SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Tardon Adonina)
 

Sökning: WFRF:(Tardon Adonina) > (2020-2024) > Genome-wide associa...

  • Dai, JunchengNanjing Medical University (författare)

Genome-wide association study of INDELs identified four novel susceptibility loci associated with lung cancer risk

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • John Wiley & Sons,2020
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-169781
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-169781URI
  • https://doi.org/10.1002/ijc.32698DOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/d6ac0de9-9a6d-4ee7-a247-6ffd7e3c829aURI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Genome-wide association studies (GWAS) have identified 45 susceptibility loci associated with lung ncer. Only less than SNPs, small insertions and deletions (INDELs) are the second most abundant netic polymorphisms in the human genome. INDELs are highly associated with multiple human seases, including lung cancer. However, limited studies with large-scale samples have been available to stematically evaluate the effects of INDELs on lung cancer risk. Here, we performed a large-scale meta- alysis to evaluate INDELs and their risk for lung cancer in 23,202 cases and 19,048 controls. Functional notations were performed to further explore the potential function of lung cancer risk INDELs. nditional analysis was used to clarify the relationship between INDELs and SNPs. Four new risk loci re identified in genome-wide INDEL analysis (1p13.2: rs5777156, Insertion, OR = 0.92, p = 9.10 x 10(- ; 4q28.2: rs58404727, Deletion, OR = 1.19, p = 5.25 x 10(-7); 12p13.31: rs71450133, Deletion, OR = 09, p = 8.83 x 10(-7); and 14q22.3: rs34057993, Deletion, OR = 0.90, p = 7.64 x 10(-8)). The eQTL alysis and functional annotation suggested that INDELs might affect lung cancer susceptibility by gulating the expression of target genes. After conducting conditional analysis on potential causal SNPs, e INDELs in the new loci were still nominally significant. Our findings indicate that INDELs could be tentially functional genetic variants for lung cancer risk. Further functional experiments are needed to tter understand INDEL mechanisms in carcinogenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Huang, MingtaoNanjing Medical University (författare)
  • Amos, Christopher I.Baylor College of Medicine (författare)
  • Hung, Rayjean J.Sinai Health System (författare)
  • Tardon, AdoninaUniversity of Oviedo (författare)
  • Andrew, AngelineDartmouth-Hitchcock Medical Center,Radboud University Medical Center (författare)
  • Chen, ChuFred Hutchinson Cancer Research Center,Harvard University,Vanderbilt University Medical Center (författare)
  • Christiani, David C. (författare)
  • Albanes, DemetriusNational Cancer Institute, NCI (författare)
  • Rennert, GadiTechnion - Israel Institute of Technology (författare)
  • Fan, JingyiNanjing Medical University (författare)
  • Goodman, GarySwedish Medical Center (författare)
  • Liu, GeoffreyPrincess Margaret Hospital University of Toronto (författare)
  • Field, John K.University of Liverpool (författare)
  • Grankvist, KjellUmeå University,Umeå universitet,Klinisk kemi(Swepub:umu)kjgr0002 (författare)
  • Kiemeney, Lambertus A. (författare)
  • Le Marchand, LoicUniversity of Hawaii Cancer Center (författare)
  • Schabath, Matthew B.H. Lee Moffitt Cancer Center & Research Institute (författare)
  • Johansson, MattiasInternational Agency for Research on Cancer, World Health Organization (författare)
  • Aldrich, Melinda C. (författare)
  • Johansson, MikaelUmeå University,Umeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)mijo0025 (författare)
  • Caporaso, NeilNational Cancer Institute, NCI (författare)
  • Lazarus, PhilipWashington State University College of Pharmacy (författare)
  • Lam, StephanBritish Columbia Cancer Agency (författare)
  • Bojesen, Stig E.University of Copenhagen,Copenhagen University Hospital (författare)
  • Arnold, SusanneUniversity of Kentucky (författare)
  • Landi, Maria TeresaNational Cancer Institute, NCI (författare)
  • Risch, AngelaUniversity of Salzburg (författare)
  • Wichmann, H-ErichLudwig-Maximilian University of Munich (författare)
  • Bickeboller, HeikeUniversity Medical Center Göttingen (författare)
  • Brennan, PaulInternational Agency for Research on Cancer, World Health Organization (författare)
  • Shete, SanjayUniversity of Texas (författare)
  • Melander, OlleLund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-ome (författare)
  • Brunnstrom, HansLund University,Lunds universitet,Förbättrad diagnostik och prognostik vid lungcancer och metastaser till lunga,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Improved diagnostics and prognostics of lung cancer and metastases to the lungs,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments(Swepub:lu)med-hsb (författare)
  • Zienolddiny, ShanNational Institute of Occupational Health, Norway (författare)
  • Woll, PenellaUniversity of Sheffield (författare)
  • Stevens, VictoriaAmerican Cancer Society (författare)
  • Hu, ZhibinNanjing Medical University (författare)
  • Shen, HongbingNanjing Medical University (författare)
  • Nanjing Medical UniversityBaylor College of Medicine (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:International Journal of Cancer: John Wiley & Sons146:10, s. 2855-28640020-71361097-0215

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy