Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:oru-27418" >
Integrated metageno...
-
Erickson, Alison R
(författare)
Integrated metagenomics/metaproteomics reveals human host-microbiota signatures of Crohn's disease
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2012-11-28
-
San Francisco :Public Library Science,2012
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:oru-27418
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-27418URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0049138DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Funding Agency:UH2DK83991
-
Crohn's disease (CD) is an inflammatory bowel disease of complex etiology, although dysbiosis of the gut microbiota has been implicated in chronic immune-mediated inflammation associated with CD. Here we combined shotgun metagenomic and metaproteomic approaches to identify potential functional signatures of CD in stool samples from six twin pairs that were either healthy, or that had CD in the ileum (ICD) or colon (CCD). Integration of these omics approaches revealed several genes, proteins, and pathways that primarily differentiated ICD from healthy subjects, including depletion of many proteins in ICD. In addition, the ICD phenotype was associated with alterations in bacterial carbohydrate metabolism, bacterial-host interactions, as well as human host-secreted enzymes. This eco-systems biology approach underscores the link between the gut microbiota and functional alterations in the pathophysiology of Crohn's disease and aids in identification of novel diagnostic targets and disease specific biomarkers.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Cantarel, Brandi L
(författare)
-
Lamendella, Regina
(författare)
-
Darzi, Youssef
(författare)
-
Mongodin, Emmanuel F
(författare)
-
Pan, Chongle
(författare)
-
Shah, Manesh
(författare)
-
Halfvarson, Jonas,1970-Örebro universitet,Institutionen för hälsovetenskap och medicin,Department of Internal Medicine, Division of Gastroenterology, Örebro University Hospital, Örebro, Sweden(Swepub:oru)jshn
(författare)
-
Tysk, Curt,1949-Örebro universitet,Institutionen för hälsovetenskap och medicin,Department of Internal Medicine, Division of Gastroenterology, Örebro University Hospital, Örebro, Sweden(Swepub:oru)ctk
(författare)
-
Henrissat, Bernard
(författare)
-
Raes, Jeroen
(författare)
-
Verberkmoes, Nathan C
(författare)
-
Fraser, Claire M
(författare)
-
Hettich, Robert L
(författare)
-
Jansson, Janet K
(författare)
-
Örebro universitetInstitutionen för hälsovetenskap och medicin
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLOS ONESan Francisco : Public Library Science7:111932-6203
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Erickson, Alison ...
-
Cantarel, Brandi ...
-
Lamendella, Regi ...
-
Darzi, Youssef
-
Mongodin, Emmanu ...
-
Pan, Chongle
-
visa fler...
-
Shah, Manesh
-
Halfvarson, Jona ...
-
Tysk, Curt, 1949 ...
-
Henrissat, Berna ...
-
Raes, Jeroen
-
Verberkmoes, Nat ...
-
Fraser, Claire M
-
Hettich, Robert ...
-
Jansson, Janet K
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
- Artiklar i publikationen
-
PLOS ONE
- Av lärosätet
-
Örebro universitet