Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:lnu-49416" >
Microbial metagenom...
-
Wu, XiaofenLinnéuniversitetet,Institutionen för biologi och miljö (BOM),Ctr Ecol & Evolut Microbial Model Syst EEMiS
(författare)
Microbial metagenomes from three aquifers in the Fennoscandian shield terrestrial deep biosphere reveal metabolic partitioning among populations
- Artikel/kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2015-10-20
-
Springer Science and Business Media LLC,2016
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:lnu-49416
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:lnu:diva-49416URI
-
https://doi.org/10.1038/ismej.2015.185DOI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-264125URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Supplementary information available for this article at http://www.nature.com/ismej/journal/v10/n5/suppinfo/ismej2015185s1.html
-
Microorganisms in the terrestrial deep biosphere host up to 20% of the earth's biomass and are suggested to be sustained by the gases hydrogen and carbon dioxide. A metagenome analysis of three deep subsurface water types of contrasting age (from <20 to several thousand years) and depth (171 to 448 m) revealed phylogenetically distinct microbial community subsets that either passed or were retained by a 0.22 μm filter. Such cells of <0.22 μm would have been overlooked in previous studies relying on membrane capture. Metagenomes from the three water types were used for reconstruction of 69 distinct microbial genomes, each with >86% coverage. The populations were dominated by Proteobacteria, Candidate divisions, unclassified archaea and unclassified bacteria. The estimated genome sizes of the <0.22 μm populations were generally smaller than their phylogenetically closest relatives, suggesting that small dimensions along with a reduced genome size may be adaptations to oligotrophy. Shallow 'modern marine' water showed community members with a predominantly heterotrophic lifestyle. In contrast, the deeper, 'old saline' water adhered more closely to the current paradigm of a hydrogen-driven deep biosphere. The data were finally used to create a combined metabolic model of the deep terrestrial biosphere microbial community.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Holmfeldt, KarinLinnéuniversitetet,Institutionen för biologi och miljö (BOM),Ctr Ecol & Evolut Microbial Model Syst EEMiS(Swepub:lnu)mhoka
(författare)
-
Hubalek, Valerie,1981-Uppsala universitet,Limnologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Uppsala University(Swepub:uu)valhu921
(författare)
-
Lundin, DanielLinnéuniversitetet,Institutionen för biologi och miljö (BOM),Ctr Ecol & Evolut Microbial Model Syst EEMiS(Swepub:lnu)daluab
(författare)
-
Åström, Mats E.Linnéuniversitetet,Institutionen för biologi och miljö (BOM)(Swepub:lnu)kasma
(författare)
-
Bertilsson, StefanUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Limnologi,Uppsala University(Swepub:uu)stber839
(författare)
-
Dopson, MarkLinnéuniversitetet,Institutionen för biologi och miljö (BOM),Ctr Ecol & Evolut Microbial Model Syst EEMiS(Swepub:lnu)madoaa
(författare)
-
LinnéuniversitetetInstitutionen för biologi och miljö (BOM)
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:The ISME Journal: Springer Science and Business Media LLC10:5, s. 1192-12031751-73621751-7370
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas