A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Oliveira Manuela) > A global metagenomi...

Danko, DavidWeill Cornell Medicine (författare)

A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance

Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier BV,2021
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-196175
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-196175URI
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.05.002DOI
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:147016894URI
https://lup.lub.lu.se/record/7304c899-1454-4879-92fc-774e334c8248URI
https://res.slu.se/id/publ/113028URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

We present a global atlas of 4,728 metagenomic samples from mass-transit systems in 60 cities over 3 years, representing the first systematic, worldwide catalog of the urban microbial ecosystem. This atlas provides an annotated, geospatial profile of microbial strains, functional characteristics, antimicrobial resistance (AMR) markers, and genetic elements, including 10,928 viruses, 1,302 bacteria, 2 archaea, and 838,532 CRISPR arrays not found in reference databases. We identified 4,246 known species of urban microorganisms and a consistent set of 31 species found in 97% of samples that were distinct from human commensal organisms. Profiles of AMR genes varied widely in type and density across cities. Cities showed distinct microbial taxonomic signatures that were driven by climate and geographic differences. These results constitute a high-resolution global metagenomic atlas that enables discovery of organisms and genes, highlights potential public health and forensic applications, and provides a culture-independent view of AMR burden in cities.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Mikrobiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Microbiology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Bioinformatik och systembiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Bioinformatics and Systems Biology hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Bezdan, DanielaUniversity Hospital of Tubingen (författare)
Elhaik, EranLund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Bioinformatik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science,Bioinformatics,Lund University Research Groups,Weill Cornell Medicine(Swepub:lu)er2374el (författare)
Ahsanuddin, SofiaIcahn School of Medicine at Mount Sinai (författare)
Bhattacharya, Chandrima (författare)
Butler, Daniel J.Weill Cornell Medicine Feil Family Brain & Mind Research Institute (författare)
Chng, Kern ReiA*Star, Genome Institute of Singapore (GIS) (författare)
Donnellan, DaisyWeill Cornell Medicine (författare)
Hecht, JochenBarcelona Institute of Science and Technology (författare)
Jackson, KatelynWeill Cornell Medicine (författare)
Kuchin, KaterinaWeill Cornell Medicine (författare)
Karasikov, MikhailChildren's University Hospital, Zurich (författare)
Lyons, AbigailWeill Cornell Medicine (författare)
Mak, LaurenWeill Cornell Medicine (författare)
Meleshko, DmitryWeill Cornell Medicine (författare)
Mustafa, HarunChildren's University Hospital, Zurich (författare)
Mutai, BethKenya Medical Research Institute - Kisumu (författare)
Neches, Russell Y.Joint Genome Institute (JGI) (författare)
Ng, AmandaA*Star, Genome Institute of Singapore (GIS) (författare)
Nikolayeva, OlgaIndependent Researcher (författare)
Nikolayeva, TatyanaIndependent Researcher (författare)
Png, EileenA*Star, Genome Institute of Singapore (GIS) (författare)
Ryon, Krista A.Weill Cornell Medicine (författare)
Sanchez, Jorge L.Weill Cornell Medicine (författare)
Shaaban, HebaWeill Cornell Medicine (författare)
Sierra, Maria A.Weill Cornell Medicine (författare)
Thomas, DominiqueWeill Cornell Medicine (författare)
Young, BenWeill Cornell Medicine (författare)
Abudayyeh, Omar O.Massachusetts Institute of Technology (författare)
Alicea, JosueWeill Cornell Medicine (författare)
Bhattacharyya, MalayIndian Statistical Institute, Kolkata (författare)
Blekhman, RanUniversity of Minnesota (författare)
Castro-Nallar, EduardoAndrés Bello National University (författare)
Cañas, Ana M.Weill Cornell Medicine (författare)
Chatziefthimiou, Aspassia D. (författare)
Crawford, Robert W.California State University (författare)
De Filippis, FrancescaUniversity of Naples Federico II (författare)
Deng, YoupingUniversity of Hawai'i at Hilo (författare)
Desnues, ChristelleMediterranean Institute of Oceanography, Marseille (författare)
Dias-Neto, EmmanuelA. C. Camargo Cancer Center (författare)
Dybwad, MariusNorwegian Defence Research Establishment (författare)
Elhaik, Eran (författare)
Ercolini, DaniloUniversity of Naples Federico II (författare)
Frolova, AlinaKyiv Academic University (författare)
Gankin, DennisMassachusetts Institute of Technology (författare)
Gootenberg, Jonathan S.Massachusetts Institute of Technology (författare)
Graf, Alexandra B.University of Vienna (författare)
Green, David C.King's College London (författare)
Hajirasouliha, ImanWeill Cornell Medicine (författare)
Hastings, Jaden J. A. (författare)
Hernandez, Mark (författare)
Iraola, Gregorio (författare)
Jang, Soojin (författare)
Kahles, Andre (författare)
Kelly, Frank J. (författare)
Knights, Kaymisha (författare)
Kyrpides, Nikos C. (författare)
Łabaj, Paweł P. (författare)
Lee, Patrick K. H. (författare)
Leung, Marcus H. Y. (författare)
Ljungdahl, Per O.Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut(Swepub:su)pelju (författare)
Mason-Buck, Gabriella (författare)
McGrath, Ken (författare)
Meydan, Cem (författare)
Mongodin, Emmanuel F. (författare)
Moraes, Milton Ozorio (författare)
Nagarajan, Niranjan (författare)
Nieto-Caballero, Marina (författare)
Noushmehr, Houtan (författare)
Oliveira, Manuela (författare)
Ossowski, Stephan (författare)
Osuolale, Olayinka O. (författare)
Özcan, Orhan (författare)
Paez-Espino, David (författare)
Rascovan, Nicolás (författare)
Richard, Hugues (författare)
Rätsch, Gunnar (författare)
Schriml, Lynn M. (författare)
Semmler, Torsten (författare)
Sezerman, Osman U. (författare)
Shi, Leming (författare)
Shi, Tieliu (författare)
Siam, Rania (författare)
Song, Le Huu (författare)
Suzuki, Haruo (författare)
Court, Denise Syndercombe (författare)
Tighe, Scott W. (författare)
Tong, Xinzhao (författare)
Udekwu, KlasSveriges lantbruksuniversitet,Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Swedish University of Agricultural Sciences, Sweden,Institutionen för vatten och miljö,Department of Aquatic Sciences and Assessment,Stockholm University(Swepub:su)kudek (författare)
Ugalde, Juan A. (författare)
Valentine, Brandon (författare)
Vassilev, Dimitar (författare)
Vayndorf, Elena M. (författare)
Velavan, Thirumalaisamy P. (författare)
Wu, JunEast China Normal University (författare)
Zambrano, Maria M. (författare)
Zhu, Jifeng (författare)
Zhu, Sibo (författare)
Mason, Christopher E. (författare)
Weill Cornell MedicineUniversity Hospital of Tubingen (creator_code:org_t)
Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

