Combining local and grid resources in scientific workflows (for Bioinformatics)

Sökning: L4X0:0302 9743 > Combining local and...

Berglund, Ann-CharlotteLinnaeus Centre for Bioinformatics, Uppsala Universitet (författare)

accepted 2009
We examine some issues that arise when using both local and Gridresources in scientific workflows. Our previous work addresses and illustratesthe benefits of a light-weight and generic workflow engine that manages andoptimizes Grid resource usage. Extending on this effort, we hereillustrate how a client tool for bioinformatics applications employs the engine tointerface with Grid resources. We also explore how to define data flowsthat transparently integrates local and Grid subworkflows. In addition, the benefits of parameter sweep workflows are examined and a means for describing this type of workflows in an abstract and concise manner is introduced. Finally, the above mechanisms are employed to perform an orthology detection analysis.

Elmroth, Erik,1964-Umeå universitet,Institutionen för datavetenskap,UMIT(Swepub:umu)erel0001 (författare)
Hernández, FranciscoUmeå universitet,Institutionen för datavetenskap(Swepub:umu)frhe0010 (författare)
Sandman, BjörnUmeå universitet,Institutionen för datavetenskap(Swepub:umu)brnsan02 (författare)
Tordsson, Johan,1980-Umeå universitet,Institutionen för datavetenskap(Swepub:umu)jonton02 (författare)
Linnaeus Centre for Bioinformatics, Uppsala UniversitetInstitutionen för datavetenskap (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Berglund, Ann-Ch ...; Elmroth, Erik, 1 ...; Hernández, Franc ...; Sandman, Björn; Tordsson, Johan, ...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.