SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Heger Andreas)
 

Sökning: WFRF:(Heger Andreas) > (2010-2014) > (2010) > Schielzeth Holger > Molecular evolution...

  • Nam, KiwoongUppsala universitet,Evolutionsbiologi (författare)

Molecular evolution of genes in avian genomes

  • Artikel/kapitelEngelska2010

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Springer Science and Business Media LLC,2010
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-134113
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-134113URI
  • https://doi.org/10.1186/gb-2010-11-6-r68DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background: Obtaining a draft genome sequence of the zebra finch (Taeniopygia guttata), the second bird genome to be sequenced, provides the necessary resource for whole-genome comparative analysis of gene sequence evolution in a non-mammalian vertebrate lineage. To analyze basic molecular evolutionary processes during avian evolution, and to contrast these with the situation in mammals, we aligned the protein-coding sequences of 8,384 1: 1 orthologs of chicken, zebra finch, a lizard and three mammalian species. Results: We found clear differences in the substitution rate at fourfold degenerate sites, being lowest in the ancestral bird lineage, intermediate in the chicken lineage and highest in the zebra finch lineage, possibly reflecting differences in generation time. We identified positively selected and/or rapidly evolving genes in avian lineages and found an over-representation of several functional classes, including anion transporter activity, calcium ion binding, cell adhesion and microtubule cytoskeleton. Conclusions: Focusing specifically on genes of neurological interest and genes differentially expressed in the unique vocal control nuclei of the songbird brain, we find a number of positively selected genes, including synaptic receptors. We found no evidence that selection for beneficial alleles is more efficient in regions of high recombination; in fact, there was a weak yet significant negative correlation between omega and recombination rate, which is in the direction predicted by the Hill-Robertson effect if slightly deleterious mutations contribute to protein evolution. These findings set the stage for studies of functional genetics of avian genes.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Mugal, CarinaUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)carmu820 (författare)
  • Nabholz, BenoitUppsala universitet,Evolutionsbiologi (författare)
  • Schielzeth, HolgerUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)holsc837 (författare)
  • Wolf, Jochen B. W.Uppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)jocwo442 (författare)
  • Backström, NiclasUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)nibac839 (författare)
  • Künstner, AxelUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)axeku570 (författare)
  • Balakrishnan, Christopher N. (författare)
  • Heger, Andreas (författare)
  • Ponting, Chris P. (författare)
  • Clayton, David F. (författare)
  • Ellegren, HansUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)hanselle (författare)
  • Uppsala universitetEvolutionsbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Biology: Springer Science and Business Media LLC11:6, s. R68-1474-760X1465-6906

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy