SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Atia Mohamed A. M.)
 

Sökning: WFRF:(Atia Mohamed A. M.) > (2021) > In Silico Mining of...

  • Ibrahim, Mahmoud A. A. (författare)

In Silico Mining of Terpenes from Red-Sea Invertebrates for SARS-CoV-2 Main Protease (M-pro) Inhibitors

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2021-04-05
  • MDPI AG,2021
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-194363
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-194363URI
  • https://doi.org/10.3390/molecules26072082DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent for the COVID-19 pandemic, which generated more than 1.82 million deaths in 2020 alone, in addition to 83.8 million infections. Currently, there is no antiviral medication to treat COVID-19. In the search for drug leads, marine-derived metabolites are reported here as prospective SARS-CoV-2 inhibitors. Two hundred and twenty-seven terpene natural products isolated from the biodiverse Red-Sea ecosystem were screened for inhibitor activity against the SARS-CoV-2 main protease (M-pro) using molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations combined with molecular mechanics/generalized Born surface area binding energy calculations. On the basis of in silico analyses, six terpenes demonstrated high potency as M-pro inhibitors with Delta G(binding) <= -40.0 kcal/mol. The stability and binding affinity of the most potent metabolite, erylosides B, were compared to the human immunodeficiency virus protease inhibitor, lopinavir. Erylosides B showed greater binding affinity towards SARS-CoV-2 M-pro than lopinavir over 100 ns with Delta G(binding) values of -51.9 vs. -33.6 kcal/mol, respectively. Protein-protein interactions indicate that erylosides B biochemical signaling shares gene components that mediate severe acute respiratory syndrome diseases, including the cytokine- and immune-signaling components BCL2L1, IL2, and PRKC. Pathway enrichment analysis and Boolean network modeling were performed towards a deep dissection and mining of the erylosides B target-function interactions. The current study identifies erylosides B as a promising anti-COVID-19 drug lead that warrants further in vitro and in vivo testing.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Abdelrahman, Alaa H. M. (författare)
  • Mohamed, Tarik A. (författare)
  • Atia, Mohamed A. M. (författare)
  • Al-Hammady, Montaser A. M. (författare)
  • Abdeljawaad, Khlood A. A. (författare)
  • Elkady, Eman M. (författare)
  • Moustafa, Mahmoud F. (författare)
  • Alrumaihi, Faris (författare)
  • Allemailem, Khaled S. (författare)
  • El-Seedi, Hesham R.Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,El-Menoufia University, Egypt; Jiangsu University, China(Swepub:su)heel9493 (författare)
  • Paré, Paul W. (författare)
  • Efferth, Thomas (författare)
  • Hegazy, Mohamed-Elamir F. (författare)
  • Stockholms universitetInstitutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Molecules: MDPI AG26:71431-51571420-3049

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Molecules (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy