SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Takahashi Harumi)
 

Sökning: WFRF:(Takahashi Harumi) > Johansson Britt Marie > Development of the ...

  • Ginya, Harumi (författare)

Development of the Handy Bio-Strand and its application to genotyping of OPRM1 (A118G)

  • Artikel/kapitelEngelska2007

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2007
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-103330
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-103330URI
  • https://doi.org/10.1016/j.ab.2007.04.052DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We previously developed a three-dimensional microarray system, the Bio-Strand, which exhibits advantages in automated DNA analysis in combination with our Magtration Technology. In the current study, we have developed a compact system for the Bio-Strand, the Handy Bio-Strand, which consists of several tools for the preparation of Bio-Strand Tip, hybridization, and detection. Using the Handy Bio-Strand, we performed single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping of OPRM1 (A118G) by allele-specific oligonucleotide competitive hybridization (ASOCH). DNA fragments containing SNP sites were amplified from genomic DNA by PCR and then were fixed on a microporous nylon thread. Thus, prepared Bio-Strand Tip was hybridized with allele-specific Cy5 probes (<15mer), on which the SNP site was designed to be located in the center. By optimizing the amount of competitors, the selectivity of Cy5 probes increased without a drastic signal decrease. OPRM1 (A118G) genotypes of 23 human genomes prepared from whole blood samples were determined by ASOCH using the Handy Bio-Strand. The results were perfectly consistent with those determined by PCR direct sequencing. ASOCH using the Handy Bio-Strand would be a very simple and reliable method for SNP genotyping for small laboratories and hospitals.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Asahina, Junko (författare)
  • Yoshida, Mamiko (författare)
  • Segawa, Osamu (författare)
  • Asano, Tsutomu (författare)
  • Ikeda, Hideo (författare)
  • Hatano, Yukiko Miyashita (författare)
  • Shishido, Madoka (författare)
  • Johansson, Britt-MarieUppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap (författare)
  • Zhou, QinUppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap(Swepub:uu)qinzhou (författare)
  • Hallberg, MathiasUppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap(Swepub:uu)mha03066 (författare)
  • Takahashi, Masaaki (författare)
  • Nyberg, FredUppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap(Swepub:uu)frednybe (författare)
  • Tajima, Hideji (författare)
  • Yohda, Masafumi (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för farmaceutisk biovetenskap (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Analytical Biochemistry: Elsevier BV367:1, s. 79-860003-26971096-0309

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy