SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

(WFRF:(Laitinen Tarja)) mspu:(article)
 

Sökning: (WFRF:(Laitinen Tarja)) mspu:(article) > A Missense Variant ...

  • Cirulli, Elizabeth T.Duke Univ, Duke Ctr Appl Genom & Precis Med, Durham, NC USA (författare)

A Missense Variant in PTPN22 is a Risk Factor for Drug-induced Liver Injury

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • W B SAUNDERS CO-ELSEVIER INC,2019
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-382821
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-382821URI
  • https://doi.org/10.1053/j.gastro.2019.01.034DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • BACKGROUND & AIMS: We performed genetic analyses of a multiethnic cohort of patients with idiosyncratic drug-induced liver injury (DILI) to identify variants associated with susceptibility.METHODS: We performed a genome-wide association study of 2048 individuals with DILI (cases) and 12,429 individuals without (controls). Our analysis included subjects of European (1806 cases and 10,397 controls), African American (133 cases and 1,314 controls), and Hispanic (109 cases and 718 controls) ancestry. We analyzed DNA from 113 Icelandic cases and 239,304 controls to validate our findings.RESULTS: We associated idiosyncratic DILI with rs2476601, a nonsynonymous polymorphism that encodes a substitution of tryptophan with arginine in the protein tyrosine phosphatase, nonreceptor type 22 gene (PTPN22) (odds ratio [OR] 1.44; 95% confidence interval [CI] 1.28-1.62; P = 1.2 x 10(-9) and replicated the finding in the validation set (OR 1.48; 95% CI 1.09-1.99; P =.01). The minor allele frequency showed the same effect size (OR > 1) among ethnic groups. The strongest association was with amoxicillin and clavulanate-associated DILI in persons of European ancestry (OR 1.62; 95% CI 1.32-1.98; P = 4.0 x 10(-6); allele frequency = 13.3%), but the polymorphism was associated with DILI of other causes (OR 1.37; 95% CI 1.21-1.56; P = 1.5 x 10(-6); allele frequency = 11.5%). Among amoxicillin-and clavulanate-associated cases of European ancestry, rs2476601 doubled the risk for DILI among those with the HLA risk alleles A* 02: 01 and DRB1* 15: 01.CONCLUSIONS: In a genome-wide association study, we identified rs2476601 in PTPN22 as a non-HLA variant that associates with risk of liver injury caused by multiple drugs and validated our finding in a separate cohort. This variant has been associated with increased risk of autoimmune diseases, providing support for the concept that alterations in immune regulation contribute to idiosyncratic DILI.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Nicoletti, PaolaIcahn Sch Med Mt Sinai, Dept Genet & Genom Sci, One Gustave Levy Pl, New York, NY 10029 USA;Sema4, Stamford, CT USA (författare)
  • Abramson, KarenDuke Univ, Duke Mol Physiol Inst, Durham, NC USA (författare)
  • Andrade, Raul J.Univ Malaga, Hosp Univ Virgen de la Victoria, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Hepat & Digest, UGC Digest,Inst Invest Biomed Malaga IBIMA, Malaga, Spain;Univ Malaga, IBIMA Hosp Univ Virgen de la Victoria, Malaga, Spain;CIBERehd, Madrid, Spain (författare)
  • Bjornsson, Einar S.Landspitali Univ Hosp, Dept Internal Med, Reykjavik, Iceland (författare)
  • Chalasani, NagaIndiana Univ Sch Med, Div Gastroenterol & Hepatol, Indianapolis, IN 46202 USA (författare)
  • Fontana, Robert J.Univ Michigan, Ann Arbor, MI 48109 USA (författare)
  • Hallberg, Pär,1974-Uppsala universitet,Klinisk farmakogenomik och osteoporos,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)pahal677 (författare)
