Sökning: WFRF:(Stricker Bruno H. C.) >
Genome-Wide Joint M...
-
Hancock, Dana B
(författare)
Genome-Wide Joint Meta-Analysis of SNP and SNP-by-Smoking Interaction Identifies Novel Loci for Pulmonary Function
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2012-12-20
-
Public Library of Science (PLoS),2012
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-191199
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-191199URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003098DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Genome-wide association studies have identified numerous genetic loci for spirometic measures of pulmonary function, forced expiratory volume in one second (FEV1), and its ratio to forced vital capacity (FEV1/FVC). Given that cigarette smoking adversely affects pulmonary function, we conducted genome-wide joint meta-analyses (JMA) of single nucleotide polymorphism (SNP) and SNP-by-smoking (ever-smoking or pack-years) associations on FEV1 and FEV1/FVC across 19 studies (total N = 50,047). We identified three novel loci not previously associated with pulmonary function. SNPs in or near DNER (smallest PJMA = 5.00×10−11), HLA-DQB1 and HLA-DQA2 (smallest PJMA = 4.35×10−9), and KCNJ2 and SOX9 (smallest PJMA = 1.28×10−8) were associated with FEV1/FVC or FEV1 in meta-analysis models including SNP main effects, smoking main effects, and SNP-by-smoking (ever-smoking or pack-years) interaction. The HLA region has been widely implicated for autoimmune and lung phenotypes, unlike the other novel loci, which have not been widely implicated. We evaluated DNER, KCNJ2, and SOX9 and found them to be expressed in human lung tissue. DNER and SOX9 further showed evidence of differential expression in human airway epithelium in smokers compared to non-smokers. Our findings demonstrated that joint testing of SNP and SNP-by-environment interaction identified novel loci associated with complex traits that are missed when considering only the genetic main effects.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Artigas, María Soler
(författare)
-
Gharib, Sina A
(författare)
-
Henry, Amanda
(författare)
-
Manichaikul, Ani
(författare)
-
Ramasamy, Adaikalavan
(författare)
-
Loth, Daan W
(författare)
-
Imboden, Medea
(författare)
-
Koch, Beate
(författare)
-
McArdle, Wendy L
(författare)
-
Smith, Albert V
(författare)
-
Smolonska, Joanna
(författare)
-
Sood, Akshay
(författare)
-
Tang, Wenbo
(författare)
-
Wilk, Jemma B
(författare)
-
Zhai, Guangju
(författare)
-
Zhao, Jing Hua
(författare)
-
Aschard, Hugues
(författare)
-
Burkart, Kristin M
(författare)
-
Curjuric, Ivan
(författare)
-
Eijgelsheim, Mark
(författare)
-
Elliott, Paul
(författare)
-
Gu, Xiangjun
(författare)
-
Harris, Tamara B
(författare)
-
Janson, ChristerUppsala universitet,Lungmedicin och allergologi,Lung och allergifoskning(Swepub:uu)chrisjn
(författare)
-
Homuth, Georg
(författare)
-
Hysi, Pirro G
(författare)
-
Liu, Jason Z
(författare)
-
Loehr, Laura R
(författare)
-
Lohman, Kurt
(författare)
-
Loos, Ruth J F
(författare)
-
Manning, Alisa K
(författare)
-
Marciante, Kristin D
(författare)
-
Obeidat, Ma'en
(författare)
-
Postma, Dirkje S
(författare)
-
Aldrich, Melinda C
(författare)
-
Brusselle, Guy G
(författare)
-
Chen, Ting-Hsu
(författare)
-
Eiriksdottir, Gudny
(författare)
-
Franceschini, Nora
(författare)
-
Heinrich, Joachim
(författare)
-
Rotter, Jerome I
(författare)
-
Wijmenga, Cisca
(författare)
-
Williams, O Dale
(författare)
-
Bentley, Amy R
(författare)
