SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Ekström Ola)
 

Sökning: WFRF:(Ekström Ola) > Unbiased Approach f...

Unbiased Approach for Virus Detection in Skin Lesions

Bzhalava, Davit (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
Johansson, Hanna K (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Lund University, Malmö, Sweden
Ekström, Johanna (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
visa fler...
Faust, Helena (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Lund University, Malmö, Sweden
Moller, Birgitta (författare)
Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
Eklund, Carina (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
Nordin, Peter (författare)
Läkarhuset, Gothenburg, Sweden
Stenquist, Bo (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för dermatologi och venereologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Dermatology and Venereology,University of Gothenburg, Sweden
Paoli, John, 1975 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för dermatologi och venereologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Dermatology and Venereology,University of Gothenburg, Sweden
Persson, Bengt (författare)
Linköpings universitet,Bioinformatik,Tekniska högskolan
Forslund, Ola (författare)
Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Lund University, Malmö, Sweden
Dillner, Joakim (författare)
Karolinska Institutet,Lund University,Lunds universitet,Klinisk mikrobiologi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Microbiology, Malmö,Lund University Research Groups,Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2013-06-28
2013
Engelska.
Ingår i: PLOS ONE. - : Public Library of Science. - 1932-6203. ; 8:6
Relaterad länk:
https://doi.org/10.1...
visa fler...
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
https://journals.plo...
https://portal.resea... (primary) (free)
http://dx.doi.org/10... (free)
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://lup.lub.lu.s...
https://gup.ub.gu.se...
http://kipublication...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • To assess presence of virus DNA in skin lesions, swab samples from 82 squamous cell carcinomas of the skin (SCCs), 60 actinic keratoses (AKs), paraffin-embedded biopsies from 28 SCCs and 72 kerathoacanthomas (KAs) and fresh-frozen biopsies from 92 KAs, 85 SCCs and 92 AKs were analyzed by high throughput sequencing (HTS) using 454 or Ion Torrent technology. We found total of 4,284 viral reads, out of which 4,168 were Human Papillomavirus (HPV)-related, belonging to 15 known (HPV8, HPV12, HPV20, HPV36, HPV38, HPV45, HPV57, HPV59, HPV104, HPV105, HPV107, HPV109, HPV124, HPV138, HPV147), four previously described putative (HPV 915 F 06 007 FD1, FA73, FA101, SE42) and two putatively new HPV types (SE46, SE47). SE42 was cloned, sequenced, designated as HPV155 and found to have 76% similarity to the most closely related known HPV type. In conclusion, an unbiased approach for viral DNA detection in skin tumors has found that, although some new putative HPVs were found, known HPV types constituted most of the viral DNA.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Dermatologi och venereologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Dermatology and Venereal Diseases (hsv//eng)

Nyckelord

TECHNOLOGY
TEKNIKVETENSKAP

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy