SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Dale Anders M.)
 

Sökning: WFRF:(Dale Anders M.) > Övrigt vetenskapligt/konstnärligt > Hill W. David > Shared genetic vari...

  • Smeland, Olav B. (författare)

Shared genetic variants between schizophrenia and general cognitive function indicate common molecular genetic mechanisms

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • ELSEVIER SCIENCE BV,2017
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-143152
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-143152URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:vet swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background: Schizophrenia (SCZ) is a severe mental disorder characterized by widespread cognitive impairments including deficits in learning, memory, processing speed, attention and executive functioning. Although cognitive deficits are a strong predictor of functional outcome in SCZ, current treatment strategies largely fail to ameliorate these impairments. Thus, in order to develop more efficient treatment strategies in SCZ, a better understanding of the pathogenesis of these cognitive deficits is needed. Given that both SCZ and cognitive ability are substantially heritable, we here aimed to determine whether SCZ share genetic influences with general cognitive function (COG), a phenotype that captures the shared variation in performance across several cognitive domains. Methods: We analyzed GWAS results in the form of summary statistics (p-values and z-scores) from SCZ (the Psychiatric Genomics Consortium; n=82 315) and COG (CHARGE Consortium; n=53 949). We applied a conditional false discovery rate (FDR) framework. By leveraging SNP-associations in a secondary trait (SCZ or COG), the conditional FDR approach increases power to detect loci in the primary trait (COG or SCZ), regardless of the directions of allelic effects of the risk loci. We then applied the conjunction FDR to identify shared loci between the phenotypes. The conjunction FDR is defined as the maximum of the conditional FDRs for both directions, and we used an overall FDR threshold of 0.05. Results: To visualize pleiotropic enrichment, we constructed conditional Q-Q plots which indicate substantial polygenetic overlap between SCZ and COG. For progressively stringent p-value thresholds for SCZ SNPs, we found approximately 150-fold enrichment for COG. For progressively stringent p-value thresholds for COG SNPs, we found approximately 100-fold enrichment for SCZ. We then used the conjunction FDR and identified fourteen independent loci shared between SCZ and COG. The majority of the shared loci show inverse associations in SCZ and COG, in line with the observed cognitive dysfunction in SCZ. Discussion: Our preliminary findings indicate shared molecular genetic mechanisms between SCZ and COG, which may provide important new insights into the pathogenesis of cognitive dysfunction in SCZ.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Kauppi, KarolinaUmeå universitet,Institutionen för strålningsvetenskaper(Swepub:umu)kaakai04 (författare)
  • Wang, Yunpeng (författare)
  • Hill, W. David (författare)
  • Davies, Gail (författare)
  • Frei, Oleksandr (författare)
  • Li, Wen (författare)
  • Eriksen, Jon A. (författare)
  • Witoelar, Aree (författare)
  • Bettella, Francesco (författare)
  • Fan, Chun C. (författare)
  • Thompson, Wes (författare)
  • Chen, Chi-Hua (författare)
  • Djurovic, Srdjan (författare)
  • Deary, Ian J. (författare)
  • Dale, Anders M. (författare)
  • Andreassen, Ole A. (författare)
  • Umeå universitetInstitutionen för strålningsvetenskaper (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:European Neuropsychopharmacology: ELSEVIER SCIENCE BV27, s. S410-S4100924-977X1873-7862

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy