Ancestry-shift refinement mapping of the C6orf97-ESR1 breast cancer susceptibility locus.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(van Engelenburg K C Anton) > Ancestry-shift refi...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Stacey, Simon N (författare)

Ancestry-shift refinement mapping of the C6orf97-ESR1 breast cancer susceptibility locus.

Artikel/kapitelEngelska2010

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2010-07-22
Public Library of Science,2010
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-35468
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-35468URI
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1001029DOI
https://lup.lub.lu.se/record/1677328URI
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:121099683URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

We used an approach that we term ancestry-shift refinement mapping to investigate an association, originally discovered in a GWAS of a Chinese population, between rs2046210[T] and breast cancer susceptibility. The locus is on 6q25.1 in proximity to the C6orf97 and estrogen receptor alpha (ESR1) genes. We identified a panel of SNPs that are correlated with rs2046210 in Chinese, but not necessarily so in other ancestral populations, and genotyped them in breast cancer case:control samples of Asian, European, and African origin, a total of 10,176 cases and 13,286 controls. We found that rs2046210[T] does not confer substantial risk of breast cancer in Europeans and Africans (OR = 1.04, P = 0.099, and OR = 0.98, P = 0.77, respectively). Rather, in those ancestries, an association signal arises from a group of less common SNPs typified by rs9397435. The rs9397435[G] allele was found to confer risk of breast cancer in European (OR = 1.15, P = 1.2 x 10(-3)), African (OR = 1.35, P = 0.014), and Asian (OR = 1.23, P = 2.9 x 10(-4)) population samples. Combined over all ancestries, the OR was 1.19 (P = 3.9 x 10(-7)), was without significant heterogeneity between ancestries (P(het) = 0.36) and the SNP fully accounted for the association signal in each ancestry. Haplotypes bearing rs9397435[G] are well tagged by rs2046210[T] only in Asians. The rs9397435[G] allele showed associations with both estrogen receptor positive and estrogen receptor negative breast cancer. Using early-draft data from the 1,000 Genomes project, we found that the risk allele of a novel SNP (rs77275268), which is closely correlated with rs9397435, disrupts a partially methylated CpG sequence within a known CTCF binding site. These studies demonstrate that shifting the analysis among ancestral populations can provide valuable resolution in association mapping.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Hälsovetenskap Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Health Sciences Public Health, Global Health, Social Medicine and Epidemiology hsv//eng
MEDICINE
MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Sulem, Patrick (författare)
Zanon, Carlo (författare)
Gudjonsson, Sigurjon A (författare)
Thorleifsson, Gudmar (författare)
Helgason, Agnar (författare)
Jonasdottir, Aslaug (författare)
Besenbacher, Soren (författare)
Kostic, Jelena P (författare)
Fackenthal, James D (författare)
Huo, Dezheng (författare)
Adebamowo, Clement (författare)
Ogundiran, Temidayo (författare)
Olson, Janet E (författare)
Fredericksen, Zachary S (författare)
Wang, Xianshu (författare)
Look, Maxime P (författare)
Sieuwerts, Anieta MKarolinska Institutet (författare)
Martens, John W M (författare)
Pajares, Isabel (författare)
Garcia-Prats, Maria D (författare)
Ramon-Cajal, Jose M (författare)
de Juan, Ana (författare)
Panadero, Angeles (författare)
Ortega, Eugenia (författare)
Hemminki, KariLund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-khk (författare)
Vermeulen, Sita H (författare)
Asadzadeh, Fatemeh (författare)
van Engelenburg, K C Anton (författare)
Margolin, Sara (författare)
Shen, Chen-Yang (författare)
Wu, Pei-Ei (författare)
Försti, AstaLund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-asf (författare)
Lenner, PerUmeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)pele0005 (författare)
Henriksson, RogerUmeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)rohe0003 (författare)
Johansson, RobertUmeå universitet,Onkologi(Swepub:umu)rojo0001 (författare)
Enquist, KerstinUmeå universitet,Näringsforskning (författare)
Hallmans, GöranUmeå universitet,Näringsforskning(Swepub:umu)goha0001 (författare)
Jonsson, Thorvaldur (författare)
Sigurdsson, Helgi (författare)
Alexiusdottir, Kristin (författare)
Gudmundsson, Julius (författare)
Sigurdsson, Asgeir (författare)
Frigge, Michael L (författare)
Gudmundsson, Larus (författare)
Kristjansson, Kristleifur (författare)
Halldorsson, Bjarni V (författare)
Styrkarsdottir, Unnur (författare)
Gulcher, Jeffrey R (författare)
Hemminki, Kari (författare)
Lindblom, AnnikaKarolinska Institutet (författare)
Kiemeney, Lambertus A (författare)
Mayordomo, Jose I (författare)
Foekens, John A (författare)
Couch, Fergus J (författare)
Olopade, Olufunmilayo I (författare)
Gudbjartsson, Daniel F (författare)
Thorsteinsdottir, Unnur (författare)
Rafnar, Thorunn (författare)
Johannsson, Oskar T (författare)
Stefansson, Kari (författare)
Karolinska InstitutetAllmänmedicin och klinisk epidemiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLoS genetics: Public Library of Science6:7, s. e1001029-1553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLoS genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Stacey, Simon N; Sulem, Patrick; Zanon, Carlo; Gudjonsson, Sigu ...; Thorleifsson, Gu ...; Helgason, Agnar; visa fler...; Jonasdottir, Asl ...; Besenbacher, Sor ...; Kostic, Jelena P; Fackenthal, Jame ...; Huo, Dezheng; Adebamowo, Cleme ...; Ogundiran, Temid ...; Olson, Janet E; Fredericksen, Za ...; Wang, Xianshu; Look, Maxime P; Sieuwerts, Aniet ...; Martens, John W ...; Pajares, Isabel; Garcia-Prats, Ma ...; Ramon-Cajal, Jos ...; de Juan, Ana; Panadero, Angele ...; Ortega, Eugenia; Hemminki, Kari; Vermeulen, Sita ...; Asadzadeh, Fatem ...; van Engelenburg, ...; Margolin, Sara; Shen, Chen-Yang; Wu, Pei-Ei; Försti, Asta; Lenner, Per; Henriksson, Roge ...; Johansson, Rober ...; Enquist, Kerstin; Hallmans, Göran; Jonsson, Thorval ...; Sigurdsson, Helg ...; Alexiusdottir, K ...; Gudmundsson, Jul ...; Sigurdsson, Asge ...; Frigge, Michael ...; Gudmundsson, Lar ...; Kristjansson, Kr ...; Halldorsson, Bja ...; Styrkarsdottir, ...; Gulcher, Jeffrey ...; Lindblom, Annika; Kiemeney, Lamber ...; Mayordomo, Jose ...; Foekens, John A; Couch, Fergus J; Olopade, Olufunm ...; Gudbjartsson, Da ...; Thorsteinsdottir ...; Rafnar, Thorunn; Johannsson, Oska ...; Stefansson, Kari; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Hälsovetenskap; och Folkhälsovetensk ...

Artiklar i publikationen: PLoS genetics

Av lärosätet: Umeå universitet; Lunds universitet; Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se