SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-58168"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-58168" > The correlation pat...

  • Lilljebjörn, HenrikLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital (författare)

The correlation pattern of acquired copy number changes in 164 ETV6/RUNX1-positive childhood acute lymphoblastic leukemias

  • Artikel/kapitelEngelska2010

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2010-05-31
  • Oxford University Press,2010
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-58168
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-58168URI
  • https://doi.org/10.1093/hmg/ddq224DOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/1654944URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The ETV6/RUNX1 fusion gene, present in 25% of B-lineage childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), is thought to represent an initiating event, which requires additional genetic changes for leukemia development. To identify additional genetic alterations, 24 ETV6/RUNX1-positive ALLs were analyzed using 500K single nucleotide polymorphism arrays. The results were combined with previously published data sets, allowing us to ascertain genomic copy number aberrations (CNAs) in 164 cases. In total, 45 recurrent CNAs were identified with an average number of 3.5 recurrent changes per case (range 0-13). Twenty-six percent of cases displayed a set of recurrent CNAs identical to that of other cases in the data set. The majority (74%), however, displayed a unique pattern of recurrent CNAs, indicating a large heterogeneity within this ALL subtype. As previously demonstrated, alterations targeting genes involved in B-cell development were common (present in 28% of cases). However, the combined analysis also identified alterations affecting nuclear hormone response (24%) to be a characteristic feature of ETV6/RUNX1-positive ALL. Studying the correlation pattern of the CNAs allowed us to highlight significant positive and negative correlations between specific aberrations. Furthermore, oncogenetic tree models identified ETV6, CDKN2A/B, PAX5, del(6q) and +16 as possible early events in the leukemogenic process.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Soneson, CharlotteLund University,Lunds universitet,Matematik LTH,Matematikcentrum,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Mathematics (Faculty of Engineering),Centre for Mathematical Sciences,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)math-css (författare)
  • Andersson, AnnaLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital(Swepub:lu)kgen-aan (författare)
  • Heldrup, JesperLund University,Lunds universitet,Pediatrik, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Paediatrics (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-jrh (författare)
  • Behrendtz, MikaelÖstergötlands Läns Landsting,Barn- och ungdomskliniken i Linköping (författare)
  • Kawamata, NorihikoUniversity of California Los Angeles (författare)
  • Ogawa, SeishiUniversity of Tokyo (författare)
  • Koeffler, H. PhillipUniversity of California Los Angeles (författare)
  • Mitelman, FelixLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital(Swepub:lu)kgen-fmi (författare)
  • Johansson, BertilLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital(Swepub:lu)kgen-bjo (författare)
  • Fontes, MagnusLund University,Lunds universitet,Matematik LTH,Matematikcentrum,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Mathematics (Faculty of Engineering),Centre for Mathematical Sciences,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)math-mfo (författare)
  • Fioretos, ThoasLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Skåne University Hospital(Swepub:lu)kgen-tfi (författare)
  • Avdelningen för klinisk genetikInstitutionen för laboratoriemedicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Human Molecular Genetics: Oxford University Press19:16, s. 3150-31580964-69061460-2083

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy