QU-BraTS: MICCAI BraTS 2020 Challenge on QuantifyingUncertainty in Brain Tumor Segmentation - Analysis of Ranking Scores and Benchmarking Results

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Yu Guo Pei) > (2020-2023) > QU-BraTS :

Mehta, Raghav (författare)

QU-BraTS : MICCAI BraTS 2020 Challenge on QuantifyingUncertainty in Brain Tumor Segmentation - Analysis of Ranking Scores and Benchmarking Results

Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2022
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-198857
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-198857URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Deep learning (DL) models have provided the state-of-the-art performance in a wide variety of medical imaging benchmarking challenges, including the Brain Tumor Segmentation (BraTS) challenges. However, the task of focal pathology multi-compartment segmentation (e.g., tumor and lesion sub-regions) is particularly challenging, and potential errors hinder the translation of DL models into clinical workflows. Quantifying the reliability of DL model predictions in the form of uncertainties, could enable clinical review of the most uncertain regions, thereby building trust and paving the way towards clinical translation. Recently, a number of uncertainty estimation methods have been introduced for DL medical image segmentation tasks. Developing scores to evaluate and compare the performance of uncertainty measures will assist the end-user in making more informed decisions. In this study, we explore and evaluate a score developed during the BraTS 2019-2020 task on uncertainty quantification (QU-BraTS), and designed to assess and rank uncertainty estimates for brain tumor multi-compartment segmentation. This score (1) rewards uncertainty estimates that produce high confidence in correct assertions, and those that assign low confidence levels at incorrect assertions, and (2) penalizes uncertainty measures that lead to a higher percentages of under-confident correct assertions. We further benchmark the segmentation uncertainties generated by 14 independent participating teams of QU-BraTS 2020, all of which also participated in the main BraTS segmentation task. Overall, our findings confirm the importance and complementary value that uncertainty estimates provide to segmentation algorithms, and hence highlight the need for uncertainty quantification in medical image analyses. Our evaluation code is made publicly available at https://github.com/RagMeh11/QU-BraTS

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap Datorseende och robotik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences Computer Vision and Robotics hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Annan medicin och hälsovetenskap Övrig annan medicin och hälsovetenskap hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Other Medical and Health Sciences Other Medical and Health Sciences not elsewhere specified hsv//eng
Uncertainty Quantification
Trustworthiness
Segmentation
Brain Tumors
Deep Learning
Neuro-Oncology
Glioma
Glioblastoma

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Filos, Angelos (författare)
Baid, Ujjwal (författare)
Sako, Chiharu (författare)
McKinley, Richard (författare)
Rebsamen, Michael (författare)
Dätwyler, Katrin (författare)
Meier, Raphael (författare)
Radojewski, Piotr (författare)
Murugesan, Gowtham Krishnan (författare)
Nalawade, Sahil (författare)
Ganesh, Chandan (författare)
Wagner, Ben (författare)
Yu, Fang F. (författare)
Fei, Baowei (författare)
Madhuranthakam, Ananth J. (författare)
Maldjian, Joseph A. (författare)
Daza, Laura (författare)
Gómez, Catalina (författare)
Arbeláez, Pablo (författare)
Dai, Chengliang (författare)
Wang, Shuo (författare)
Reynaud, Hadrien (författare)
Mo, Yuanhan (författare)
Angelini, Elsa (författare)
Guo, Yike (författare)
Bai, Wenjia (författare)
Banerjee, Subhashis (författare)
Pei, Linmin (författare)
AK, Murat (författare)
Rosas-González, Sarahi (författare)
Zemmoura, Ilyess (författare)
Tauber, Clovis (författare)
Vu, Minh HoangUmeå universitet,Radiofysik(Swepub:umu)mivu0006 (författare)
Nyholm, TufveUmeå universitet,Radiofysik(Swepub:umu)tuny0001 (författare)
Löfstedt, TommyUmeå universitet,Institutionen för datavetenskap(Swepub:umu)toklot02 (författare)
Ballestar, Laura Mora (författare)
Vilaplana, Veronica (författare)
McHugh, Hugh (författare)
Talou, Gonzalo Maso (författare)
Wang, Alan (författare)
Patel, Jay (författare)
Chang, Ken (författare)
Hoebel, Katharina (författare)
Gidwani, Mishka (författare)
Arun, Nishanth (författare)
Gupta, Sharut (författare)
Aggarwal, Mehak (författare)
Singh, Praveer (författare)
Gerstner, Elizabeth R. (författare)
Kalpathy-Cramer, Jayashree (författare)
Boutry, Nicolas (författare)
Huard, Alexis (författare)
Vidyaratne, Lasitha (författare)
Rahman, Md Monibor (författare)
Iftekharuddin, Khan M. (författare)
Chazalon, Joseph (författare)
Puybareau, Elodie (författare)
Tochon, Guillaume (författare)
Ma, Jun (författare)
Cabezas, Mariano (författare)
Llado, Xavier (författare)
Oliver, Arnau (författare)
Valencia, Liliana (författare)
Valverde, Sergi (författare)
Amian, Mehdi (författare)
Soltaninejad, Mohammadreza (författare)
Myronenko, Andriy (författare)
Hatamizadeh, Ali (författare)
Feng, Xue (författare)
Dou, Quan (författare)
Tustison, Nicholas (författare)
Meyer, Craig (författare)
Shah, Nisarg A. (författare)
Talbar, Sanjay (författare)
Weber, Marc-André (författare)
Mahajan, Abhishek (författare)
Jakab, Andras (författare)
Wiest, Roland (författare)
Fathallah-Shaykh, Hassan M. (författare)
Nazeri, Arash (författare)
Milchenko, Mikhail (författare)
Marcus, Daniel (författare)
Kotrotsou, Aikaterini (författare)
Colen, Rivka (författare)
Freymann, John (författare)
Kirby, Justin (författare)
Davatzikos, Christos (författare)
Menze, Bjoern (författare)
Bakas, Spyridon (författare)
Gal, Yarin (författare)
Arbel, Tal (författare)
Umeå universitetRadiofysik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging, s. 1-542766-905X

Internetlänk

https://www.melba-journal.org/papers/2022:026.htmlPublisher´s fulltext
https://umu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1690582/FULLTEXT01.pdffulltext:print
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-198857

Hitta via bibliotek

Journal of Machine Learning for Biomedical Imaging (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Mehta, Raghav; Filos, Angelos; Baid, Ujjwal; Sako, Chiharu; McKinley, Richar ...; Rebsamen, Michae ...; visa fler...; Dätwyler, Katrin; Meier, Raphael; Radojewski, Piot ...; Murugesan, Gowth ...; Nalawade, Sahil; Ganesh, Chandan; Wagner, Ben; Yu, Fang F.; Fei, Baowei; Madhuranthakam, ...; Maldjian, Joseph ...; Daza, Laura; Gómez, Catalina; Arbeláez, Pablo; Dai, Chengliang; Wang, Shuo; Reynaud, Hadrien; Mo, Yuanhan; Angelini, Elsa; Guo, Yike; Bai, Wenjia; Banerjee, Subhas ...; Pei, Linmin; AK, Murat; Rosas-González, ...; Zemmoura, Ilyess; Tauber, Clovis; Vu, Minh Hoang; Nyholm, Tufve; Löfstedt, Tommy; Ballestar, Laura ...; Vilaplana, Veron ...; McHugh, Hugh; Talou, Gonzalo M ...; Wang, Alan; Patel, Jay; Chang, Ken; Hoebel, Katharin ...; Gidwani, Mishka; Arun, Nishanth; Gupta, Sharut; Aggarwal, Mehak; Singh, Praveer; Gerstner, Elizab ...; Kalpathy-Cramer, ...; Boutry, Nicolas; Huard, Alexis; Vidyaratne, Lasi ...; Rahman, Md Monib ...; Iftekharuddin, K ...; Chazalon, Joseph; Puybareau, Elodi ...; Tochon, Guillaum ...; Ma, Jun; Cabezas, Mariano; Llado, Xavier; Oliver, Arnau; Valencia, Lilian ...; Valverde, Sergi; Amian, Mehdi; Soltaninejad, Mo ...; Myronenko, Andri ...; Hatamizadeh, Ali; Feng, Xue; Dou, Quan; Tustison, Nichol ...; Meyer, Craig; Shah, Nisarg A.; Talbar, Sanjay; Weber, Marc-Andr ...; Mahajan, Abhishe ...; Jakab, Andras; Wiest, Roland; Fathallah-Shaykh ...; Nazeri, Arash; Milchenko, Mikha ...; Marcus, Daniel; Kotrotsou, Aikat ...; Colen, Rivka; Freymann, John; Kirby, Justin; Davatzikos, Chri ...; Menze, Bjoern; Bakas, Spyridon; Gal, Yarin; Arbel, Tal; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Datorseende och ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Annan medicin oc ...; och Övrig annan medi ...

Artiklar i publikationen: Journal of Machi ...

Av lärosätet: Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se