-
Hofman, Albert
(författare)
-
Laurie, Cathy C
(författare)
-
Lumley, Thomas
(författare)
-
Morrison, Alanna C
(författare)
-
Joubert, Bonnie R
(författare)
-
Rivadeneira, Fernando
(författare)
-
Couper, David J
(författare)
-
Kritchevsky, Stephen B
(författare)
-
Liu, Yongmei
(författare)
-
Wjst, Matthias
(författare)
-
Wain, Louise V
(författare)
-
Vonk, Judith M
(författare)
-
Uitterlinden, André G
(författare)
-
Rochat, Thierry
(författare)
-
Rich, Stephen S
(författare)
-
Psaty, Bruce M
(författare)
-
O'Connor, George T
(författare)
-
North, Kari E
(författare)
-
Mirel, Daniel B
(författare)
-
Meibohm, Bernd
(författare)
-
Launer, Lenore J
(författare)
-
Khaw, Kay-Tee
(författare)
-
Hartikainen, Anna-Liisa
(författare)
-
Hammond, Christopher J
(författare)
-
Gläser, Sven
(författare)
-
Marchini, Jonathan
(författare)
-
Kraft, Peter
(författare)
-
Wareham, Nicholas J
(författare)
-
Völzke, Henry
(författare)
-
Stricker, Bruno H C
(författare)
-
Spector, Timothy D
(författare)
-
Probst-Hensch, Nicole M
(författare)
-
Jarvis, Deborah
(författare)
-
Jarvelin, Marjo-Riitta
(författare)
-
Heckbert, Susan R
(författare)
-
Gudnason, Vilmundur
(författare)
-
Boezen, H Marike
(författare)
-
Barr, R Graham
(författare)
-
Cassano, Patricia A
(författare)
-
Strachan, David P
(författare)
-
Fornage, Myriam
(författare)
-
Hall, Ian P
(författare)
-
Dupuis, Josée
(författare)
-
Tobin, Martin D
(författare)
-
London, Stephanie J
(författare)
-
Uppsala universitetLungmedicin och allergologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLoS genetics: Public Library of Science (PLoS)8:12, s. e1003098-1553-7404
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Hancock, Dana B
-
Artigas, María S ...
-
Gharib, Sina A
-
Henry, Amanda
-
Manichaikul, Ani
-
Ramasamy, Adaika ...
-
visa fler...
-
Loth, Daan W
-
Imboden, Medea
-
Koch, Beate
-
McArdle, Wendy L
-
Smith, Albert V
-
Smolonska, Joann ...
-
Sood, Akshay
-
Tang, Wenbo
-
Wilk, Jemma B
-
Zhai, Guangju
-
Zhao, Jing Hua
-
Aschard, Hugues
-
Burkart, Kristin ...
-
Curjuric, Ivan
-
Eijgelsheim, Mar ...
-
Elliott, Paul
-
Gu, Xiangjun
-
Harris, Tamara B
-
Janson, Christer
-
Homuth, Georg
-
Hysi, Pirro G
-
Liu, Jason Z
-
Loehr, Laura R
-
Lohman, Kurt
-
Loos, Ruth J F
-
Manning, Alisa K
-
Marciante, Krist ...
-
Obeidat, Ma'en
-
Postma, Dirkje S
-
Aldrich, Melinda ...
-
Brusselle, Guy G
-
Chen, Ting-Hsu
-
Eiriksdottir, Gu ...
-
Franceschini, No ...
-
Heinrich, Joachi ...
-
Rotter, Jerome I
-
Wijmenga, Cisca
-
Williams, O Dale
-
Bentley, Amy R
-
Hofman, Albert
-
Laurie, Cathy C
-
Lumley, Thomas
-
Morrison, Alanna ...
-
Joubert, Bonnie ...
-
Rivadeneira, Fer ...
-
Couper, David J
-
Kritchevsky, Ste ...
-
Liu, Yongmei
-
Wjst, Matthias
-
Wain, Louise V
-
Vonk, Judith M
-
Uitterlinden, An ...
-
Rochat, Thierry
-
Rich, Stephen S
-
Psaty, Bruce M
-
O'Connor, George ...
-
North, Kari E
-
Mirel, Daniel B
-
Meibohm, Bernd
-
Launer, Lenore J
-
Khaw, Kay-Tee
-
Hartikainen, Ann ...
-
Hammond, Christo ...
-
Gläser, Sven
-
Marchini, Jonath ...
-
Kraft, Peter
-
Wareham, Nichola ...
-
Völzke, Henry
-
Stricker, Bruno ...
-
Spector, Timothy ...
-
Probst-Hensch, N ...
-
Jarvis, Deborah
-
Jarvelin, Marjo- ...
-
Heckbert, Susan ...
-
Gudnason, Vilmun ...
-
Boezen, H Marike
-
Barr, R Graham
-
Cassano, Patrici ...
-
Strachan, David ...
-
Fornage, Myriam
-
Hall, Ian P
-
Dupuis, Josée
-
Tobin, Martin D
-
London, Stephani ...
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
PLoS genetics
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet