Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Conti David V.) > (2009) > Fischbach Michael A. > Genome sequence and...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Haas, Brian J. (författare)

Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans

Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2009-09-09
Springer Science and Business Media LLC,2009
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-148288
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-148288URI
https://doi.org/10.1038/nature08358DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-18764URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

QC 20100525
Phytophthora infestans is the most destructive pathogen of potato and a model organism for the oomycetes, a distinct lineage of fungus-like eukaryotes that are related to organisms such as brown algae and diatoms. As the agent of the Irish potato famine in the mid-nineteenth century, P. infestans has had a tremendous effect on human history, resulting in famine and population displacement(1). To this day, it affects world agriculture by causing the most destructive disease of potato, the fourth largest food crop and a critical alternative to the major cereal crops for feeding the world's population(1). Current annual worldwide potato crop losses due to late blight are conservatively estimated at $6.7 billion(2). Management of this devastating pathogen is challenged by its remarkable speed of adaptation to control strategies such as genetically resistant cultivars(3,4). Here we report the sequence of the P. infestans genome, which at similar to 240 megabases (Mb) is by far the largest and most complex genome sequenced so far in the chromalveolates. Its expansion results from a proliferation of repetitive DNA accounting for similar to 74% of the genome. Comparison with two other Phytophthora genomes showed rapid turnover and extensive expansion of specific families of secreted disease effector proteins, including many genes that are induced during infection or are predicted to have activities that alter host physiology. These fast-evolving effector genes are localized to highly dynamic and expanded regions of the P. infestans genome. This probably plays a crucial part in the rapid adaptability of the pathogen to host plants and underpins its evolutionary potential.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
Biology
Biologi
effector proteins

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Kamoun, Sophien (författare)
Zody, Michael C.Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)miczo266 (författare)
Jiang, Rays H. Y. (författare)
Handsaker, Robert E. (författare)
Cano, Liliana M. (författare)
Grabherr, Manfred (författare)
Kodira, Chinnappa D. (författare)
Raffaele, Sylvain (författare)
Torto-Alalibo, Trudy (författare)
Bozkurt, Tolga O. (författare)
Ah-Fong, Audrey M. V. (författare)
Alvarado, Lucia (författare)
Anderson, Vicky L. (författare)
Armstrong, Miles R. (författare)
Avrova, Anna (författare)
Baxter, Laura (författare)
Beynon, Jim (författare)
Boevink, Petra C. (författare)
Bollmann, Stephanie R. (författare)
Bos, Jorunn I. B. (författare)
Bulone, VincentKTH,Glykovetenskap(Swepub:kth)u13o1auq (författare)
Cai, Guohong (författare)
Cakir, Cahid (författare)
Carrington, James C. (författare)
Chawner, Megan (författare)
Conti, Lucio (författare)
Costanzo, Stefano (författare)
Ewan, Richard (författare)
Fahlgren, Noah (författare)
Fischbach, Michael A. (författare)
Fugelstad, JohannaKTH,Glykovetenskap(Swepub:kth)u19ifqej (författare)
Gilroy, Eleanor M. (författare)
Gnerre, Sante (författare)
Green, Pamela J. (författare)
Grenville-Briggs, Laura J. (författare)
Griffith, John (författare)
Gruenwald, Niklaus J. (författare)
Horn, Karolyn (författare)
Horner, Neil R. (författare)
Hu, Chia-Hui (författare)
Huitema, Edgar (författare)
Jeong, Dong-Hoon (författare)
Jones, Alexandra M. E. (författare)
Jones, Jonathan D. G. (författare)
Jones, Richard W. (författare)
Karlsson, Elinor K. (författare)
Kunjeti, Sridhara G. (författare)
Lamour, Kurt (författare)
Liu, Zhenyu (författare)
Ma, LiJun (författare)
MacLean, Daniel (författare)
Chibucos, Marcus C. (författare)
McDonald, Hayes (författare)
McWalters, Jessica (författare)
Meijer, Harold J. G. (författare)
Morgan, William (författare)
Morris, Paul F. (författare)
Munro, Carol A. (författare)
O'Neill, Keith (författare)
Ospina-Giraldo, Manuel (författare)
Pinzon, Andres (författare)
Pritchard, Leighton (författare)
Ramsahoye, Bernard (författare)
Ren, Qinghu (författare)
Restrepo, Silvia (författare)
Roy, Sourav (författare)
Sadanandom, Ari (författare)
Savidor, Alon (författare)
Schornack, Sebastian (författare)
Schwartz, David C. (författare)
Schumann, Ulrike D. (författare)
Schwessinger, Ben (författare)
Seyer, Lauren (författare)
Sharpe, Ted (författare)
Silvar, Cristina (författare)
Song, Jing (författare)
Studholme, David J. (författare)
Sykes, Sean (författare)
Thines, Marco (författare)
van de Vondervoort, Peter J. I. (författare)
Phuntumart, Vipaporn (författare)
Wawra, Stephan (författare)
Weide, Rob (författare)
Win, Joe (författare)
Young, Carolyn (författare)
Zhou, Shiguo (författare)
Fry, William (författare)
Meyers, Blake C. (författare)
van West, Pieter (författare)
Ristaino, Jean (författare)
Govers, Francine (författare)
Birch, Paul R. J. (författare)
Whisson, Stephen C. (författare)
Judelson, Howard S. (författare)
Nusbaum, Chad (författare)
Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC461:7262, s. 393-3980028-08361476-4687

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Haas, Brian J.; Kamoun, Sophien; Zody, Michael C.; Jiang, Rays H. Y ...; Handsaker, Rober ...; Cano, Liliana M.; visa fler...; Grabherr, Manfre ...; Kodira, Chinnapp ...; Raffaele, Sylvai ...; Torto-Alalibo, T ...; Bozkurt, Tolga O ...; Ah-Fong, Audrey ...; Alvarado, Lucia; Anderson, Vicky ...; Armstrong, Miles ...; Avrova, Anna; Baxter, Laura; Beynon, Jim; Boevink, Petra C ...; Bollmann, Stepha ...; Bos, Jorunn I. B ...; Bulone, Vincent; Cai, Guohong; Cakir, Cahid; Carrington, Jame ...; Chawner, Megan; Conti, Lucio; Costanzo, Stefan ...; Ewan, Richard; Fahlgren, Noah; Fischbach, Micha ...; Fugelstad, Johan ...; Gilroy, Eleanor ...; Gnerre, Sante; Green, Pamela J.; Grenville-Briggs ...; Griffith, John; Gruenwald, Nikla ...; Horn, Karolyn; Horner, Neil R.; Hu, Chia-Hui; Huitema, Edgar; Jeong, Dong-Hoon; Jones, Alexandra ...; Jones, Jonathan ...; Jones, Richard W ...; Karlsson, Elinor ...; Kunjeti, Sridhar ...; Lamour, Kurt; Liu, Zhenyu; Ma, LiJun; MacLean, Daniel; Chibucos, Marcus ...; McDonald, Hayes; McWalters, Jessi ...; Meijer, Harold J ...; Morgan, William; Morris, Paul F.; Munro, Carol A.; O'Neill, Keith; Ospina-Giraldo, ...; Pinzon, Andres; Pritchard, Leigh ...; Ramsahoye, Berna ...; Ren, Qinghu; Restrepo, Silvia; Roy, Sourav; Sadanandom, Ari; Savidor, Alon; Schornack, Sebas ...; Schwartz, David ...; Schumann, Ulrike ...; Schwessinger, Be ...; Seyer, Lauren; Sharpe, Ted; Silvar, Cristina; Song, Jing; Studholme, David ...; Sykes, Sean; Thines, Marco; van de Vondervoo ...; Phuntumart, Vipa ...; Wawra, Stephan; Weide, Rob; Win, Joe; Young, Carolyn; Zhou, Shiguo; Fry, William; Meyers, Blake C.; van West, Pieter; Ristaino, Jean; Govers, Francine; Birch, Paul R. J ...; Whisson, Stephen ...; Judelson, Howard ...; Nusbaum, Chad; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

Artiklar i publikationen: Nature

Av lärosätet: Uppsala universitet; Kungliga Tekniska Högskolan

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se