SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lundqvist Carolina)
 

Sökning: WFRF:(Lundqvist Carolina) > Genome-wide associa...

Genome-wide association study identified novel candidate loci affecting wood formation in Norway spruce

Baison, John (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Vidalis, Amaryllis (författare)
Tech Univ Munich, Sect Populat Epigenet & Epigen, Ctr Life & Food Sci Weihenstephan, Lichtenbergstr 2a, D-85748 Munich, Germany
Zhou, Linghua (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
visa fler...
Chen, Zhi-Qiang (författare)
Swedish Univ Agr Sci, Dept Forest Genet & Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, Parallellvagen 21, S-90736 Umea, Sweden
Li, Zitong (författare)
Univ Helsinki, Dept Biosci, Ecol Genet Res Unit, POB 65, FI-00014 Helsinki, Finland
Sillanpaeae, Mikko J. (författare)
Univ Oulu, Dept Math Sci, Bioctr Oulu, Pentti Kaiteran Katu 1, Oulu, Finland
Bernhardsson, Carolina (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Umeå universitet,Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap,Swedish Univ Agr Sci, Dept Forest Genet & Plant Physiol, Umea Plant Sci Ctr, Parallellvagen 21, S-90736 Umea, Sweden;Umea Univ, Dept Ecol & Environm Sci, Linnaeus Vag 4-6, S-90736 Umea, Sweden,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology,Umeå University
Scofield, Douglas (författare)
Uppsala universitet,Evolutionsbiologi
Forsberg, Nils (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Grahn, Thomas (författare)
RISE Bioecon, Drottning Kristinas Vag 61, SE-11486 Stockholm, Sweden
Olsson, Lars (författare)
RISE Bioecon, Drottning Kristinas Vag 61, SE-11486 Stockholm, Sweden
Karlsson, Bo (författare)
Skogforsk, Ekebo 2250, SE-26890 Svalov, Sweden
Wu, Harry (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Ingvarsson, Pär (författare)
Uppsala universitet,Umeå universitet,Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap,Evolutionsbiologi,Umea Univ, Dept Ecol & Environm Sci, Linnaeus Vag 4-6, S-90736 Umea, Sweden
Lundqvist, Sven-Olof (författare)
RISE Bioecon, Drottning Kristinas Vag 61, SE-11486 Stockholm, Sweden;IIC, Rosenlundsgatan 48B, SE-11863 Stockholm, Sweden
Niittylä, Totte (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Garcia Gil, Rosario (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
Chen, Zhiqiang (författare)
Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi,Department of Forest Genetics and Plant Physiology
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
2019-07-28
2019
Engelska.
Ingår i: The Plant Journal. - : John Wiley & Sons. - 0960-7412 .- 1365-313X. ; 100:1, s. 83-100
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Norway spruce is a boreal forest tree species of significant ecological and economic importance. Hence there is a strong imperative to dissect the genetics underlying important wood quality traits in the species. We performed a functional genome-wide association study (GWAS) of 17 wood traits in Norway spruce using 178 101 single nucleotide polymorphisms (SNPs) generated from exome genotyping of 517 mother trees. The wood traits were defined using functional modelling of wood properties across annual growth rings. We applied a Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO-based) association mapping method using a functional multilocus mapping approach that utilizes latent traits, with a stability selection probability method as the hypothesis testing approach to determine a significant quantitative trait locus. The analysis provided 52 significant SNPs from 39 candidate genes, including genes previously implicated in wood formation and tree growth in spruce and other species. Our study represents a multilocus GWAS for complex wood traits in Norway spruce. The results advance our understanding of the genetics influencing wood traits and identifies candidate genes for future functional studies.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
LANTBRUKSVETENSKAPER  -- Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske -- Skogsvetenskap (hsv//swe)
AGRICULTURAL SCIENCES  -- Agriculture, Forestry and Fisheries -- Forest Science (hsv//eng)

Nyckelord

candidate genes
functional trait mapping
genome-wide association mapping
Norway spruce
quence capture
single nucleotide polymorphisms

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy