Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:su-204489" >
PathwAX II :
-
Ogris, Christoph,1985-Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Helmholtz Center Munich, Germany
(författare)
PathwAX II : network-based pathway analysis with interactive visualization of network crosstalk
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2022-03-10
-
Oxford University Press (OUP),2022
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-204489
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-204489URI
-
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac153DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Motivation: Pathway annotation tools are indispensable for the interpretation of a wide range of experiments in life sciences. Network-based algorithms have recently been developed which are more sensitive than traditional overlap-based algorithms, but there is still a lack of good online tools for network-based pathway analysis. Results: We present PathwAX II-a pathway analysis web tool based on network crosstalk analysis using the BinoX algorithm. It offers several new features compared with the first version, including interactive graphical network visualization of the crosstalk between a query gene set and an enriched pathway, and the addition of Reactome pathways.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Castresana-Aguirre, Miguel,1991-Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)(Swepub:su)mcast
(författare)
-
Sonnhammer, Erik L. L.Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)(Swepub:su)esonn
(författare)
-
Stockholms universitetInstitutionen för biokemi och biofysik
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Bioinformatics: Oxford University Press (OUP)38:9, s. 2659-26601367-48031367-48111460-2059
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas