SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Blomberg Björn)
 

Sökning: WFRF:(Blomberg Björn) > Toward a quantitati...

Toward a quantitative DNA-based definition of pneumococcal pneumonia : a comparison of Streptococcus pneumoniae target genes, with special reference to the Spn9802 fragment

Abdeldaim, Guma M. K. (författare)
Uppsala universitet,Klinisk bakteriologi
Strålin, Kristoffer (författare)
Olcén, Per (författare)
visa fler...
Blomberg, Jonas (författare)
Uppsala universitet,Klinisk virologi
Herrmann, Björn (författare)
Uppsala universitet,Klinisk bakteriologi
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Elsevier BV, 2008
2008
Engelska.
Ingår i: Diagnostic microbiology and infectious disease. - : Elsevier BV. - 0732-8893 .- 1879-0070. ; 60:2, s. 143-150
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The current shift from phenotypically toward genotypically based microbial diagnosis is not unproblematic. A novel quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) assay based on the Spn9802 DNA fragment was therefore developed for detection of Streptococcus pneumoniae. Out of 44 bacterial species, only S. pneumoniae and Streptococcus pseudopneumoniae were positive in Spn9802 PCR. In an evaluation on nasopharyngeal aspirates from 166 patients with community-acquired pneumonia, the assay was positive in 49 of 50 culture-positive cases. Of 19 culture-negative but Spn9802 PCR-positive cases, 12 were confirmed as S. pneumoniae by rnpB sequence analysis. With an expanded reference standard, including culture and rnpB sequencing, Spn9802 had a sensitivity of 94% and a specificity of 98%. A cutoff for clinically significant positivity was 10(4) DNA copies/mL, giving 71% sensitivity and 100% specificity. In conclusion, Spn9802 real-time PCR is highly sensitive and specific. The quantification it provides enables differentiation between pneumococcal pathogenicity and commensalism.

Nyckelord

S. pneumoniae
Pneumonia
Real-time PCR
Spn9802
MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy