SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Wilcox D.)
 

Sökning: WFRF:(Wilcox D.) > Butyrate mediates d...

  • Rada-Iglesias, AlvaroUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)

Butyrate mediates decrease of histone acetylation centered on transcription start sites and down-regulation of associated genes

  • Artikel/kapitelEngelska2007

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2007-06-13
  • Cold Spring Harbor Laboratory,2007
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-17397
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-17397URI
  • https://doi.org/10.1101/gr.5540007DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Butyrate is a histone deacetylase inhibitor (HDACi) with anti-neoplastic properties, which theoretically reactivates epigenetically silenced genes by increasing global histone acetylation. However, recent studies indicate that a similar number or even more genes are down-regulated than up-regulated by this drug. We treated hepatocarcinoma HepG2 cells with butyrate and characterized the levels of acetylation at DNA-bound histones H3 and H4 by ChIP-chip along the ENCODE regions. In contrast to the global increases of histone acetylation, many genomic regions close to transcription start sites were deacetylated after butyrate exposure. In order to validate these findings, we found that both butyrate and trichostatin A treatment resulted in histone deacetylation at selected regions, while nucleosome loss or changes in histone H3 lysine 4 trimethylation (H3K4me3) did not occur in such locations. Furthermore, similar histone deacetylation events were observed when colon adenocarcinoma HT-29 cells were treated with butyrate. In addition, genes with deacetylated promoters were down-regulated by butyrate, and this was mediated at the transcriptional level by affecting RNA polymerase II (POLR2A) initiation/elongation. Finally, the global increase in acetylated histones was preferentially localized to the nuclear periphery, indicating that it might not be associated to euchromatin. Our results are significant for the evaluation of HDACi as anti-tumourogenic drugs, suggesting that previous models of action might need to be revised, and provides an explanation for the frequently observed repression of many genes during HDACi treatment.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
  • NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
  • Acetylation/drug effects
  • Adenocarcinoma/*metabolism
  • Butyrates/*pharmacology
  • Cell Line; Tumor
  • Colonic Neoplasms/*metabolism
  • Enzyme Inhibitors/*pharmacology
  • Gene Expression Profiling
  • Gene Expression Regulation; Neoplastic/*drug effects
  • Histone Deacetylases/antagonists & inhibitors/metabolism
  • Histones/*metabolism
  • Humans
  • Neoplasm Proteins/*metabolism
  • Oligonucleotide Array Sequence Analysis
  • Protein Processing; Post-Translational/*drug effects
  • MEDICINE
  • MEDICIN
  • Biology
  • Biologi

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Enroth, StefanUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)stenr451 (författare)
  • Ameur, AdamUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)adame789 (författare)
  • Koch, Christoph M. (författare)
  • Clelland, Gayle K. (författare)
  • Respuela-Alonso, PatriciaUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
  • Wilcox, Sarah (författare)
  • Dovey, Oliver M. (författare)
  • Ellis, Peter D. (författare)
  • Langford, Cordelia F. (författare)
  • Dunham, Ian (författare)
  • Komorowski, JanUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)jakom133 (författare)
  • Wadelius, ClaesUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)claeswad (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för genetik och patologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Research: Cold Spring Harbor Laboratory17:6, s. 708-7191088-90511549-5469

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy