A collection of bacterial isolates from the pig intestine reveals functional and taxonomic diversity

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-178316" > A collection of bac...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Wylensek, David (författare)

A collection of bacterial isolates from the pig intestine reveals functional and taxonomic diversity

Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2020-12-15
Nature Publishing Group,2020
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-178316
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-178316URI
https://doi.org/10.1038/s41467-020-19929-wDOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Our knowledge about the gut microbiota of pigs is still scarce, despite the importance of these animals for biomedical research and agriculture. Here, we present a collection of cultured bacteria from the pig gut, including 110 species across 40 families and nine phyla. We provide taxonomic descriptions for 22 novel species and 16 genera. Meta-analysis of 16S rRNA amplicon sequence data and metagenome-assembled genomes reveal prevalent and pig-specific species within Lactobacillus, Streptococcus, Clostridium, Desulfovibrio, Enterococcus, Fusobacterium, and several new genera described in this study. Potentially interesting functions discovered in these organisms include a fucosyltransferase encoded in the genome of the novel species Clostridium porci, and prevalent gene clusters for biosynthesis of sactipeptide-like peptides. Many strains deconjugate primary bile acids in in vitro assays, and a Clostridium scindens strain produces secondary bile acids via dehydroxylation. In addition, cells of the novel species Bullifex porci are coccoidal or spherical under the culture conditions tested, in contrast with the usual helical shape of other members of the family Spirochaetaceae. The strain collection, called 'Pig intestinal bacterial collection' (PiBAC), is publicly available at www.dsmz.de/pibac and opens new avenues for functional studies of the pig gut microbiota. The authors present a public collection of 117 bacterial isolates from the pig gut, including the description of 38 novel taxa. Interesting functions discovered in these organisms include a new fucosyltransferease and sactipeptide-like molecules encoded by biosynthetic gene clusters.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Mikrobiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Microbiology hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Hitch, Thomas C. A. (författare)
Riedel, Thomas (författare)
Afrizal, Afrizal (författare)
Kumar, Neeraj (författare)
Wortmann, Esther (författare)
Liu, Tianzhe (författare)
Devendran, Saravanan (författare)
Lesker, Till R. (författare)
Hernandez, Sara B.Umeå universitet,Institutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten),Molekylär Infektionsmedicin, Sverige (MIMS)(Swepub:umu)sahe0111 (författare)
Heine, Viktoria (författare)
Buhl, Eva M. (författare)
D'Agostino, Paul M. (författare)
Cumbo, Fabio (författare)
Fischoeder, Thomas (författare)
Wyschkon, Marzena (författare)
Looft, Torey (författare)
Parreira, Valeria R. (författare)
Abt, Birte (författare)
Doden, Heidi L. (författare)
Ly, Lindsey (författare)
Alves, Joao M. P. (författare)
Reichlin, Markus (författare)
Flisikowski, Krzysztof (författare)
Suarez, Laura Navarro (författare)
Neumann, Anthony P. (författare)
Suen, Garret (författare)
de Wouters, Tomas (författare)
Rohn, Sascha (författare)
Lagkouvardos, Ilias (författare)
Allen-Vercoe, Emma (författare)
Sproeer, Cathrin (författare)
Bunk, Boyke (författare)
Taverne-Thiele, Anja J. (författare)
Giesbers, Marcel (författare)
Wells, Jerry M. (författare)
Neuhaus, Klaus (författare)
Schnieke, Angelika (författare)
Cava, Felipe (författare)
Segata, Nicola (författare)
Elling, Lothar (författare)
Strowig, Till (författare)
Ridlon, Jason M. (författare)
Gulder, Tobias A. M. (författare)
Overmann, Jörg (författare)
Clavel, Thomas (författare)
Umeå universitetInstitutionen för molekylärbiologi (Medicinska fakulteten) (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Communications: Nature Publishing Group11:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Communications (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Wylensek, David; Hitch, Thomas C. ...; Riedel, Thomas; Afrizal, Afrizal; Kumar, Neeraj; Wortmann, Esther; visa fler...; Liu, Tianzhe; Devendran, Sarav ...; Lesker, Till R.; Hernandez, Sara ...; Heine, Viktoria; Buhl, Eva M.; D'Agostino, Paul ...; Cumbo, Fabio; Fischoeder, Thom ...; Wyschkon, Marzen ...; Looft, Torey; Parreira, Valeri ...; Abt, Birte; Doden, Heidi L.; Ly, Lindsey; Alves, Joao M. P ...; Reichlin, Markus; Flisikowski, Krz ...; Suarez, Laura Na ...; Neumann, Anthony ...; Suen, Garret; de Wouters, Toma ...; Rohn, Sascha; Lagkouvardos, Il ...; Allen-Vercoe, Em ...; Sproeer, Cathrin; Bunk, Boyke; Taverne-Thiele, ...; Giesbers, Marcel; Wells, Jerry M.; Neuhaus, Klaus; Schnieke, Angeli ...; Cava, Felipe; Segata, Nicola; Elling, Lothar; Strowig, Till; Ridlon, Jason M.; Gulder, Tobias A ...; Overmann, Jörg; Clavel, Thomas; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

Artiklar i publikationen: Nature Communica ...

Av lärosätet: Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se