  • Li, Yi JuDuke Univ, Duke Mol Physiol Inst, Durham, NC USA;Duke Univ, Dept Biostat & Bioinformat, Durham, NC USA (författare)
  • Lucena, M. IsabelUniv Malaga, Hosp Univ Virgen de la Victoria, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Hepat & Digest, UGC Digest,Inst Invest Biomed Malaga IBIMA, Malaga, Spain;Univ Malaga, IBIMA Hosp Univ Virgen de la Victoria, Malaga, Spain;CIBERehd, Madrid, Spain (författare)
  • Long, NanyeMichigan State Univ, Inst Cyber Enabled Res, E Lansing, MI 48824 USA (författare)
  • Molokhia, MariamKings Coll London, Sch Populat Hlth & Environm Sci, London, England;Kings Coll London, London, England (författare)
  • Nelson, Matthew R.GSK, Target Sci, King Of Prussia, PA USA (författare)
  • Odin, Joseph A.Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Med, New York, NY 10029 USA (författare)
  • Pirmohamed, MunirUniv Liverpool, Dept Mol & Clin Pharmacol, Liverpool, Merseyside, England;Univ Liverpool, Inst Translat Med, Liverpool, Merseyside, England (författare)
  • Rafnar, ThorunndeCODE Genet, IS-101 Reykjavik, Iceland (författare)
  • Serrano, JoseNIDDK, Bethesda, MD 20892 USA (författare)
  • Stefansson, KarideCODE Genet, IS-101 Reykjavik, Iceland (författare)
  • Stolz, AndrewUniv Southern Calif, Los Angeles, CA USA (författare)
  • Daly, Ann K.Newcastle Univ, Inst Cellular Med, Newcastle Upon Tyne, Tyne & Wear, England (författare)
  • Aithal, Guruprasad P.Nottingham Univ Hosp NHS Trust, Nottingham Digest Dis Ctr, Nottingham, England;Nottingham Univ Hosp NHS Trust, Natl Inst Hlth Res, Nottingham Biomed Res Ctr, Nottingham, England;Univ Nottingham, Nottingham, England;Nottingham Univ Hosp NHS Trust, Nottingham Digest Dis Biomed Res Unit, Natl Inst Hlth Res, Nottingham, England (författare)
  • Watkins, Paul B.Univ N Carolina, UNC Eshelman Sch Pharm, Chapel Hill, NC 27515 USA;Univ N Carolina, Inst Drug Safety Sci, Res Triangle Pk, NC USA (författare)
  • Bessone, FernandoUniv Nacl Rosario, Rosario, Santa Fe, Argentina (författare)
  • Bjornsson, EinarNatl Univ Hosp Iceland, Dept Internal Med, Div Gastroenterol & Hepatol, Reykjavik, Iceland (författare)
  • Cascorbi, IngolfUniv Hosp Schleswig Holstein, Inst Expt & Clin Pharmacol, Kiel, Germany (författare)
  • Dillon, John F.Ninewells Hosp & Med Sch, Dundee, Scotland (författare)
  • Day, Christopher P.Newcastle Univ, Inst Cellular Med, Newcastle Upon Tyne, Tyne & Wear, England (författare)
  • Hernandez, NeliaUniv Republica, Montevideo, Uruguay (författare)
  • Ibanez, LuisaHosp Univ Vall dHebron, Barcelona, Spain (författare)
  • Kullak-Ublic, Gerd A.Univ Zurich, Zurich, Switzerland (författare)
  • Laitinen, TarjaUniv Helsinki, Cent Hosp, Helsinki, Finland (författare)
  • Larrey, DominiqueHop St Eloi, Montpellier, France (författare)
  • Maitland-van der Zee, AnkeAMC, Amsterdam, Netherlands (författare)
  • Martin, Jennifer H.Univ Newcastle, Newcastle, NSW, Australia (författare)
  • Menzies, DickMUHC, Montreal, PQ, Canada;McGill Univ, Montreal Chest Inst, Montreal, PQ, Canada (författare)
  • Qin, ShengyingShanghai Jiao Tong Univ, Shanghai, Peoples R China (författare)
  • Wadelius, MiaUppsala universitet,Klinisk farmakogenomik och osteoporos(Swepub:uu)miawadel (författare)
  • Duke Univ, Duke Ctr Appl Genom & Precis Med, Durham, NC USAIcahn Sch Med Mt Sinai, Dept Genet & Genom Sci, One Gustave Levy Pl, New York, NY 10029 USA;Sema4, Stamford, CT USA (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Gastroenterology: W B SAUNDERS CO-ELSEVIER INC156:6, s. 1707-17160016-50851528-0012

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy