A rapid two-step algorithm detects and identifies clinical macrolide and beta-lactam antibiotic resistance in clinical bacterial isolates

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-228977" > A rapid two-step al...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Lu, Xuedong (författare)

A rapid two-step algorithm detects and identifies clinical macrolide and beta-lactam antibiotic resistance in clinical bacterial isolates

Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier BV,2014
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-228977
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-228977URI
https://doi.org/10.1016/j.mimet.2014.04.006DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Purpose: Aiming to identify macrolide and beta-lactam resistance in clinical bacterial isolates rapidly and accurately, a two-step algorithm was developed based on detection of eight antibiotic resistance genes. Methods: Targeting at genes linked to bacterial macrolide (msrA, ermA, ermB, and ermC) and beta-lactam (bla(TEM), bla(SHV), bla(CTX-N-1), bin(CTX-M-9)) antibiotic resistances, this method includes a multiplex real-time PCR, a melting temperature profile analysis as well as a liquid bead microarray assay. Liquid bead microarray assay is applied only when indistinguishable T-m profile is observed. Results: The clinical validity of this method was assessed on clinical bacterial isolates. Among the total 580 isolates that were determined by our diagnostic method, 75% of them were identified by the multiplex real-time PCR with melting temperature analysis alone, while the remaining 25% required both multiplex real-time PCR with melting temperature analysis and liquid bead microarray assay for identification. Compared with the traditional phenotypic antibiotic susceptibility test, an overall agreement of 81.2% (kappa = 0.614, 95% Cl = 0550-0.679) was observed, with a sensitivity and specificity of 87.7% and 73% respectively. Besides, the average test turnaround time is 3.9 h, which is much shorter in comparison with more than 24 h for the traditional phenotypic tests. Conclusions: Having the advantages of the shorter operating time and comparable high sensitivity and specificity with the traditional phenotypic test, our two-step algorithm provides an efficient tool for rapid determination of macrolide and beta-lactam antibiotic resistances in clinical bacterial isolates.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Cellbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Cell Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng
Two-step algorithm
Antibiotic resistance genes
Clinical bacterial isolates

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Nie, Shuping (författare)
Xia, Chengjing (författare)
Huang, Lie (författare)
He, Ying (författare)
Wu, Runxiang (författare)
Zhang, LiUppsala universitet,Struktur- och molekylärbiologi(Swepub:uu)liazh702 (författare)
Uppsala universitetStruktur- och molekylärbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Journal of Microbiological Methods: Elsevier BV102, s. 26-310167-70121872-8359

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Journal of Microbiological Methods (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Lu, Xuedong; Nie, Shuping; Xia, Chengjing; Huang, Lie; He, Ying; Wu, Runxiang; visa fler...; Zhang, Li; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Cellbiologi

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

Artiklar i publikationen: Journal of Micro ...

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se