Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-179616" >
Docking Finds GPCR ...
-
Ballante, FlavioUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräkningsbiologi och bioinformatik
(författare)
Docking Finds GPCR Ligands in Dark Chemical Matter
- Artikel/kapitelEngelska2020
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2019-12-17
-
American Chemical Society (ACS),2020
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-179616
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-179616URI
-
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.9b01560DOI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-406186URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
High-throughput screening has revealed dark chemical matter, a set of drug-like compounds that has never shown bioactivity despite being extensively assayed. If dark molecules are found active at a therapeutic target, their extraordinary selectivity profiles make excellent starting points for drug development. We explored if ligands of therapeutically relevant G-protein-coupled receptors could be discovered by structure-based virtual screening of the dark chemical matter. Molecular docking screens against crystal structures of the A(2A) adenosine and the D-4 dopamine receptors were carried out, and 53 top-ranked molecules were evaluated experimentally. Two ligands of each receptor were discovered, and the most potent had sub-micromolar affinities. Analysis of bioactivity data showed that the ligands lacked activity at hundreds of off-targets, including several that are associated with adverse effects. Our results demonstrate that virtual screening provides an efficient means to mine the dark chemical space, which could contribute to development of drugs with improved safety profiles.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Rudling, AxelStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, SE-10691 Stockholm, Sweden
(författare)
-
Zeifman, AlexeyUppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Uppsala University, Sweden,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, SE-10691 Stockholm, Sweden(Swepub:su)azeif
(författare)
-
Luttens, AndreasUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)andlu970
(författare)
-
Vo, Duc DuyUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ducvo101
(författare)
-
Irwin, John J.Univ Calif San Francisco, Dept Pharmaceut Chem, Byers Hall,1700 4th St, San Francisco, CA 94158 USA
(författare)
-
Kihlberg, JanUppsala universitet,Organisk kemi(Swepub:uu)janki643
(författare)
-
Brea, JoseUniv Santiago de Compostela, Ctr Res Mol Med & Chron Dis, Innopharma Screening Platform BioFarma Res Grp, Santiago De Compostela 15706, Spain
(författare)
-
Isabel Loza, MariaUniv Santiago de Compostela, Ctr Res Mol Med & Chron Dis, Innopharma Screening Platform BioFarma Res Grp, Santiago De Compostela 15706, Spain
(författare)
-
Carlsson, JensUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräkningsbiologi och bioinformatik(Swepub:uu)jecar425
(författare)
-
Uppsala universitetScience for Life Laboratory, SciLifeLab
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Journal of Medicinal Chemistry: American Chemical Society (ACS)63:2, s. 613-6200022-26231520-4804
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ballante, Flavio
-
Rudling, Axel
-
Zeifman, Alexey
-
Luttens, Andreas
-
Vo, Duc Duy
-
Irwin, John J.
-
visa fler...
-
Kihlberg, Jan
-
Brea, Jose
-
Isabel Loza, Mar ...
-
Carlsson, Jens
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Farmaceutiska ve ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Läkemedelskemi
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Medic ...
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet
-
Uppsala universitet