Ingår i:Cell: Elsevier BV184:13, s. 3376-33930092-86741097-4172

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Cell (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Danko, David; Bezdan, Daniela; Elhaik, Eran; Ahsanuddin, Sofi ...; Bhattacharya, Ch ...; Butler, Daniel J ...; visa fler...; Chng, Kern Rei; Donnellan, Daisy; Hecht, Jochen; Jackson, Katelyn; Kuchin, Katerina; Karasikov, Mikha ...; Lyons, Abigail; Mak, Lauren; Meleshko, Dmitry; Mustafa, Harun; Mutai, Beth; Neches, Russell ...; Ng, Amanda; Nikolayeva, Olga; Nikolayeva, Taty ...; Png, Eileen; Ryon, Krista A.; Sanchez, Jorge L ...; Shaaban, Heba; Sierra, Maria A.; Thomas, Dominiqu ...; Young, Ben; Abudayyeh, Omar ...; Alicea, Josue; Bhattacharyya, M ...; Blekhman, Ran; Castro-Nallar, E ...; Cañas, Ana M.; Chatziefthimiou, ...; Crawford, Robert ...; De Filippis, Fra ...; Deng, Youping; Desnues, Christe ...; Dias-Neto, Emman ...; Dybwad, Marius; Ercolini, Danilo; Frolova, Alina; Gankin, Dennis; Gootenberg, Jona ...; Graf, Alexandra ...; Green, David C.; Hajirasouliha, I ...; Hastings, Jaden ...; Hernandez, Mark; Iraola, Gregorio; Jang, Soojin; Kahles, Andre; Kelly, Frank J.; Knights, Kaymish ...; Kyrpides, Nikos ...; Łabaj, Paweł P.; Lee, Patrick K. ...; Leung, Marcus H. ...; Ljungdahl, Per O ...; Mason-Buck, Gabr ...; McGrath, Ken; Meydan, Cem; Mongodin, Emmanu ...; Moraes, Milton O ...; Nagarajan, Niran ...; Nieto-Caballero, ...; Noushmehr, Houta ...; Oliveira, Manuel ...; Ossowski, Stepha ...; Osuolale, Olayin ...; Özcan, Orhan; Paez-Espino, Dav ...; Rascovan, Nicolá ...; Richard, Hugues; Rätsch, Gunnar; Schriml, Lynn M.; Semmler, Torsten; Sezerman, Osman ...; Shi, Leming; Shi, Tieliu; Siam, Rania; Song, Le Huu; Suzuki, Haruo; Court, Denise Sy ...; Tighe, Scott W.; Tong, Xinzhao; Udekwu, Klas; Ugalde, Juan A.; Valentine, Brand ...; Vassilev, Dimita ...; Vayndorf, Elena ...; Velavan, Thiruma ...; Wu, Jun; Zambrano, Maria ...; Zhu, Jifeng; Zhu, Sibo; Mason, Christoph ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Bioinformatik oc ...

Artiklar i publikationen: Cell

Av lärosätet: Stockholms universitet; Karolinska Institutet; Lunds universitet; Sveriges Lantbruksuniversitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se