Large-Scale Genome-Wide Association Studies and Meta-Analyses of Longitudinal Change in Adult Lung Function

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Koch Holger M.) > Large-Scale Genome-...

Tang, Wenbo (författare)

Large-Scale Genome-Wide Association Studies and Meta-Analyses of Longitudinal Change in Adult Lung Function

Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2014-07-01
Public Library of Science (PLoS),2014
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-231328
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-231328URI
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0100776DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Background: Genome-wide association studies (GWAS) have identified numerous loci influencing cross-sectional lung function, but less is known about genes influencing longitudinal change in lung function. Methods: We performed GWAS of the rate of change in forced expiratory volume in the first second (FEV1) in 14 longitudinal, population-based cohort studies comprising 27,249 adults of European ancestry using linear mixed effects model and combined cohort-specific results using fixed effect meta-analysis to identify novel genetic loci associated with longitudinal change in lung function. Gene expression analyses were subsequently performed for identified genetic loci. As a secondary aim, we estimated the mean rate of decline in FEV1 by smoking pattern, irrespective of genotypes, across these 14 studies using meta-analysis. Results: The overall meta-analysis produced suggestive evidence for association at the novel IL16/STARD5/TMC3 locus on chromosome 15 (P = 5.71 x 10(-7)). In addition, meta-analysis using the five cohorts with >= 3 FEV1 measurements per participant identified the novel ME3 locus on chromosome 11 (P = 2.18 x 10(-8)) at genome-wide significance. Neither locus was associated with FEV1 decline in two additional cohort studies. We confirmed gene expression of IL16, STARD5, and ME3 in multiple lung tissues. Publicly available microarray data confirmed differential expression of all three genes in lung samples from COPD patients compared with controls. Irrespective of genotypes, the combined estimate for FEV1 decline was 26.9, 29.2 and 35.7 mL/year in never, former, and persistent smokers, respectively. Conclusions: In this large-scale GWAS, we identified two novel genetic loci in association with the rate of change in FEV1 that harbor candidate genes with biologically plausible functional links to lung function.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Kowgier, Matthew (författare)
Loth, Daan W. (författare)
Artigas, Maria Soler (författare)
Joubert, Bonnie R. (författare)
Hodge, Emily (författare)
Gharib, Sina A. (författare)
Smith, Albert V. (författare)
Ruczinski, Ingo (författare)
Gudnason, Vilmundur (författare)
Mathias, Rasika A. (författare)
Harris, Tamara B. (författare)
Hansel, Nadia N. (författare)
Launer, Lenore J. (författare)
Barnes, Kathleen C. (författare)
Hansen, Joyanna G. (författare)
Albrecht, Eva (författare)
Aldrich, Melinda C. (författare)
Allerhand, Michael (författare)
Barr, R. Graham (författare)
Brusselle, Guy G. (författare)
Couper, David J. (författare)
Curjuric, Ivan (författare)
Davies, Gail (författare)
Deary, Ian J. (författare)
Dupuis, Josee (författare)
Fall, ToveUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)tovfa878 (författare)
Foy, Millennia (författare)
Franceschini, Nora (författare)
Gao, Wei (författare)
Glaeser, Sven (författare)
Gu, Xiangjun (författare)
Hancock, Dana B. (författare)
Heinrich, Joachim (författare)
Hofman, Albert (författare)
Imboden, Medea (författare)
Ingelsson, ErikUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ering425 (författare)
James, Alan (författare)
Karrasch, Stefan (författare)
Koch, Beate (författare)
Kritchevsky, Stephen B. (författare)
Kumar, Ashish (författare)
Lahousse, Lies (författare)
Li, Guo (författare)
Lind, LarsUppsala universitet,Kardiovaskulär epidemiologi(Swepub:uu)larslind (författare)
Lindgren, Cecilia (författare)
Liu, Yongmei (författare)
Lohman, Kurt (författare)
Lumley, Thomas (författare)
McArdle, Wendy L. (författare)
Meibohm, Bernd (författare)
Morris, Andrew P. (författare)
Morrison, Alanna C. (författare)
Musk, Bill (författare)
North, Kari E. (författare)
Palmer, Lyle J. (författare)
Probst-Hensch, Nicole M. (författare)
Psaty, Bruce M. (författare)
Rivadeneira, Fernando (författare)
Rotter, Jerome I. (författare)
Schulz, Holger (författare)
Smith, Lewis J. (författare)
Sood, Akshay (författare)
Starr, John M. (författare)
Strachan, David P. (författare)
Teumer, Alexander (författare)
Uitterlinden, Andre G. (författare)
Voelzke, Henry (författare)
Voorman, Arend (författare)
Wain, Louise V. (författare)
Wells, Martin T. (författare)
Wilk, Jemma B. (författare)
Williams, O. Dale (författare)
Heckbert, Susan R. (författare)
Stricker, Bruno H. (författare)
London, Stephanie J. (författare)
Fornage, Myriam (författare)
Tobin, Martin D. (författare)
O'Connor, George T. (författare)
Hall, Ian P. (författare)
Cassano, Patricia A. (författare)
Uppsala universitetMolekylär epidemiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)9:7, s. e100776-1932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Tang, Wenbo; Kowgier, Matthew; Loth, Daan W.; Artigas, Maria S ...; Joubert, Bonnie ...; Hodge, Emily; visa fler...; Gharib, Sina A.; