SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Sandström Kristian)
 

Sökning: WFRF:(Sandström Kristian) > (2020-2024) > Ultralarge Virtual ...

  • Luttens, AndreasUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab (författare)

Ultralarge Virtual Screening Identifies SARS-CoV-2 Main Protease Inhibitors with Broad-Spectrum Activity against Coronaviruses

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-02-10
  • American Chemical Society (ACS),2022
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-203560
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-203560URI
  • https://doi.org/10.1021/jacs.1c08402DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-470953URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:149090024URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Drugs targeting SARS-CoV-2 could have saved millions of lives during the COVID-19 pandemic, and it is now crucial to develop inhibitors of coronavirus replication in preparation for future outbreaks. We explored two virtual screening strategies to find inhibitors of the SARS-CoV-2 main protease in ultralarge chemical libraries. First, structure-based docking was used to screen a diverse library of 235 million virtual compounds against the active site. One hundred top-ranked compounds were tested in binding and enzymatic assays. Second, a fragment discovered by crystallographic screening was optimized guided by docking of millions of elaborated molecules and experimental testing of 93 compounds. Three inhibitors were identified in the first library screen, and five of the selected fragment elaborations showed inhibitory effects. Crystal structures of target-inhibitor complexes confirmed docking predictions and guided hit-to-lead optimization, resulting in a noncovalent main protease inhibitor with nanomolar affinity, a promising in vitro pharmacokinetic profile, and broad-spectrum antiviral effect in infected cells.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Gullberg, HjalmarStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Sci Life Lab, Biochem & Cellular Assay Facil, Drug Discovery & Dev Platform,Dept Biochem & Biop, SE-17121 Stockholm, Sweden.(Swepub:su)hjgu0927 (författare)
  • Abdurakhmanov, Eldar,1977-Uppsala universitet,Biokemi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)eldab338 (författare)
  • Duy, Duc (författare)
  • Akaberi, DarioUppsala universitet,Klinisk mikrobiologi,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)darak673 (författare)
  • Talibov, Vladimir O.Max IV Lab, BioMax Beamline, SE-22484 Lund, Sweden. (författare)
  • Nekhotiaeva, NataliaStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Sci Life Lab, Biochem & Cellular Assay Facil, Drug Discovery & Dev Platform,Dept Biochem & Biop, SE-17121 Stockholm, Sweden.(Swepub:su)nnekh (författare)
  • Vangeel, LauraKatholieke Univ Leuven, Dept Microbiol Immunol & Transplantat, Rega Inst, Lab Virol & Chemotherapy, B-3000 Leuven, Belgium.;Global Virus Network, Baltimore, MD 21201 USA. (författare)
  • De Jonghe, StevenKatholieke Univ Leuven, Dept Microbiol Immunol & Transplantat, Rega Inst, Lab Virol & Chemotherapy, B-3000 Leuven, Belgium.;Global Virus Network, Baltimore, MD 21201 USA. (författare)
  • Jochmans, DirkKatholieke Univ Leuven, Dept Microbiol Immunol & Transplantat, Rega Inst, Lab Virol & Chemotherapy, B-3000 Leuven, Belgium.;Global Virus Network, Baltimore, MD 21201 USA. (författare)
  • Krambrich, JaninaUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)jankr830 (författare)
  • Tas, AliLeiden Univ, Dept Med Microbiol, Med Ctr, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands. (författare)
  • Lundgren, BoStockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Stockholm Univ, Sci Life Lab, Biochem & Cellular Assay Facil, Drug Discovery & Dev Platform,Dept Biochem & Biop, SE-17121 Stockholm, Sweden.(Swepub:su)bolu7255 (författare)
  • Gravenfors, YlvaStockholms universitet,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för organisk kemi,Stockholm Univ, Dept Organ Chem, Sci Life Lab, Drug Discovery & Dev Platform, SE-17121 Stockholm, Sweden.(Swepub:su)ylgr1107 (författare)
  • Craig, Alexander J.Uppsala universitet,Läkemedelsdesign och läkemedelsutveckling(Swepub:uu)alecr417 (författare)
  • Atilaw, YosephUppsala universitet,Organisk kemi(Swepub:uu)yosat333 (författare)
  • Sandström, Anja,1973-Uppsala universitet,Läkemedelsdesign och läkemedelsutveckling(Swepub:uu)anjajoha (författare)
  • Moodie, Lindon W. K.Uppsala universitet,Läkemedelsdesign och läkemedelsutveckling(Swepub:uu)linmo351 (författare)
  • Lundkvist, ÅkeUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Klinisk mikrobiologi(Swepub:uu)akelu185 (författare)
  • van Hemert, Martijn J.Leiden Univ, Dept Med Microbiol, Med Ctr, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands. (författare)
  • Neyts, JohanKatholieke Univ Leuven, Dept Microbiol Immunol & Transplantat, Rega Inst, Lab Virol & Chemotherapy, B-3000 Leuven, Belgium.;Global Virus Network, Baltimore, MD 21201 USA. (författare)
  • Lennerstrand, JohanUppsala universitet,Klinisk mikrobiologi(Swepub:uu)jolen839 (författare)
  • Kihlberg, JanUppsala universitet,Organisk kemi(Swepub:uu)janki643 (författare)
  • Sandberg, KristianUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Karolinska Inst, Dept Physiol & Pharmacol, SE-17177 Stockholm, Sweden.(Swepub:uu)krisa107 (författare)
  • Danielson, U. Helena,Professor,1959-Uppsala universitet,Biokemi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)helenads (författare)
  • Carlsson, JensUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för läkemedelskemi,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Uppsala Univ, Dept Cell & Mol Biol, Sci Life Lab, SE-75124 Uppsala, Sweden.(Swepub:uu)jecar425 (författare)
  • Uppsala universitetBeräkningsbiologi och bioinformatik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of the American Chemical Society: American Chemical Society (ACS)144:7, s. 2905-29200002-78631520-5126

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy