The structure of a serpin–protease complex revealed by intramolecular distance measurements using donor–donor energy migration and mapping of interaction sites

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:umu-8572" > The structure of a ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Fa, MingUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik (författare)

The structure of a serpin–protease complex revealed by intramolecular distance measurements using donor–donor energy migration and mapping of interaction sites

Artikel/kapitelEngelska2000

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2000
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:umu-8572
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-8572URI
https://doi.org/10.1016/S0969-2126(00)00121-0DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Background: The inhibitors that belong to the serpin family are widely distributed regulatory molecules that include most protease inhibitors found in blood. It is generally thought that serpin inhibition involves reactive-centre cleavage, loop insertion and protease translocation, but different models of the serpin–protease complex have been proposed. In the absence of a spatial structure of a serpin–protease complex, a detailed understanding of serpin inhibition and the character of the virtually irreversible complex have remained controversial.Results: We used a recently developed method for making precise distance measurements, based on donor–donor energy migration (DDEM), to accurately triangulate the position of the protease urokinase-type plasminogen activator (uPA) in complex with the serpin plasminogen activator inhibitor type 1 (PAI-1). The distances from residue 344 (P3) in the reactive-centre loop of PAI-1 to residues 185, 266, 313 and 347 (P1′) were determined. Modelling of the complex using this distance information unequivocally placed residue 344 in a position at the distal end from the initial docking site with the reactive-centre loop fully inserted into β sheet A. To validate the model, seven single cysteine substitution mutants of PAI-1 were used to map sites of protease–inhibitor interaction by fluorescence depolarisation measurements of fluorophores attached to these residues and cross-linking using a sulphydryl-specific cross-linker.Conclusions: The data clearly demonstrate that serpin inhibition involves reactive-centre cleavage followed by full-loop insertion whereby the covalently linked protease is translocated from one pole of the inhibitor to the opposite one.

Ämnesord och genrebeteckningar

Cross-linking
Donor–donor energy migration
Fluorescence
Intramolecular distance
PAI-1
serpin

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Bergström, FredrikUmeå universitet,Kemiska institutionen (författare)
Hägglöf, PeterUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik (författare)
Wilczynska, MalgorzataUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)mawi0006 (författare)
Johansson, Lennart B-ÅUmeå universitet,Kemiska institutionen(Swepub:umu)lejo0007 (författare)
Ny, TorUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)tony0001 (författare)
Umeå universitetInstitutionen för medicinsk kemi och biofysik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Structure8:4, s. 397-405

Internetlänk

Hitta via bibliotek

The structure of a serpin–protease complex revealed by intramolecular distance m... (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Fa, Ming; Bergström, Fredr ...; Hägglöf, Peter; Wilczynska, Malg ...; Johansson, Lenna ...; Ny, Tor

Artiklar i publikationen: Structure

Av lärosätet: Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se