SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Mikkelsen Tarjei S.)
 

Sökning: WFRF:(Mikkelsen Tarjei S.) > ZBED6, a novel tran...

  • Markljung, EllenUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (författare)

ZBED6, a novel transcription factor derived from a domesticated DNA transposon regulates IGF2 expression and muscle growth

  • Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2009-12-15
  • Public Library of Science (PLoS),2009
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-119579
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-119579URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1000256DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:119802850URI
  • https://res.slu.se/id/publ/28358URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • A single nucleotide substitution in intron 3 of IGF2 in pigs abrogates a binding site for a repressor and leads to a 3-fold up-regulation of IGF2 in skeletal muscle. The mutation has major effects on muscle growth, size of the heart, and fat deposition. Here, we have identified the repressor and find that the protein, named ZBED6, is previously unknown, specific for placental mammals, and derived from an exapted DNA transposon. Silencing of Zbed6 in mouse C2C12 myoblasts affected Igf2 expression, cell proliferation, wound healing, and myotube formation. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) sequencing using C2C12 cells identified about 2,500 ZBED6 binding sites in the genome, and the deduced consensus motif gave a perfect match with the established binding site in Igf2. Genes associated with ZBED6 binding sites showed a highly significant enrichment for certain Gene Ontology classifications, including development and transcriptional regulation. The phenotypic effects in mutant pigs and ZBED6-silenced C2C12 myoblasts, the extreme sequence conservation, its nucleolar localization, the broad tissue distribution, and the many target genes with essential biological functions suggest that ZBED6 is an important transcription factor in placental mammals, affecting development, cell proliferation, and growth.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Jiang, LinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)linji179 (författare)
  • Jaffe, Jacob D. (författare)
  • Mikkelsen, Tarjei S. (författare)
  • Wallerman, OlaUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)olwal516 (författare)
  • Larhammar, MartinUppsala universitet,Genetisk utvecklingsbiologi(Swepub:uu)marla278 (författare)
  • Zhang, Xiaolan (författare)
  • Wang, Li (författare)
  • Saenz-Vash, Veronica (författare)
  • Gnirke, Andreas (författare)
  • Lindroth, AndersSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics(Swepub:slu)51647 (författare)
  • Barrés, Romain (författare)
  • Yan, JieKarolinska Institutet (författare)
  • Strömberg, SaraUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
  • De, SachinandanUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (författare)
  • Pontén, FredrikUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)fredpont (författare)
  • Lander, Eric S. (författare)
  • Carr, Steven A. (författare)
  • Zierath, Juleen R.Karolinska Institutet (författare)
  • Kullander, KlasUppsala universitet,Genetisk utvecklingsbiologi(Swepub:uu)klkul255 (författare)
  • Wadelius, ClaesUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)claeswad (författare)
  • Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)kerli865 (författare)
  • Andersson, GöranSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics(Swepub:slu)50422 (författare)
  • Hjälm, GöranUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)gohja517 (författare)
  • Andersson, LeifSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,Uppsala University(Swepub:slu)48730 (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)
  • Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS biology: Public Library of Science (PLoS)7:12, s. e1000256-1544-91731545-7885

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy