Genetic architecture of spring and autumn phenology in Salix

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Rönnberg Wästljung Ann Christin) > Genetic architectur...

Ghelardini, LuisaSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology (författare)

Genetic architecture of spring and autumn phenology in Salix

Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2014-01-17
Springer Science and Business Media LLC,2014
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-224929
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-224929URI
https://doi.org/10.1186/1471-2229-14-31DOI
https://res.slu.se/id/publ/52160URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Background: In woody plants from temperate regions, adaptation to the local climate results in annual cycles of growth and dormancy, and optimal regulation of these cycles are critical for growth, long-term survival, and competitive success. In this study we have investigated the genetic background to growth phenology in a Salix pedigree by assessing genetic and phenotypic variation in growth cessation, leaf senescence and bud burst in different years and environments. A previously constructed linkage map using the same pedigree and anchored to the annotated genome of P. trichocarpa was improved in target regions and used for QTL analysis of the traits. The major aims in this study were to map QTLs for phenology traits in Salix, and to identify candidate genes in QTL hot spots through comparative mapping with the closely related Populus trichocarpa. Results: All traits varied significantly among genotypes and the broad-sense heritabilities ranged between 0.5 and 0.9, with the highest for leaf senescence. In total across experiment and years, 80 QTLs were detected. For individual traits, the QTLs explained together from 21.5 to 56.5% of the variation. Generally each individual QTL explained a low amount of the variation but three QTLs explained above 15% of the variation with one QTL for leaf senescence explaining 34% of the variation. The majority of the QTLs were recurrently identified across traits, years and environments. Two hotspots were identified on linkage group (LG) II and X where narrow QTLs for all traits co-localized. Conclusions: This study provides the most detailed analysis of QTL detection for phenology in Salix conducted so far. Several hotspot regions were found where QTLs for different traits and QTLs for the same trait but identified during different years co-localised. Many QTLs co-localised with QTLs found in poplar for similar traits that could indicate common pathways for these traits in Salicaceae. This study is an important first step in identifying QTLs and candidate genes for phenology traits in Salix.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Ekologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Ecology hsv//eng
LANTBRUKSVETENSKAPER Bioteknologi med applikationer på växter och djur Genetik och förädling inom lantbruksvetenskap hsv//swe
AGRICULTURAL SCIENCES Agricultural Biotechnology Genetics and Breeding in Agricultural Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Botanik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Botany hsv//eng
LANTBRUKSVETENSKAPER Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske Skogsvetenskap hsv//swe
AGRICULTURAL SCIENCES Agriculture, Forestry and Fisheries Forest Science hsv//eng
Phenology
Adaptation
Salix
QTL
Candidate genes

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Berlin Kolm, SofiaSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)48551 (författare)
Weih, MartinSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtproduktionsekologi,Department of Crop Production Ecology(Swepub:slu)49551 (författare)
Lagercrantz, UlfUppsala universitet,Växtekologi och evolution(Swepub:uu)ullag839 (författare)
Gyllenstrand, NiclasSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)47366 (författare)
Rönnberg Wästljung, Ann-ChristinSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för växtbiologi,Department of Plant Biology(Swepub:slu)48124 (författare)
Sveriges lantbruksuniversitetInstitutionen för växtbiologi (creator_code:org_t)
Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

Ingår i:BMC Plant Biology: Springer Science and Business Media LLC14, s. 31-1471-2229

Internetlänk

Hitta via bibliotek

BMC Plant Biology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Ghelardini, Luis ...; Berlin Kolm, Sof ...; Weih, Martin; Lagercrantz, Ulf; Gyllenstrand, Ni ...; Rönnberg Wästlju ...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Ekologi

LANTBRUKSVETENSKAPER: LANTBRUKSVETENSK ...; och Bioteknologi med ...; och Genetik och förä ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Botanik

LANTBRUKSVETENSKAPER: LANTBRUKSVETENSK ...; och Lantbruksvetensk ...; och Skogsvetenskap

Artiklar i publikationen: BMC Plant Biolog ...

Av lärosätet: Uppsala universitet; Sveriges Lantbruksuniversitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se