SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-148725"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-148725" > Molecular subtyping...

  • Ruiz, Vanessa Y. (författare)

Molecular subtyping of tumors from patients with familial glioma

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-10-10
  • Oxford University Press,2018
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-148725
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-148725URI
  • https://doi.org/10.1093/neuonc/nox192DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background. Single-gene mutation syndromes account for some familial glioma (FG); however, they make up only a small fraction of glioma families. Gliomas can be classified into 3 major molecular subtypes based on isocitrate dehydrogenase (IDH) mutation and 1p/19q codeletion. We hypothesized that the prevalence of molecular subtypes might differ in familial versus sporadic gliomas and that tumors in the same family should have the same molecular subtype. Methods. Participants in the FG study (Gliogene) provided samples for germline DNA analysis. Formalin-fixed, paraffin-embedded tumors were obtained from a subset of FG cases, and DNA was extracted. We analyzed tissue from 75 families, including 10 families containing a second affected family member. Copy number variation data were obtained using a first-generation Affymetrix molecular inversion probe (MIP) array. Results. Samples from 62 of 75 (83%) FG cases could be classified into the 3 subtypes. The prevalence of the molecular subtypes was: 30 (48%) IDH-wildtype, 21 (34%) IDH-mutant non-codeleted, and 11 (19%) IDH-mutant and 1p/19q codeleted. This distribution of molecular subtypes was not statistically different from that of sporadic gliomas (P = 0.54). Of 10 paired FG samples, molecular subtypes were concordant for 7 (kappa = 0.59): 3 IDH-mutant non-codeleted, 2 IDH-wildtype, and 2 IDH-mutant and 1p/19q codeleted gliomas. Conclusions. Our data suggest that within individual families, patients develop gliomas of the same molecular subtype. However, we did not observe differences in the prevalence of the molecular subtypes in FG compared with sporadic gliomas. These observations provide further insight into the distribution of molecular subtypes in FG.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Praska, Corinne E. (författare)
  • Armstrong, Georgina (författare)
  • Kollmeyer, Thomas M. (författare)
  • Yamada, Seiji (författare)
  • Decker, Paul A. (författare)
  • Kosel, Matthew L. (författare)
  • Eckel-Passow, Jeanette E. (författare)
  • Lachance, Daniel H. (författare)
  • Bainbridge, Matthew N. (författare)
  • Melin, Beatrice S.Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)bema0010 (författare)
  • Bondy, Melissa L. (författare)
  • Jenkins, Robert B. (författare)
  • Umeå universitetOnkologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Neuro-Oncology: Oxford University Press20:6, s. 810-8171522-85171523-5866

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy