och naturvetenskap
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:IEEE/ACM Transactions on Computational Biology & Bioinformatics2:3, s. 254-2611545-59631557-9964
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas