A dynamic interplay of nucleosome and Msn2 binding regulates kinetics of gene activation and repression following stress

Elfving, NilsUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik (författare)

The transcription factor Msn2 mediates a significant proportion of the environmental stress response, in which a common cohort of genes changes expression in a stereotypic fashion upon exposure to any of a wide variety of stresses. We have applied genome-wide chromatin immunoprecipitation and nucleosome profiling to determine where Msn2 binds under stressful conditions and how that binding affects, and is affected by, nucleosome positioning. We concurrently determined the effect of Msn2 activity on gene expression following stress and demonstrated that Msn2 stimulates both activation and repression. We found that some genes responded to both intermittent and continuous Msn2 nuclear occupancy while others responded only to continuous occupancy. Finally, these studies document a dynamic interplay between nucleosomes and Msn2 such that nucleosomes can restrict access of Msn2 to its canonical binding sites while Msn2 can promote reposition, expulsion and recruitment of nucleosomes to alter gene expression. This interplay may allow the cell to discriminate between different types of stress signaling.

Chereji, Razvan V. (författare)
Bharatula, Vasudha (författare)
Björklund, StefanUmeå universitet,Institutionen för medicinsk kemi och biofysik(Swepub:umu)stbj0001 (författare)
Morozov, Alexandre V. (författare)
Broach, James R. (författare)
Umeå universitetInstitutionen för medicinsk kemi och biofysik (creator_code:org_t)

Ingår i:Nucleic Acids Research: Oxford University Press (OUP)42:9, s. 5468-54820305-10481362-4962

Av författaren/redakt...: Elfving, Nils; Chereji, Razvan ...; Bharatula, Vasud ...; Björklund, Stefa ...; Morozov, Alexand ...; Broach, James R.

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.