Design, synthesis and evaluation of peptide inhibitors of Mycobacterium tuberculosis ribonucleotide reductase

Mycobacterium tuberculosis ribonucleotide reductase (RNR) is a potential target for new antitubercular drugs. Herein we describe the synthesis and evaluation of peptide inhibitors of RNR derived from the C-terminus of the small subunit of M. tuberculosis RNR. An N-terminal truncation, an alanine scan and a novel statistical molecular design (SMD) approach based on the heptapeptide Ac-Glu-Asp-Asp-Asp-Trp-Asp-Phe-OH were applied in this study. The alanine scan showed that TrP5 and Phe7 were important for inhibitory potency. A quantitative structure relationship (QSAR) model was developed based on the synthesized peptides which showed that a negative charge in positions 2, 3, and 6 is beneficial for inhibitory potency. Finally, in position 5 the model coefficients indicate that there is room for a larger side chain., as compared to Trp5.

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Farmaceutiska vetenskaper hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Pharmaceutical Sciences hsv//eng
mycobacterium tuberculosis
ribonucleotide reductase
peptide inhibitors
alanine scan
statistical molecular design
structure activity relationships
FHDoE
PHARMACY
FARMACI

Roos, Annette KUppsala universitet,Strukturell molekylärbiologi(Swepub:uu)anroo424 (författare)
Muthas, DanielUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi(Swepub:uu)damut049 (författare)
Wahlström, ErikUppsala universitet,Strukturell molekylärbiologi (författare)
Ericsson, Daniel JUppsala universitet,Strukturell molekylärbiologi (författare)
Lundstedt, TorbjörnUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi(Swepub:uu)tolun677 (författare)
Unge, TorstenUppsala universitet,Strukturell molekylärbiologi(Swepub:uu)torsunge (författare)
Karlén, AndersUppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi(Swepub:uu)anderskl (författare)
Uppsala universitetInstitutionen för läkemedelskemi (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Nurbo, Johanna; Roos, Annette K; Muthas, Daniel; Wahlström, Erik; Ericsson, Daniel ...; Lundstedt, Torbj ...; visa fler...; Unge, Torsten; Karlén, Anders; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Farmaceutiska ve ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.