id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-79798"
Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:liu-79798" > Combined Multivaria...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Zhao, YelinLinköpings universitet,Institutionen för klinisk och experimentell medicin,Hälsouniversitetet (författare)
Combined Multivariate and Pathway Analyses Show That Allergen-Induced Gene Expression Changes in CD4(+) T Cells Are Reversed by Glucocorticoids
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2012-06-12
- Public Library of Science,2012
- electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-79798
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-79798URI
- https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039016DOI
- https://gup.ub.gu.se/publication/160363URI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Background: Glucocorticoids (GCs) play a key role in the treatment of allergy. However, the genome-wide effects of GCs on gene expression in allergen-challenged CD4(+) T cells have not been described. The aim of this study was to perform a genome-wide analysis to investigate whether allergen-induced gene expression changes in CD4(+) T cells could be reversed by GCs. Methodology/Principal Findings: Gene expression microarray analysis was performed to profile gene expression in diluent( D), allergen- (A), and allergen + hydrocortisone- (T) challenged CD4(+) T cells from patients with seasonal allergic rhinitis. Principal component analysis (PCA) showed good separation of the three groups. To identify the correlation between changes in gene expression in allergen-challenged CD4(+) T cells before and after GC treatment, we performed orthogonal partial least squares discriminant analysis (OPLS-DA) followed by Pearson correlation analysis. This revealed that allergen-induced genes were widely reversed by GC treatment (r = -0.77, Pless than0.0001). We extracted 547 genes reversed by GC treatment from OPLS-DA models based on their high contribution to the discrimination and found that those genes belonged to several different inflammatory pathways including TNFR2 Signalling, Interferon Signalling, Glucocorticoid Receptor Signalling and T Helper Cell Differentiation. The results were supported by gene expression microarray analyses of two independent materials. Conclusions/Significance: Allergen-induced gene expression changes in CD4(+) T cells were reversed by treatment with glucocorticoids. The top allergen-induced genes that reversed by GC treatment belonged to several inflammatory pathways and genes of known or potential relevance for allergy.
Ämnesord och genrebeteckningar
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Pediatrik hsv//swe
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Pediatrics hsv//eng
- MEDICINE
- MEDICIN
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Wang, HuiGothenburg University,Göteborgs universitet,Linköpings universitet,Institutionen för klinisk och experimentell medicin,Hälsouniversitetet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik,Institute of Clinical Sciences, Department of Pediatrics(Swepub:gu)xwanhu (författare)
- Gustafsson, MikaLinköpings universitet,Institutionen för klinisk och experimentell medicin,Hälsouniversitetet(Swepub:liu)mikgu75 (författare)
- Muraro, AntonellaUniversity of Padua, Italy (författare)
- Bruhn, SörenLinköpings universitet,Institutionen för klinisk och experimentell medicin,Hälsouniversitetet(Swepub:liu)sorbr27 (författare)
- Benson, MikaelLinköpings universitet,Institutionen för klinisk och experimentell medicin,Hälsouniversitetet(Swepub:gu)xbenmi (författare)
- Linköpings universitetInstitutionen för klinisk och experimentell medicin (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science7:61932-6203
Internetlänk
- https://liu.diva-portal.org/smash/get/diva2:544985/FULLTEXT01.pdffulltext:print
- https://journals.plos.org/plosone/article/file?id=10.1371/journal.pone.0039016&type=printable
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-79798
- https://doi.org/10.1371/journal.pone.0039016
- https://gup.ub.gu.se/publication/160363
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Zhao, Yelin
- Wang, Hui
- Gustafsson, Mika
- Muraro, Antonell ...
- Bruhn, Sören
- Benson, Mikael
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Klinisk medicin
- och Pediatrik
- Artiklar i publikationen
- PLOS ONE
- Av lärosätet
- Linköpings universitet
- Göteborgs universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
