Sökning: WFRF:(Brunnstrom Hans)
> (2020-2024) >
Transcriptome-wide ...
Transcriptome-wide association study reveals candidate causal genes for lung cancer
-
- Bosse, Yohan (författare)
- Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec,Laval University
-
- Li, Zhonglin (författare)
- Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec,Laval University
-
- Xia, Jun (författare)
- Baylor College of Medicine
-
visa fler...
-
- Manem, Venkata (författare)
- Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec,Laval University
-
- Carreras-Torres, Robert (författare)
- International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
-
- Gabriel, Aurelie (författare)
- International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
-
- Gaudreault, Nathalie (författare)
- Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec,Laval University
-
- Albanes, Demetrius (författare)
- National Cancer Institute, NCI
-
- Aldrich, Melinda C. (författare)
- Vanderbilt University Medical Center,Fred Hutchinson Cancer Research Center
-
- Andrew, Angeline (författare)
- Dartmouth-Hitchcock Medical Center,Radboud University Medical Center
-
- Arnold, Susanne (författare)
- University of Kentucky
-
- Bickeboeller, Heike (författare)
- University Medical Center Göttingen
-
- Bojesen, Stig E. (författare)
- Copenhagen University Hospital
-
- Brennan, Paul (författare)
- International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
-
- Brunnstrom, Hans (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Förbättrad diagnostik och prognostik vid lungcancer och metastaser till lunga,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Improved diagnostics and prognostics of lung cancer and metastases to the lungs,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Caporaso, Neil (författare)
- National Cancer Institute, NCI
-
- Chen, Chu (författare)
- Harvard University
-
Christiani, David C. (författare)
-
- Field, John K. (författare)
- University of Liverpool
-
- Goodman, Gary (författare)
- Swedish Medical Center
-
- Grankvist, Kjell (författare)
- Umeå University,Umeå universitet,Klinisk kemi
-
- Houlston, Richard (författare)
- Institute of Cancer Research London
-
- Johansson, Mattias (författare)
- International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
-
- Johansson, Mikael (författare)
- Umeå University,Umeå universitet,Onkologi
-
Kiemeney, Lambertus A. (författare)
-
- Lam, Stephen (författare)
- British Columbia Cancer Agency
-
- Landi, Maria T. (författare)
- National Cancer Institute, NCI
-
- Lazarus, Philip (författare)
- Washington State University
-
- Le Marchand, Loic (författare)
- University of Hawaii Cancer Center
-
- Liu, Geoffrey (författare)
- Princess Margaret Hospital University of Toronto
-
- Melander, Olle (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups
-
- Rennert, Gadi (författare)
- Carmel Medical Center
-
- Risch, Angela (författare)
- University of Salzburg
-
- Rosenberg, Susan M. (författare)
- Baylor College of Medicine
-
- Schabath, Matthew B. (författare)
- H. Lee Moffitt Cancer Center & Research Institute
-
- Shete, Sanjay (författare)
- University of Texas
-
- Song, Zhuoyi (författare)
- Baylor College of Medicine
-
- Stevens, Victoria L. (författare)
- American Cancer Society
-
- Tardon, Adonina (författare)
- University of Oviedo
-
- Wichmann, H-Erich (författare)
- Helmholtz Zentrum München
-
- Woll, Penella (författare)
- University of Sheffield
-
- Zienolddiny, Shan (författare)
- National Institute of Occupational Health, Norway
-
- Obeidat, Ma'en (författare)
- University of British Columbia,St. Paul’s Hospital
-
- Timens, Wim (författare)
- University Medical Center Groningen
-
- Hung, Rayjean J. (författare)
- Sinai Health System
-
- Joubert, Philippe (författare)
- Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec,Laval University
-
- Amos, Christopher I. (författare)
- Baylor College of Medicine
-
- McKay, James D. (författare)
- International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-12-09
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: International Journal of Cancer. - : John Wiley & Sons. - 0020-7136 .- 1097-0215. ; 146:7, s. 1862-1878
- Relaterad länk:
-
https://onlinelibrar...
-
visa fler...
-
http://dx.doi.org/10...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- We have recently completed the largest GWAS on lung cancer including 29,266 cases and 56,450 controls of European descent. The goal of our study has been to integrate the complete GWAS results with a large‐scale expression quantitative trait loci (eQTL) mapping study in human lung tissues (n = 1,038) to identify candidate causal genes for lung cancer. We performed transcriptome‐wide association study (TWAS) for lung cancer overall, by histology (adenocarcinoma, squamous cell carcinoma and small cell lung cancer) and smoking subgroups (never‐ and ever‐smokers). We performed replication analysis using lung data from the Genotype‐Tissue Expression (GTEx) project. DNA damage assays were performed in human lung fibroblasts for selected TWAS genes. As expected, the main TWAS signal for all histological subtypes and ever‐smokers was on chromosome 15q25. The gene most strongly associated with lung cancer at this locus using the TWAS approach was IREB2 (pTWAS = 1.09E−99), where lower predicted expression increased lung cancer risk. A new lung adenocarcinoma susceptibility locus was revealed on 9p13.3 and associated with higher predicted expression of AQP3 (pTWAS = 3.72E−6). Among the 45 previously described lung cancer GWAS loci, we mapped candidate target gene for 17 of them. The association AQP3‐adenocarcinoma on 9p13.3 was replicated using GTEx (pTWAS = 6.55E−5). Consistent with the effect of risk alleles on gene expression levels, IREB2 knockdown and AQP3 overproduction promote endogenous DNA damage. These findings indicate genes whose expression in lung tissue directly influences lung cancer risk.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- lung cancer
- transcriptome-wide association study
- GWAS
- lung eQTL
- GWAS
- lung cancer
- lung eQTL
- transcriptome-wide association study
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bosse, Yohan
-
Li, Zhonglin
-
Xia, Jun
-
Manem, Venkata
-
Carreras-Torres, ...
-
Gabriel, Aurelie
-
visa fler...
-
Gaudreault, Nath ...
-
Albanes, Demetri ...
-
Aldrich, Melinda ...
-
Andrew, Angeline
-
Arnold, Susanne
-
Bickeboeller, He ...
-
Bojesen, Stig E.
-
Brennan, Paul
-
Brunnstrom, Hans
-
Caporaso, Neil
-
Chen, Chu
-
Christiani, Davi ...
-
Field, John K.
-
Goodman, Gary
-
Grankvist, Kjell
-
Houlston, Richar ...
-
Johansson, Matti ...
-
Johansson, Mikae ...
-
Kiemeney, Lamber ...
-
Lam, Stephen
-
Landi, Maria T.
-
Lazarus, Philip
-
Le Marchand, Loi ...
-
Liu, Geoffrey
-
Melander, Olle
-
Rennert, Gadi
-
Risch, Angela
-
Rosenberg, Susan ...
-
Schabath, Matthe ...
-
Shete, Sanjay
-
Song, Zhuoyi
-
Stevens, Victori ...
-
Tardon, Adonina
-
Wichmann, H-Eric ...
-
Woll, Penella
-
Zienolddiny, Sha ...
-
Obeidat, Ma'en
-
Timens, Wim
-
Hung, Rayjean J.
-
Joubert, Philipp ...
-
Amos, Christophe ...
-
McKay, James D.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
International Jo ...
- Av lärosätet
-
Umeå universitet
-
Lunds universitet