Identification and characterization of host proteins inducing the endoplasmic reticulum invagination during Flavivirus infection

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:oru-76406" > Identification and ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Tran, Pham Tue Hung,1991-Örebro universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Molecular Flavirus group (författare)

Identification and characterization of host proteins inducing the endoplasmic reticulum invagination during Flavivirus infection

Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2019
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:oru-76406
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-76406URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:kon swepub-publicationtype

Anmärkningar

When Flaviviruses infect host cells, they can induce invagination of endoplasmic reticulum (ER) membrane to form vesicle-like compartments. These unique structures are hypothetical to facilitate the viral replication by reducing diffusion of virus replication machinery and viral RNA, providing a scaffold to anchor the replication complex, and protecting viral RNA from host cell intrinsic surveillance. The rearrangements of ER membrane to form these replication compartments (RCs) require modifications in its lipid constituents or binding of proteins to the membrane. Flaviviruses, indeed, use their proteins to generate RCs. It has been implicated that both KUNV and DENV viral NS1, NS2A, NS4A, NS4B proteins could induce membrane remodelings. However, it is recondite whether host proteins can also participate in the formation and maintenance of RCs.In this project, we aimed to identify and characterize of host proteins inducing RC generation during Flavivirus infections. We used A549 as a cell model, and mosquito-borne Zika and Kunjin virus, and tick-borne Langat virus as virus models. After virus infections, ER membranes were harvested using ultracentrifuge with a sucrose gradient. Proteins from these ERs were identified using mass spectrometry. We compared the differences between the ER proteomes of infected cells and non-infected cells to identify host candidate proteins that can cause the RC formation. We are attempting to enrich the RC-containing fractions and identifying proteins here, which narrows the list of true candidate proteins. The candidate proteins then will be characterized by using molecular techniques such as gene knock down, overexpression, and microscopy techniques.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Infektionsmedicin hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Infectious Medicine hsv//eng
Replication complex
Kunjin
Langat
Zika
Molekylär cellbiologi
Molecular Cellbiology
Biomedicin
Biomedicine
Infektionssjukdomar
Infectious Diseases

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Asghar, Naveed,1983-Örebro universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper(Swepub:oru)nar (författare)
Karlsson, RogerDepartment ofClinical Microbiology, Sahlgrenska University Hospital, Gothenburg, Sweden; NanoxisConsulting AB, Gothenburg, Sweden (författare)
Karlsson, AndersDepartment ofClinical Microbiology, Sahlgrenska University Hospital, Gothenburg, Sweden; NanoxisConsulting AB, Gothenburg, Sweden (författare)
Johansson, Magnus,1969-Örebro universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper(Swepub:oru)msja (författare)
Melik, Wessam,1973-Örebro universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper(Swepub:oru)wmk (författare)
Örebro universitetInstitutionen för medicinska vetenskaper (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Positive-Strand RNA Viuses, s. 280-280

Internetlänk

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Tran, Pham Tue H ...; Asghar, Naveed, ...; Karlsson, Roger; Karlsson, Anders; Johansson, Magnu ...; Melik, Wessam, 1 ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Infektionsmedici ...

Artiklar i publikationen: Positive-Strand ...

Av lärosätet: Örebro universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se