Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-183662" >
Cartography of oppo...
-
Chng, Kern Rei
(författare)
Cartography of opportunistic pathogens and antibiotic resistance genes in a tertiary hospital environment
- Artikel/kapitelEngelska2020
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2020-06-08
-
Springer Science and Business Media LLC,2020
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-183662
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-183662URI
-
https://doi.org/10.1038/s41591-020-0894-4DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Although disinfection is key to infection control, the colonization patterns and resistomes of hospital-environment microbes remain underexplored. We report the first extensive genomic characterization of microbiomes, pathogens and antibiotic resistance cassettes in a tertiary-care hospital, from repeated sampling (up to 1.5 years apart) of 179 sites associated with 45 beds. Deep shotgun metagenomics unveiled distinct ecological niches of microbes and antibiotic resistance genes characterized by biofilm-forming and human-microbiome-influenced environments with corresponding patterns of spatiotemporal divergence. Quasi-metagenomics with nanopore sequencing provided thousands of high-contiguity genomes, phage and plasmid sequences (>60% novel), enabling characterization of resistome and mobilome diversity and dynamic architectures in hospital environments. Phylogenetics identified multidrug-resistant strains as being widely distributed and stably colonizing across sites. Comparisons with clinical isolates indicated that such microbes can persist in hospitals for extended periods (>8 years), to opportunistically infect patients. These findings highlight the importance of characterizing antibiotic resistance reservoirs in hospitals and establish the feasibility of systematic surveys to target resources for preventing infections. Spatiotemporal characterization of microbial diversity and antibiotic resistance in a tertiary-care hospital reveals broad distribution and persistence of antibiotic-resistant organisms that could cause opportunistic infections in a healthcare setting.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Li, Chenhao
(författare)
-
Bertrand, Denis
(författare)
-
Ng, Amanda Hui Qi
(författare)
-
Kwah, Junmei Samantha
(författare)
-
Low, Hwee Meng
(författare)
-
Tong, Chengxuan
(författare)
-
Natrajan, Maanasa
(författare)
-
Zhang, Michael Hongjie
(författare)
-
Xu, Licheng
(författare)
-
Ko, Karrie Kwan Ki
(författare)
-
Ho, Eliza Xin Pei
(författare)
-
Av-Shalom, Tamar
(författare)
-
Teo, Jeanette Woon Pei
(författare)
-
Khor, Chiea Chuen
(författare)
-
Chen, Swaine L.
(författare)
-
Mason, Christopher E.
(författare)
-
Ng, Oon Tek
(författare)
-
Marimuthu, Kalisvar
(författare)
-
Ang, Brenda
(författare)
-
Nagarajan, Niranjan
(författare)
-
Danko, David
(författare)
-
Bezdan, Daniela
(författare)
-
Afshinnekoo, Ebrahim
(författare)
-
Ahsanuddin, Sofia
(författare)
-
Bhattacharya, Chandrima
(författare)
-
Butler, Daniel J.
(författare)
-
De Filippis, Francesca
(författare)
-
Hecht, Jochen
(författare)
-
Kahles, Andre
(författare)
-
Karasikov, Mikhail
(författare)
-
Kyrpides, Nikos C.
(författare)
-
Leung, Marcus H. Y.
(författare)
-
Meleshko, Dmitry
(författare)
-
Mustafa, Harun
(författare)
-
Mutai, Beth
(författare)
-
Neches, Russell Y.
(författare)
-
Ng, Amanda
(författare)
-
Nieto-Caballero, Marina
(författare)
-
Nikolayeva, Olga
(författare)
-
Nikolayeva, Tatyana
(författare)
-
Png, Eileen
(författare)
-
Sanchez, Jorge L.
(författare)
-
Shaaban, Heba
(författare)
-
Sierra, Maria A.
(författare)
-
Tong, Xinzhao
(författare)
-
Young, Ben
(författare)
-
Alicea, Josue
(författare)
-
Bhattacharyya, Malay
(författare)
-
Blekhman, Ran
(författare)
-
Castro-Nallar, Eduardo
(författare)
-
Canas, Ana M.
(författare)
-
Chatziefthimiou, Aspassia D.
(författare)
-
Crawford, Robert W.
(författare)
-
Deng, Youping
(författare)
-
Desnues, Christelle
(författare)
-
Dias-Neto, Emmanuel
(författare)
-
Donnellan, Daisy
(författare)
-
Dybwad, Marius
(författare)
-
Elhaik, Eran
(författare)
-
Ercolini, Danilo
(författare)
-
Frolova, Alina
(författare)
-
Graf, Alexandra B.
(författare)
-
Green, David C.
(författare)
-
Hajirasouliha, Iman
(författare)
-
Hernandez, Mark
(författare)
-
Iraola, Gregorio
(författare)
-
Jang, Soojin
(författare)
-
Jones, Angela
(författare)
-
Kelly, Frank J.
(författare)
-
Knights, Kaymisha
(författare)
-
Labaj, Pawel P.
(författare)
-
Lee, Patrick K. H.
(författare)
-
Shawn, Levy
(författare)
-
Ljungdahl, PerStockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut(Swepub:su)pelju
(författare)
-
Lyons, Abigail
(författare)
-
Mason-Buck, Gabriella
(författare)
-
McGrath, Ken
(författare)
-
Mongodin, Emmanuel F.
