Sökning: WFRF:(Messa Matteo 1988 ) >
Single molecule ana...
Single molecule analysis of combinatorial splicing
-
- Conze, Tim, 1977- (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Landegren
-
- Göransson, Jenny (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Nilsson
-
- Razzaghian, Hamidreza (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
-
visa fler...
-
- Ericsson, Olle (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
-
- Öberg, Daniel (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Akusjärvi
-
- Akusjärvi, Göran (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Akusjärvi
-
- Landegren, Ulf (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Landegren
-
- Nilsson, Mats (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Nilsson
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2010-06-29
- 2010
- Engelska.
-
Ingår i: Nucleic Acids Research. - : Oxford University Press (OUP). - 0305-1048 .- 1362-4962. ; 38:16, s. e163-
- Relaterad länk:
-
https://academic.oup...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Alternative splicing forms diverse mRNA isoform populations from a single ancestral pre-mRNA and thereby enhances complexity of transcript structure and of gene function. We describe a method called spliceotyping, which translates combinatorial mRNA splicing patterns into a library of binary strings of nucleic acid tags, encoding the exon composition of transcripts. The transcript abundance is registered by counts of individual molecules and individual exon inclusion patterns are represented as strings of binary data. The technique is illustrated by analyzing the splicing patterns of the adenovirus early 1A gene and the beta actin reference transcript. The method permits different genes to be analyzed in parallel and will be valuable for elucidating the complex effects of combinatorial splicing.
Nyckelord
- Splicing
- Combinatorial
- RCA
- Single molecule
- Amplified Single Molecule Detection
- MEDICINE
- MEDICIN
- Molekylär medicin
- Molecular Medicine
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas