SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Tian Xue Chan)
 

Sökning: WFRF:(Tian Xue Chan) > Chromosome-level ge...

  • Yang, Fu-Sheng (författare)

Chromosome-level genome assembly of a parent species of widely cultivated azaleas

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-10-19
  • Nature Publishing Group,2020
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-176910
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-176910URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-020-18771-4DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Azaleas (Ericaceae) comprise one of the most diverse ornamental plants, renowned for their cultural and economic importance. We present a chromosome-scale genome assembly for Rhododendron simsii, the primary ancestor of azalea cultivars. Genome analyses unveil the remnants of an ancient whole-genome duplication preceding the radiation of most Ericaceae, likely contributing to the genomic architecture of flowering time. Small-scale gene duplications contribute to the expansion of gene families involved in azalea pigment biosynthesis. We reconstruct entire metabolic pathways for anthocyanins and carotenoids and their potential regulatory networks by detailed analysis of time-ordered gene co-expression networks. MYB, bHLH, and WD40 transcription factors may collectively regulate anthocyanin accumulation in R. simsii, particularly at the initial stages of flower coloration, and with WRKY transcription factors controlling progressive flower coloring at later stages. This work provides a cornerstone for understanding the underlying genetics governing flower timing and coloration and could accelerate selective breeding in azalea. Azaleas are one of the most diverse ornamental plants and have cultural and economic importance. Here, the authors report a chromosome-scale genome assembly for the primary ancestor of the azalea cultivar Rhododendro simsi and identify transcription factors that may function in flower coloration at different stages.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Nie, Shuai (författare)
  • Liu, Hui (författare)
  • Shi, Tian-Le (författare)
  • Tian, Xue-Chan (författare)
  • Zhou, Shan-Shan (författare)
  • Bao, Yu-Tao (författare)
  • Jia, Kai-Hua (författare)
  • Guo, Jing-Fang (författare)
  • Zhao, WeiUmeå universitet,Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University, Beijing, China(Swepub:umu)zhwe0002 (författare)
  • An, Na (författare)
  • Zhang, Ren-Gang (författare)
  • Yun, Quan-Zheng (författare)
  • Wang, Xin-Zhu (författare)
  • Mannapperuma, Chanaka,1982-Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)mach0027 (författare)
  • Porth, Ilga (författare)
  • El-Kassaby, Yousry Aly (författare)
  • Street, Nathaniel,1979-Umeå universitet,Institutionen för fysiologisk botanik,Umeå Plant Science Centre (UPSC)(Swepub:umu)rona0006 (författare)
  • Wang, Xiao-RuUmeå universitet,Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap,Umeå Plant Science Centre (UPSC),Beijing Advanced Innovation Center for Tree Breeding by Molecular Design, National Engineering Laboratory for Tree Breeding, College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University, Beijing, China(Swepub:umu)xiwa0003 (författare)
  • Van de Peer, Yves (författare)
  • Mao, Jian-Feng (författare)
  • Umeå universitetInstitutionen för ekologi, miljö och geovetenskap (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Nature Publishing Group11:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy