WFRF:(Jesús Naveja J.)
Sökning: WFRF:(Jesús Naveja J.) > Conformal predictio...
- 2 av 2
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Norinder, Ulf,1956-Stockholms universitet,Institutionen för data- och systemvetenskap,Karolinska Institutet, Sweden (författare)
Conformal prediction of HDAC inhibitors
- Artikel/kapitelEngelska2019
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- Taylor & Francis,2019
- printrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:oru-83048
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-83048URI
- https://doi.org/10.1080/1062936X.2019.1591503DOI
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-169052URI
- http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:140777537URI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Forskningsfinansiär: Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologia (CONACyT), Grant Number: 282785
- The growing interest in epigenetic probes and drug discovery, as revealed by several epigenetic drugs in clinical use or in the lineup of the drug development pipeline, is boosting the generation of screening data. In order to maximize the use of structure-activity relationships there is a clear need to develop robust and accurate models to understand the underlying structure-activity relationship. Similarly, accurate models should be able to guide the rational screening of compound libraries. Herein we introduce a novel approach for epigenetic quantitative structure-activity relationship (QSAR) modelling using conformal prediction. As a case study, we discuss the development of models for 11 sets of inhibitors of histone deacetylases (HDACs), which are one of the major epigenetic target families that have been screened. It was found that all derived models, for every HDAC endpoint and all three significance levels, are valid with respect to predictions for the external test sets as well as the internal validation of the corresponding training sets. Furthermore, the efficiencies for the predictions are above 80% for most data sets and above 90% for four data sets at different significant levels. The findings of this work encourage prospective applications of conformal prediction for other epigenetic target data sets.
Ämnesord och genrebeteckningar
- NATURVETENSKAP Kemi hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Chemical Sciences hsv//eng
- NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences hsv//eng
- NATURVETENSKAP Geovetenskap och miljövetenskap hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Earth and Related Environmental Sciences hsv//eng
- NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
- conformal prediction
- epigenetic
- HDAC
- QSAR
- RDKit descriptors
- machine learning
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Jesús Naveja, J.Department of Pharmacy, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico; PECEM, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico; Department of Life Science Informatics, University of Bonn, Bonn, Germany (författare)
- Lopez-Lopez, EdgarDepartment of Pharmacy, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico (författare)
- Mucs, DánielUnit of Toxicology Sciences, Karolinska Institute, Södertälje, Sweden; Unit of Work Environment Toxicology, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden (författare)
- Medina-Franco, José L.Department of Pharmacy, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico (författare)
- Stockholms universitetInstitutionen för data- och systemvetenskap (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:SAR and QSAR in environmental research (Print): Taylor & Francis30:4, s. 265-2771062-936X1029-046X
Internetlänk
Hitta via bibliotek
- SAR and QSAR in environmental research (Print) (Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- 2 av 2
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Norinder, Ulf, 1 ...
- Jesús Naveja, J.
- Lopez-Lopez, Edg ...
- Mucs, Dániel
- Medina-Franco, J ...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Kemi
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Data och informa ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Geovetenskap och ...
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- Artiklar i publikationen
- SAR and QSAR in ...
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
