SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-179616"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-179616" > Docking Finds GPCR ...

  • Ballante, FlavioUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräkningsbiologi och bioinformatik (författare)

Docking Finds GPCR Ligands in Dark Chemical Matter

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-12-17
  • American Chemical Society (ACS),2020
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-179616
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-179616URI
  • https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.9b01560DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-406186URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • High-throughput screening has revealed dark chemical matter, a set of drug-like compounds that has never shown bioactivity despite being extensively assayed. If dark molecules are found active at a therapeutic target, their extraordinary selectivity profiles make excellent starting points for drug development. We explored if ligands of therapeutically relevant G-protein-coupled receptors could be discovered by structure-based virtual screening of the dark chemical matter. Molecular docking screens against crystal structures of the A(2A) adenosine and the D-4 dopamine receptors were carried out, and 53 top-ranked molecules were evaluated experimentally. Two ligands of each receptor were discovered, and the most potent had sub-micromolar affinities. Analysis of bioactivity data showed that the ligands lacked activity at hundreds of off-targets, including several that are associated with adverse effects. Our results demonstrate that virtual screening provides an efficient means to mine the dark chemical space, which could contribute to development of drugs with improved safety profiles.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Rudling, AxelStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, SE-10691 Stockholm, Sweden (författare)
  • Zeifman, AlexeyUppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Uppsala University, Sweden,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, SE-10691 Stockholm, Sweden(Swepub:su)azeif (författare)
  • Luttens, AndreasUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)andlu970 (författare)
  • Vo, Duc DuyUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ducvo101 (författare)
  • Irwin, John J.Univ Calif San Francisco, Dept Pharmaceut Chem, Byers Hall,1700 4th St, San Francisco, CA 94158 USA (författare)
  • Kihlberg, JanUppsala universitet,Organisk kemi(Swepub:uu)janki643 (författare)
  • Brea, JoseUniv Santiago de Compostela, Ctr Res Mol Med & Chron Dis, Innopharma Screening Platform BioFarma Res Grp, Santiago De Compostela 15706, Spain (författare)
  • Isabel Loza, MariaUniv Santiago de Compostela, Ctr Res Mol Med & Chron Dis, Innopharma Screening Platform BioFarma Res Grp, Santiago De Compostela 15706, Spain (författare)
  • Carlsson, JensUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräkningsbiologi och bioinformatik(Swepub:uu)jecar425 (författare)
  • Uppsala universitetScience for Life Laboratory, SciLifeLab (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of Medicinal Chemistry: American Chemical Society (ACS)63:2, s. 613-6200022-26231520-4804

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy