SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-154280"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-154280" > GWAS of Follicular ...

  • Smedby, Karin E.Karolinska Institutet (författare)

GWAS of Follicular Lymphoma Reveals Allelic Heterogeneity at 6p21.32 and Suggests Shared Genetic Susceptibility with Diffuse Large B-cell Lymphoma

  • Artikel/kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011-04-21
  • Public Library of Science (PLoS),2011
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-154280
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-154280URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1001378DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:122562197URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Non-Hodgkin lymphoma (NHL) represents a diverse group of hematological malignancies, of which follicular lymphoma (FL) is a prevalent subtype. A previous genome-wide association study has established a marker, rs10484561 in the human leukocyte antigen (HLA) class II region on 6p21.32 associated with increased FL risk. Here, in a three-stage genome-wide association study, starting with a genome-wide scan of 379 FL cases and 791 controls followed by validation in 1,049 cases and 5,790 controls, we identified a second independent FL-associated locus on 6p21.32, rs2647012 (ORcombined = 0.64, P-combined= 2x10(-21)) located 962 bp away from rs10484561 (r(2)< 0.1 in controls). After mutual adjustment, the associations at the two SNPs remained genome-wide significant (rs2647012: ORadjusted = 0.70, P-adjusted= 4x10(-12); rs10484561: ORadjusted = 1.64, P-adjusted= 5x10(-15)). Haplotype and coalescence analyses indicated that rs2647012 arose on an evolutionarily distinct haplotype from that of rs10484561 and tags a novel allele with an opposite (protective) effect on FL risk. Moreover, in a follow-up analysis of the top 6 FL-associated SNPs in 4,449 cases of other NHL subtypes, rs10484561 was associated with risk of diffuse large B-cell lymphoma (ORcombined = 1.36, P-combined = 1.4x10(-7)). Our results reveal the presence of allelic heterogeneity within the HLA class II region influencing FL susceptibility and indicate a possible shared genetic etiology with diffuse large B-cell lymphoma. These findings suggest that the HLA class II region plays a complex yet important role in NHL.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Foo, Jia Nee (författare)
  • Skibola, Christine F. (författare)
  • Darabi, HatefKarolinska Institutet (författare)
  • Conde, Lucia (författare)
  • Hjalgrim, HenrikKarolinska Institutet (författare)
  • Kumar, Vikrant (författare)
  • Chang, Ellen T. (författare)
  • Rothman, Nathaniel (författare)
  • Cerhan, James R. (författare)
  • Brooks-Wilson, Angela R. (författare)
  • Rehnberg, Emil (författare)
  • Irwan, Ishak D. (författare)
  • Ryder, Lars P.Karolinska Institutet (författare)
  • Brown, Peter N. (författare)
  • Bracci, Paige M. (författare)
  • Agana, Luz (författare)
  • Riby, Jacques (författare)
  • Cozen, Wendy (författare)
  • Davis, Scott (författare)
  • Hartge, Patricia (författare)
  • Morton, Lindsay M. (författare)
  • Severson, Richard K. (författare)
  • Wang, Sophia S. (författare)
  • Slager, Susan L. (författare)
  • Fredericksen, Zachary S. (författare)
  • Novak, Anne J. (författare)
  • Kay, Neil E. (författare)
  • Habermann, Thomas M. (författare)
  • Armstrong, Bruce (författare)
  • Kricker, Anne (författare)
  • Milliken, Sam (författare)
  • Purdue, Mark P. (författare)
  • Vajdic, Claire M. (författare)
  • Boyle, Peter (författare)
  • Lan, Qing (författare)
  • Zahm, Shelia H. (författare)
  • Zhang, Yawei (författare)
  • Zheng, Tongzhang (författare)
  • Leach, Stephen (författare)
  • Spinelli, John J. (författare)
  • Smith, Martyn T. (författare)
  • Chanock, Stephen J. (författare)
  • Padyukov, Leonid (författare)
  • Alfredsson, LarsKarolinska Institutet (författare)
  • Klareskog, LarsKarolinska Institutet (författare)
  • Glimelius, BengtUppsala universitet,Enheten för onkologi(Swepub:uu)bengglim (författare)
  • Melbye, Mads (författare)
  • Liu, Edison T. (författare)
  • Adami, Hans-Olov (författare)
  • Humphreys, KeithKarolinska Institutet (författare)
  • Liu, Jianjun (författare)
  • Karolinska InstitutetEnheten för onkologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS Genetics: Public Library of Science (PLoS)7:4, s. e1001378-1553-73901553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy