SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Schenk Jeanette)
 

Sökning: WFRF:(Schenk Jeanette) > (2017) > Functional metabolo...

  • Davoine, CelineUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik (författare)

Functional metabolomics as a tool to analyze Mediator function and structure in plants

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-06-22
  • Public Library Science,2017
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-140237
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-140237URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0179640DOI
  • https://res.slu.se/id/publ/86423URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Mediator is a multiprotein transcriptional co-regulator complex composed of four modules; Head, Middle, Tail, and Kinase. It conveys signals from promoter-bound transcriptional regulators to RNA polymerase II and thus plays an essential role in eukaryotic gene regulation. We describe subunit localization and activities of Mediator in Arabidopsis through metabolome and transcriptome analyses from a set of Mediator mutants. Functional metabolomic analysis based on the metabolite profiles of Mediator mutants using multivariate statistical analysis and heat-map visualization shows that different subunit mutants display distinct metabolite profiles, which cluster according to the reported localization of the corresponding subunits in yeast. Based on these results, we suggest localization of previously unassigned plant Mediator subunits to specific modules. We also describe novel roles for individual subunits in development, and demonstrate changes in gene expression patterns and specific metabolite levels in med18 and med25, which can explain their phenotypes. We find that med18 displays levels of phytoalexins normally found in wild type plants only after exposure to pathogens. Our results indicate that different Mediator subunits are involved in specific signaling pathways that control developmental processes and tolerance to pathogen infections.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Abreu, IlkaSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology(Swepub:slu)49562 (författare)
  • Khajeh, KhalilUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)khkh0006 (författare)
  • Blomberg, JeanetteUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)jebl0001 (författare)
  • Kidd, Brendan N. (författare)
  • Kazan, Kemal (författare)
  • Schenk, Peer M. (författare)
  • Gerber, LorenzSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology(Swepub:slu)50493 (författare)
  • Nilsson, OveSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology(Swepub:slu)48511 (författare)
  • Moritz, ThomasSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology(Swepub:slu)49634 (författare)
  • Björklund, StefanUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)stbj0001 (författare)
  • Umeå universitetInstitutionen för medicinsk kemi och biofysik (creator_code:org_t)
  • Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLOS ONE: Public Library Science12:61932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy