WFRF:(Richardson S.)
Sökning: WFRF:(Richardson S.) > (2005-2009) > The genome of black...
- Tuskan, G A (författare)
The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray).
- Artikel/kapitelEngelska2006
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- American Association for the Advancement of Science (AAAS),2006
- printrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-14206
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-14206URI
- https://doi.org/10.1126/science.1128691DOI
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-15989URI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- QC 20100525
- We report the draft genome of the black cottonwood tree, Populus trichocarpa. Integration of shotgun sequence assembly with genetic mapping enabled chromosome-scale reconstruction of the genome. More than 45,000 putative protein-coding genes were identified. Analysis of the assembled genome revealed a whole-genome duplication event; about 8000 pairs of duplicated genes from that event survived in the Populus genome. A second, older duplication event is indistinguishably coincident with the divergence of the Populus and Arabidopsis lineages. Nucleotide substitution, tandem gene duplication, and gross chromosomal rearrangement appear to proceed substantially more slowly in Populus than in Arabidopsis. Populus has more protein-coding genes than Arabidopsis, ranging on average from 1.4 to 1.6 putative Populus homologs for each Arabidopsis gene. However, the relative frequency of protein domains in the two genomes is similar. Overrepresented exceptions in Populus include genes associated with lignocellulosic wall biosynthesis, meristem development, disease resistance, and metabolite transport.
Ämnesord och genrebeteckningar
- Arabidopsis/genetics
- Chromosome Mapping
- Computational Biology
- Evolution; Molecular
- Expressed Sequence Tags
- Gene Duplication
- Gene Expression
- Genes; Plant
- Genome; Plant
- Oligonucleotide Array Sequence Analysis
- Phylogeny
- Plant Proteins/chemistry/genetics
- Polymorphism; Single Nucleotide
- Populus/*genetics/growth & development/metabolism
- Protein Structure; Tertiary
- RNA; Plant/analysis
- RNA; Untranslated/analysis
- Sequence Analysis; DNA
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Difazio, S (författare)
- Jansson, StefanUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)stja0001 (författare)
- Bohlmann, J (författare)
- Grigoriev, I (författare)
- Hellsten, U (författare)
- Putnam, N (författare)
- Ralph, S (författare)
- Rombauts, S (författare)
- Salamov, A (författare)
- Schein, J (författare)
- Sterck, L (författare)
- Aerts, A (författare)
- Bhalerao, Rupali RUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC) (författare)
- Bhalerao, Rishikesh PUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC) (författare)
- Blaudez, D (författare)
- Boerjan, W (författare)
- Brun, A (författare)
- Brunner, A (författare)
- Busov, V (författare)
- Campbell, M (författare)
- Karlsson, JanUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)jaka0002 (författare)
- Chalot, M (författare)
- Chapman, J (författare)
- Chen, G-L (författare)
- Cooper, D (författare)
- Coutinho, P M (författare)
- Couturier, J (författare)
- Covert, S (författare)
- Cronk, Q (författare)
- Cunningham, R (författare)
- Davis, J (författare)
- Degroeve, S (författare)
- Déjardin, A (författare)
- Depamphilis, C (författare)
- Detter, J (författare)
- Dirks, B (författare)
- Dubchak, I (författare)
- Duplessis, S (författare)
- Ehlting, J (författare)
- Ellis, B (författare)
- Gendler, K (författare)
- Goodstein, D (författare)
- Gribskov, M (författare)
- Grimwood, J (författare)
- Groover, A (författare)
- Gunter, L (författare)
- Hamberger, B (författare)
- Heinze, B (författare)
- Helariutta, Y (författare)
- Henrissat, B (författare)
- Holligan, D (författare)
- Holt, R (författare)
- Huang, W (författare)
- Islam-Faridi, N (författare)
