Sökning: (WFRF:(Carreon Tania)) srt2:(2015)
> (2015) >
Further Confirmatio...
-
Wang, Zhaoming
(författare)
Further Confirmation of Germline Glioma Risk Variant rs78378222 in TP53 and Its Implication in Tumor Tissues via Integrative Analysis of TCGA Data
- Artikel/kapitelEngelska2015
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2015-05-18
-
Hindawi Limited,2015
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-106312
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-106312URI
-
https://doi.org/10.1002/humu.22799DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:131475162URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
We confirmed strong association of rs78378222:A>C (per allele odds ratio [OR] = 3.14; P = 6.48 x 10(-11)), a germline rare single-nucleotide polymorphism (SNP) in TP53, via imputation of a genome-wide association study of glioma (1,856 cases and 4,955 controls). We subsequently performed integrative analyses on the Cancer Genome Atlas (TCGA) data for GBM (glioblastoma multiforme) and LUAD (lung adenocarcinoma). Based on SNP data, we imputed genotypes for rs78378222 and selected individuals carrying rare risk allele (C). Using RNA sequencing data, we observed aberrant transcripts with approximate to 3 kb longer than normal for those individuals. Using exome sequencing data, we further showed that loss of haplotype carrying common protective allele (A) occurred somatically in GBM but not in LUAD. Our bioinformatic analysis suggests rare risk allele (C) disrupts mRNA termination, and an allelic loss of a genomic region harboring common protective allele (A) occurs during tumor initiation or progression for glioma.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Rajaraman, Preetha
(författare)
-
Melin, Beatrice S.Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)bema0010
(författare)
-
Chung, Charles C.
(författare)
-
Zhang, Weijia
(författare)
-
McKean-Cowdin, Roberta
(författare)
-
Michaud, Dominique
(författare)
-
Yeager, Meredith
(författare)
-
Ahlbom, AndersKarolinska Institutet
(författare)
-
Albanes, Demetrius
(författare)
-
Andersson, UlrikaUmeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)ulan0002
(författare)
-
Freeman, Laura E. Beane
(författare)
-
Buring, Julie E.
(författare)
-
Butler, Mary Ann
(författare)
-
Carreon, Tania
(författare)
-
Feychting, MariaKarolinska Institutet
(författare)
-
Gapstur, Susan M.
(författare)
-
Gaziano, J. Michael
(författare)
-
Giles, Graham G.
(författare)
-
Hallmans, GöranUmeå universitet,Enheten för biobanksforskning,Näringsforskning(Swepub:umu)goha0001
(författare)
-
Henriksson, RogerUmeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)rohe0003
(författare)
-
Hoffman-Bolton, Judith
(författare)
-
Inskip, Peter D.
(författare)
-
Kitahara, Cari M.
(författare)
-
Marchand, Loic Le
(författare)
-
Linet, Martha S.
(författare)
-
Li, Shengchao
(författare)
-
Peters, Ulrike
(författare)
-
Purdue, Mark P.
(författare)
-
Rothman, Nathaniel
(författare)
-
Ruder, Avima M.
(författare)
-
Sesso, Howard D.
(författare)
-
Severi, Gianluca
(författare)
-
Stampfer, Meir
(författare)
-
Stevens, Victoria L.
(författare)
-
Visvanathan, Kala
(författare)
-
Wang, Sophia S.
(författare)
-
White, Emily
(författare)
-
Zeleniuch-Jacquotte, Anne
(författare)
-
Hoover, Robert
(författare)
-
Fraumeni, Joseph F.
(författare)
-
Chatterjee, Nilanjan
(författare)
-
Hartge, Patricia
(författare)
-
Chanock, Stephen J.
(författare)
-
Umeå universitetOnkologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Human Mutation: Hindawi Limited36:7, s. 684-6881059-77941098-1004
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Wang, Zhaoming
-
Rajaraman, Preet ...
-
Melin, Beatrice ...
-
Chung, Charles C ...
-
Zhang, Weijia
-
McKean-Cowdin, R ...
-
visa fler...
-
Michaud, Dominiq ...
-
Yeager, Meredith
-
Ahlbom, Anders
-
Albanes, Demetri ...
-
Andersson, Ulrik ...
-
Freeman, Laura E ...
-
Buring, Julie E.
-
Butler, Mary Ann
-
Carreon, Tania
-
Feychting, Maria
-
Gapstur, Susan M ...
-
Gaziano, J. Mich ...
-
Giles, Graham G.
-
Hallmans, Göran
-
Henriksson, Roge ...
-
Hoffman-Bolton, ...
-
Inskip, Peter D.
-
Kitahara, Cari M ...
-
Marchand, Loic L ...
-
Linet, Martha S.
-
Li, Shengchao
-
Peters, Ulrike
-
Purdue, Mark P.
-
Rothman, Nathani ...
-
Ruder, Avima M.
-
Sesso, Howard D.
-
Severi, Gianluca
-
Stampfer, Meir
-
Stevens, Victori ...
-
Visvanathan, Kal ...
-
Wang, Sophia S.
-
White, Emily
-
Zeleniuch-Jacquo ...
-
Hoover, Robert
-
Fraumeni, Joseph ...
-
Chatterjee, Nila ...
-
Hartge, Patricia
-
Chanock, Stephen ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Human Mutation
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Karolinska Institutet