SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Salmen S)
 

Sökning: WFRF:(Salmen S) > (2015-2019) > Spatially resolved ...

  • Giacomello, StefaniaKTH,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stockholm University, Sweden,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Div Gene Technol, Sci Life Lab, S-17165 Solna, Sweden.;Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, S-17165 Solna, Sweden. (författare)

Spatially resolved transcriptome profiling in model plant species

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-05-08
  • Springer Science and Business Media LLC,2017
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-146004
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-146004URI
  • https://doi.org/10.1038/nplants.2017.61DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-138048URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-209734URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-331942URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:136276060URI
  • https://res.slu.se/id/publ/85288URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20170622
  • Understanding complex biological systems requires functional characterization of specialized tissue domains. However, existing strategies for generating and analysing high-throughput spatial expression profiles were developed for a limited range of organisms, primarily mammals. Here we present the first available approach to generate and study highresolution, spatially resolved functional profiles in a broad range of model plant systems. Our process includes highthroughput spatial transcriptome profiling followed by spatial gene and pathway analyses. We first demonstrate the feasibility of the technique by generating spatial transcriptome profiles from model angiosperms and gymnosperms microsections. In Arabidopsis thaliana we use the spatial data to identify differences in expression levels of 141 genes and 189 pathways in eight inflorescence tissue domains. Our combined approach of spatial transcriptomics and functional profiling offers a powerful new strategy that can be applied to a broad range of plant species, and is an approach that will be pivotal to answering fundamental questions in developmental and evolutionary biology.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Salmén, FredrikKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u1bw72vj (författare)
  • Terebieniec, Barbara K.,1983-Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umea Univ, Dept Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, S-90736 Umea, Sweden.(Swepub:umu)bate0003 (författare)
  • Vickovic, SanjaKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:kth)u10kfosu (författare)
  • Fernandez Navarro, JoséKarolinska Inst, Dept Cell & Mol Biol, S-17165 Solna, Sweden. (författare)
  • Alexeyenko, AndreyKarolinska Institutet (författare)
  • Reimegård, JohanUppsala universitet,Molekylär evolution,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)jorei499 (författare)
  • McKee, Lauren S.KTH,Glykovetenskap,KTH Royal Inst Technol, AlbaNova Univ Ctr, Sch Biotechnol, Div Glycosci, S-11421 Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1nbm728 (författare)
  • Mannapperuma, ChanakaUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umea Univ, Dept Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, S-90736 Umea, Sweden.(Swepub:umu)mach0027 (författare)
  • Bulone, VincentKTH,Glykovetenskap,University of Adelaide, Australia,KTH Royal Inst Technol, AlbaNova Univ Ctr, Sch Biotechnol, Div Glycosci, S-11421 Stockholm, Sweden.;Univ Adelaide, ARC Ctr Excellence Plant & Cell Walls, Waite Campus, Adelaide, SA 5064, Australia.;Univ Adelaide, Sch Agr Food & Wine, Waite Campus, Adelaide, SA 5064, Australia.(Swepub:kth)u13o1auq (författare)
  • Ståhl, Patrik L.Karolinska Inst, Dept Cell & Mol Biol, S-17165 Solna, Sweden. (författare)
  • Sundström, JensSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)46728 (författare)
  • Street, Nathaniel,1979-Umeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Institutionen för fysiologisk botanik,Umea Univ, Dept Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, S-90736 Umea, Sweden.(Swepub:umu)rona0006 (författare)
  • Lundeberg, JoakimKTH,Genteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Div Gene Technol, Sci Life Lab, S-17165 Solna, Sweden.(Swepub:kth)u1qkn9kw (författare)
  • Stockholms universitetInstitutionen för biokemi och biofysik (creator_code:org_t)
  • Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Plants: Springer Science and Business Media LLC3:62055-026X2055-0278

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy