SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Klasson Lisa)
 

Sökning: WFRF:(Klasson Lisa) > (2005-2009) > The mosaic genome s...

  • Klasson, LisaUppsala universitet,Molekylär evolution (författare)

The mosaic genome structure of the Wolbachia wRi strain infecting Drosophila simulans

  • Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2009-04-07
  • Proceedings of the National Academy of Sciences,2009
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-129130
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-129130URI
  • https://doi.org/10.1073/pnas.0810753106DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The obligate intracellular bacterium Wolbachia pipientis infects around 20% of all insect species. It is maternally inherited and induces reproductive alterations of insect populations by male killing, feminization, parthenogenesis, or cytoplasmic incompatibility. Here, we present the 1,445,873-bp genome of W. pipientis strain wRi that induces very strong cytoplasmic incompatibility in its natural host Drosophila simulans. A comparison with the previously sequenced genome of W. pipientis strain wMeI from Drosophila melanogaster identified 35 breakpoints associated with mobile elements and repeated sequences that are stable in Drosophila lines transinfected with wRi. Additionally, 450 genes with orthologs in wRi and wMeI were sequenced from the W. pipientis strain wUni, responsible for the induction of parthenogenesis in the parasitoid wasp Muscidifurax uniraptor. The comparison of these A-group Wolbachia strains uncovered the most highly recombining intracellular bacterial genomes known to date. This was manifested in a 500-fold variation in sequence divergences at synonymous sites, with different genes and gene segments supporting different strain relationships. The substitution-frequency profile resembled that of Neisseria meningitidis, which is characterized by rampant intraspecies recombination, rather than that of Rickettsia, where genes mostly diverge by nucleotide substitutions. The data further revealed diversification of ankyrin repeat genes by short tandem duplications and provided examples of horizontal gene transfer across A- and B- group strains that infect D. simulans. These results suggest that the transmission dynamics of Wolbachia and the opportunity for coinfections have created a freely recombining intracellular bacterial community with mosaic genomes.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Westberg, JoakimUppsala universitet,Molekylär evolution(Swepub:uu)joawe860 (författare)
  • Sapountzis, Panagiotis (författare)
  • Näslund, KristinaUppsala universitet,Molekylär evolution (författare)
  • Lutnaes, YlvaUppsala universitet,Molekylär evolution (författare)
  • Darby, Alistair C.Uppsala universitet,Molekylär evolution (författare)
  • Veneti, Zoe (författare)
  • Chen, Lanming (författare)
  • Braig, R. (författare)
  • Garrett, Roger (författare)
  • Bourtzis, Kostas (författare)
  • Andersson, Siv G. E.Uppsala universitet,Molekylär evolution(Swepub:uu)san07069 (författare)
  • Uppsala universitetMolekylär evolution (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America: Proceedings of the National Academy of Sciences106:14, s. 5725-57300027-84241091-6490

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy