Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-166644" >
NanoJ :
NanoJ : a high-performance open-source super-resolution microscopy toolbox
-
Laine, Romain F. (författare)
-
Tosheva, Kalina L. (författare)
-
Gustafsson, Nils (författare)
-
visa fler...
-
Gray, Robert D. M. (författare)
-
Almada, Pedro (författare)
-
Albrecht, David (författare)
-
Risa, Gabriel T. (författare)
-
- Hurtig, Fredrik (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
-
- Lindås, Ann-Christin (författare)
- Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
-
Baum, Buzz (författare)
-
Mercer, Jason (författare)
-
Leterrier, Christophe (författare)
-
Pereira, Pedro M. (författare)
-
Culley, Sian (författare)
-
Henriques, Ricardo (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-02-18
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Physics D. - : IOP Publishing. - 0022-3727 .- 1361-6463. ; 52:16
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Super-resolution microscopy (SRM) has become essential for the study of nanoscale biological processes. This type of imaging often requires the use of specialised image analysis tools to process a large volume of recorded data and extract quantitative information. In recent years, our team has built an open-source image analysis framework for SRM designed to combine high performance and ease of use. We named it NanoJ-a reference to the popular ImageJ software it was developed for. In this paper, we highlight the current capabilities of NanoJ for several essential processing steps: spatio-temporal alignment of raw data (NanoJ-Core), super-resolution image reconstruction (NanoJ-SRRF), image quality assessment (NanoJ-SQUIRREL), structural modelling (NanoJ-VirusMapper) and control of the sample environment (NanoJ-Fluidics). We expect to expand NanoJ in the future through the development of new tools designed to improve quantitative data analysis and measure the reliability of fluorescent microscopy studies.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- super-resolution microscopy
- ImageJ
- Fiji
- image analysis
- image quality assessment
- fluidics
- single-particle analysis
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- for (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Laine, Romain F.
-
Tosheva, Kalina ...
-
Gustafsson, Nils
-
Gray, Robert D. ...
-
Almada, Pedro
-
Albrecht, David
-
visa fler...
-
Risa, Gabriel T.
-
Hurtig, Fredrik
-
Lindås, Ann-Chri ...
-
Baum, Buzz
-
Mercer, Jason
-
Leterrier, Chris ...
-
Pereira, Pedro M ...
-
Culley, Sian
-
Henriques, Ricar ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Physi ...
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet