Genome-wide and fine-resolution association analysis of malaria in West Africa.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Donnelly Peter J.) > Stockholms universitet > Genome-wide and fin...

4 av 4
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Jallow, Muminatou (författare)

Genome-wide and fine-resolution association analysis of malaria in West Africa.

Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2009-05-24
Springer Science and Business Media LLC,2009
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:su-33026
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-33026URI
https://doi.org/10.1038/ng.388DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

81 författare totalt
We report a genome-wide association (GWA) study of severe malaria in The Gambia. The initial GWA scan included 2,500 children genotyped on the Affymetrix 500K GeneChip, and a replication study included 3,400 children. We used this to examine the performance of GWA methods in Africa. We found considerable population stratification, and also that signals of association at known malaria resistance loci were greatly attenuated owing to weak linkage disequilibrium (LD). To investigate possible solutions to the problem of low LD, we focused on the HbS locus, sequencing this region of the genome in 62 Gambian individuals and then using these data to conduct multipoint imputation in the GWA samples. This increased the signal of association, from P = 4 x 10(-7) to P = 4 x 10(-14), with the peak of the signal located precisely at the HbS causal variant. Our findings provide proof of principle that fine-resolution multipoint imputation, based on population-specific sequencing data, can substantially boost authentic GWA signals and enable fine mapping of causal variants in African populations.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Teo, Yik Ying (författare)
Small, Kerrin S (författare)
Rockett, Kirk A (författare)
Deloukas, Panos (författare)
Clark, Taane G (författare)
Kivinen, Katja (författare)
Bojang, Kalifa A (författare)
Conway, David J (författare)
Pinder, Margaret (författare)
Sirugo, Giorgio (författare)
Sisay-Joof, Fatou (författare)
Usen, Stanley (författare)
Auburn, Sarah (författare)
Bumpstead, Suzannah J (författare)
Campino, Susana (författare)
Coffey, Alison (författare)
Dunham, Andrew (författare)
Fry, Andrew E (författare)
Green, Angela (författare)
Gwilliam, Rhian (författare)
Hunt, Sarah E (författare)
Inouye, Michael (författare)
Jeffreys, Anna E (författare)
Mendy, Alieu (författare)
Palotie, Aarno (författare)
Potter, Simon (författare)
Ragoussis, Jiannis (författare)
Rogers, Jane (författare)
Rowlands, Kate (författare)
Somaskantharajah, Elilan (författare)
Whittaker, Pamela (författare)
Widden, Claire (författare)
Donnelly, Peter (författare)
Howie, Bryan (författare)
Marchini, Jonathan (författare)
Morris, Andrew (författare)
Sanjoaquin, Miguel (författare)
Achidi, Eric Akum (författare)
Agbenyega, Tsiri (författare)
Allen, Angela (författare)
Amodu, Olukemi (författare)
Corran, Patrick (författare)
Djimde, Abdoulaye (författare)
Dolo, Amagana (författare)
Doumbo, Ogobara K (författare)
Drakeley, Chris (författare)
Dunstan, Sarah (författare)
Evans, Jennifer (författare)
Farrar, Jeremy (författare)
Fernando, Deepika (författare)
Hien, Tran Tinh (författare)
Horstmann, Rolf D (författare)
Ibrahim, Muntaser (författare)
Karunaweera, Nadira (författare)
Kokwaro, Gilbert (författare)
Koram, Kwadwo A (författare)
Lemnge, Martha (författare)
Makani, Julie (författare)
Marsh, Kevin (författare)
Michon, Pascal (författare)
Modiano, David (författare)
Molyneux, Malcolm E (författare)
Mueller, Ivo (författare)
Parker, Michael (författare)
Peshu, Norbert (författare)
Plowe, Christopher V (författare)
Puijalon, Odile (författare)
Reeder, John (författare)
Reyburn, Hugh (författare)
Riley, Eleanor M (författare)
Sakuntabhai, Anavaj (författare)
Singhasivanon, Pratap (författare)
Sirima, Sodiomon (författare)
Tall, Adama (författare)
Taylor, Terrie E (författare)
Thera, Mahamadou (författare)
Troye-Blomberg, MaritaStockholms universitet,Avdelningen för immunologi(Swepub:su)marita (författare)
Williams, Thomas N (författare)
Wilson, Michael (författare)
Kwiatkowski, Dominic P (författare)
Stockholms universitetAvdelningen för immunologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC, s. 657-6651061-40361546-1718

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

4 av 4
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Jallow, Muminato ...; Teo, Yik Ying; Small, Kerrin S; Rockett, Kirk A; Deloukas, Panos; Clark, Taane G; visa fler...; Kivinen, Katja; Bojang, Kalifa A; Conway, David J; Pinder, Margaret; Sirugo, Giorgio; Sisay-Joof, Fato ...; Usen, Stanley; Auburn, Sarah; Bumpstead, Suzan ...; Campino, Susana; Coffey, Alison; Dunham, Andrew; Fry, Andrew E; Green, Angela; Gwilliam, Rhian; Hunt, Sarah E; Inouye, Michael; Jeffreys, Anna E; Mendy, Alieu; Palotie, Aarno; Potter, Simon; Ragoussis, Jiann ...; Rogers, Jane; Rowlands, Kate; Somaskantharajah ...; Whittaker, Pamel ...; Widden, Claire; Donnelly, Peter; Howie, Bryan; Marchini, Jonath ...; Morris, Andrew; Sanjoaquin, Migu ...; Achidi, Eric Aku ...; Agbenyega, Tsiri; Allen, Angela; Amodu, Olukemi; Corran, Patrick; Djimde, Abdoulay ...; Dolo, Amagana; Doumbo, Ogobara ...; Drakeley, Chris; Dunstan, Sarah; Evans, Jennifer; Farrar, Jeremy; Fernando, Deepik ...; Hien, Tran Tinh; Horstmann, Rolf ...; Ibrahim, Muntase ...; Karunaweera, Nad ...; Kokwaro, Gilbert; Koram, Kwadwo A; Lemnge, Martha; Makani, Julie; Marsh, Kevin; Michon, Pascal; Modiano, David; Molyneux, Malcol ...; Mueller, Ivo; Parker, Michael; Peshu, Norbert; Plowe, Christoph ...; Puijalon, Odile; Reeder, John; Reyburn, Hugh; Riley, Eleanor M; Sakuntabhai, Ana ...; Singhasivanon, P ...; Sirima, Sodiomon; Tall, Adama; Taylor, Terrie E; Thera, Mahamadou; Troye-Blomberg, ...; Williams, Thomas ...; Wilson, Michael; Kwiatkowski, Dom ...; visa färre...

Artiklar i publikationen: Nature Genetics

Av lärosätet: Stockholms universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se