- Jones, S (författare)
- Jones-Rhoades, M (författare)
- Jorgensen, R (författare)
- Joshi, C (författare)
- Kangasjärvi, J (författare)
- Karlsson, JanUmeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)jaka0002 (författare)
- Kelleher, C (författare)
- Kirkpatrick, R (författare)
- Kirst, M (författare)
- Kohler, A (författare)
- Kalluri, U (författare)
- Larimer, F (författare)
- Leebens-Mack, J (författare)
- Leplé, J-C (författare)
- Locascio, P (författare)
- Lou, Y (författare)
- Lucas, S (författare)
- Martin, F (författare)
- Montanini, B (författare)
- Napoli, C (författare)
- Nelson, D R (författare)
- Nelson, C (författare)
- Nieminen, K (författare)
- Nilsson, OveUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC) (författare)
- Pereda, V (författare)
- Peter, G (författare)
- Philippe, R (författare)
- Pilate, G (författare)
- Poliakov, A (författare)
- Razumovskaya, J (författare)
- Richardson, P (författare)
- Rinaldi, C (författare)
- Ritland, K (författare)
- Rouzé, P (författare)
- Ryaboy, D (författare)
- Schmutz, J (författare)
- Schrader, J (författare)
- Segerman, Bo (författare)
- Shin, H (författare)
- Siddiqui, A (författare)
- Sterky, FredrikKTH,Proteomik(Swepub:kth)u1xdtphk (författare)
- Terry, A (författare)
- Tsai, C-J (författare)
- Uberbacher, E (författare)
- Unneberg, P (författare)
- Vahala, J (författare)
- Wall, K (författare)
- Wessler, S (författare)
- Yang, G (författare)
- Yin, T (författare)
- Douglas, C (författare)
- Marra, M (författare)
- Sandberg, GöranUmeå universitet,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)gosa0003 (författare)
- Van de Peer, Y (författare)
- Rokhsar, D (författare)
- Umeå universitetInstitutionen för fysiologisk botanik (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Science: American Association for the Advancement of Science (AAAS)313:5793, s. 1596-6041095-92030036-8075
Internetlänk
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Retrieve&list_uids=16973872&dopt=Citation
- https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc883930/m2/1/high_res_d/901819.pdf
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-14206
- https://doi.org/10.1126/science.1128691
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-15989
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Tuskan, G A
- Difazio, S
- Jansson, Stefan
- Bohlmann, J
- Grigoriev, I
- Hellsten, U
- visa fler...
- Putnam, N
- Ralph, S
- Rombauts, S
- Salamov, A
- Schein, J
- Sterck, L
- Aerts, A
- Bhalerao, Rupali ...
- Bhalerao, Rishik ...
- Blaudez, D
- Boerjan, W
- Brun, A
- Brunner, A
- Busov, V
- Campbell, M
- Karlsson, Jan
- Chalot, M
- Chapman, J
- Chen, G-L
- Cooper, D
- Coutinho, P M
- Couturier, J
- Covert, S
- Cronk, Q
- Cunningham, R
- Davis, J
- Degroeve, S
- Déjardin, A
- Depamphilis, C
- Detter, J
- Dirks, B
- Dubchak, I
- Duplessis, S
- Ehlting, J
- Ellis, B
- Gendler, K
- Goodstein, D
- Gribskov, M
- Grimwood, J
- Groover, A
- Gunter, L
- Hamberger, B
- Heinze, B
- Helariutta, Y
- Henrissat, B
- Holligan, D
- Holt, R
- Huang, W
- Islam-Faridi, N
- Jones, S
- Jones-Rhoades, M
- Jorgensen, R
- Joshi, C
- Kangasjärvi, J
- Kelleher, C
- Kirkpatrick, R
- Kirst, M
- Kohler, A
- Kalluri, U
- Larimer, F
- Leebens-Mack, J
- Leplé, J-C
- Locascio, P
- Lou, Y
- Lucas, S
- Martin, F
- Montanini, B
- Napoli, C
- Nelson, D R
- Nelson, C
- Nieminen, K
- Nilsson, Ove
- Pereda, V
- Peter, G
- Philippe, R
- Pilate, G
- Poliakov, A
- Razumovskaya, J
- Richardson, P
- Rinaldi, C
- Ritland, K
- Rouzé, P
- Ryaboy, D
- Schmutz, J
- Schrader, J
- Segerman, Bo
- Shin, H
- Siddiqui, A
- Sterky, Fredrik
- Terry, A
- Tsai, C-J
- Uberbacher, E
- Unneberg, P
- Vahala, J
- Wall, K
- Wessler, S
- Yang, G
- Yin, T
- Douglas, C
- Marra, M
- Sandberg, Göran
- Van de Peer, Y
- Rokhsar, D
- visa färre...
- Artiklar i publikationen
- Science
- Av lärosätet
- Umeå universitet
- Kungliga Tekniska Högskolan
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