(författare)
-
Moraes, Milton Ozorio
(författare)
-
Noushmehr, Houtan
(författare)
-
Oliveira, Manuela
(författare)
-
Ossowski, Stephan
(författare)
-
Osuolale, Olayinka O.
(författare)
-
Ozcan, Orhan
(författare)
-
Paez-Espino, David
(författare)
-
Rascovan, Nicolas
(författare)
-
Richard, Hugues
(författare)
-
Raetsch, Gunnar
(författare)
-
Schriml, Lynn M.
(författare)
-
Semmler, Torsten
(författare)
-
Sezerman, Osman U.
(författare)
-
Shi, Leming
(författare)
-
Song, Le Huu
(författare)
-
Suzuki, Haruo
(författare)
-
Court, Denise Syndercombe
(författare)
-
Thomas, Dominique
(författare)
-
Tighe, Scott W.
(författare)
-
Udekwu, KlasStockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut(Swepub:su)kudek
(författare)
-
Ugalde, Juan A.
(författare)
-
Valentine, Brandon
(författare)
-
Vassilev, Dimitar
(författare)
-
Vayndorf, Elena
(författare)
-
Velavan, Thirumalaisamy P.
(författare)
-
Zambrano, Maria M.
(författare)
-
Zhu, Jifeng
(författare)
-
Zhu, Sibo
(författare)
-
Mason, Christopher E.
(författare)
-
Stockholms universitetInstitutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Medicine: Springer Science and Business Media LLC26, s. 941-9511078-89561546-170X
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Chng, Kern Rei
-
Li, Chenhao
-
Bertrand, Denis
-
Ng, Amanda Hui Q ...
-
Kwah, Junmei Sam ...
-
Low, Hwee Meng
-
visa fler...
-
Tong, Chengxuan
-
Natrajan, Maanas ...
-
Zhang, Michael H ...
-
Xu, Licheng
-
Ko, Karrie Kwan ...
-
Ho, Eliza Xin Pe ...
-
Av-Shalom, Tamar
-
Teo, Jeanette Wo ...
-
Khor, Chiea Chue ...
-
Chen, Swaine L.
-
Mason, Christoph ...
-
Ng, Oon Tek
-
Marimuthu, Kalis ...
-
Ang, Brenda
-
Nagarajan, Niran ...
-
Danko, David
-
Bezdan, Daniela
-
Afshinnekoo, Ebr ...
-
Ahsanuddin, Sofi ...
-
Bhattacharya, Ch ...
-
Butler, Daniel J ...
-
De Filippis, Fra ...
-
Hecht, Jochen
-
Kahles, Andre
-
Karasikov, Mikha ...
-
Kyrpides, Nikos ...
-
Leung, Marcus H. ...
-
Meleshko, Dmitry
-
Mustafa, Harun
-
Mutai, Beth
-
Neches, Russell ...
-
Ng, Amanda
-
Nieto-Caballero, ...
-
Nikolayeva, Olga
-
Nikolayeva, Taty ...
-
Png, Eileen
-
Sanchez, Jorge L ...
-
Shaaban, Heba
-
Sierra, Maria A.
-
Tong, Xinzhao
-
Young, Ben
-
Alicea, Josue
-
Bhattacharyya, M ...
-
Blekhman, Ran
-
Castro-Nallar, E ...
-
Canas, Ana M.
-
Chatziefthimiou, ...
-
Crawford, Robert ...
-
Deng, Youping
-
Desnues, Christe ...
-
Dias-Neto, Emman ...
-
Donnellan, Daisy
-
Dybwad, Marius
-
Elhaik, Eran
-
Ercolini, Danilo
-
Frolova, Alina
-
Graf, Alexandra ...
-
Green, David C.
-
Hajirasouliha, I ...
-
Hernandez, Mark
-
Iraola, Gregorio
-
Jang, Soojin
-
Jones, Angela
-
Kelly, Frank J.
-
Knights, Kaymish ...
-
Labaj, Pawel P.
-
Lee, Patrick K. ...
-
Shawn, Levy
-
Ljungdahl, Per
-
Lyons, Abigail
-
Mason-Buck, Gabr ...
-
McGrath, Ken
-
Mongodin, Emmanu ...
-
Moraes, Milton O ...
-
Noushmehr, Houta ...
-
Oliveira, Manuel ...
-
Ossowski, Stepha ...
-
Osuolale, Olayin ...
-
Ozcan, Orhan
-
Paez-Espino, Dav ...
-
Rascovan, Nicola ...
-
Richard, Hugues
-
Raetsch, Gunnar
-
Schriml, Lynn M.
-
Semmler, Torsten
-
Sezerman, Osman ...
-
Shi, Leming
-
Song, Le Huu
-
Suzuki, Haruo
-
Court, Denise Sy ...
-
Thomas, Dominiqu ...
-
Tighe, Scott W.
-
Udekwu, Klas
-
Ugalde, Juan A.
-
Valentine, Brand ...
-
Vassilev, Dimita ...
-
Vayndorf, Elena
-
Velavan, Thiruma ...
-
Zambrano, Maria ...
-
Zhu, Jifeng
-
Zhu, Sibo
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Infektionsmedici ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Medicine
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet