SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Sjödin Henrik)
 

Sökning: WFRF:(Sjödin Henrik) > MASQOT-GUI :

  • Bylesjö, MaxUmeå universitet,Kemiska institutionen (författare)

MASQOT-GUI : spot quality assessment for the two-channel microarray platform

  • Artikel/kapitelEngelska2006

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2006-08-09
  • Oxford University Press (OUP),2006
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-11102
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-11102URI
  • https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl434DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • MASQOT-GUI provides an open-source, platform-independent software pipeline for two-channel microarray spot quality control. This includes gridding, segmentation, quantification, quality assessment and data visualization. It hosts a set of independent applications, with interactions between the tools as well as import and export support for external software. The implementation of automated multivariate quality control assessment, which is a unique feature of MASQOT-GUI, is based on the previously documented and evaluated MASQOT methodology. Further abilities of the application are outlined and illustrated. AVAILABILITY: MASQOT-GUI is Java-based and licensed under the GNU LGPL. Source code and installation files are available for download at http://masqot-gui.sourceforge.net/

Ämnesord och genrebeteckningar

  • NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
  • NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
  • Computer Graphics
  • In Situ Hybridization; Fluorescence/instrumentation/methods/standards
  • Information Storage and Retrieval/*methods
  • Oligonucleotide Array Sequence Analysis/*instrumentation/*methods/standards
  • Quality Control
  • Software
  • Spectrometry; Fluorescence/instrumentation/*methods/standards
  • User-Computer Interface

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Sjödin, AndreasUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)anssjn96 (författare)
  • Eriksson, DanielUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)dalern99 (författare)
  • Antti, HenrikUmeå universitet,Kemiska institutionen(Swepub:umu)hean0004 (författare)
  • Moritz, ThomasUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC) (författare)
  • Jansson, Stefan,1959-Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)stja0001 (författare)
  • Trygg, JohanUmeå universitet,Kemiska institutionen,Computational Life Science Cluster (CLiC)(Swepub:umu)jotr0001 (författare)
  • Umeå universitetKemiska institutionen (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Bioinformatics: Oxford University Press (OUP)22:20, s. 2554-25551367-48031367-4811

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy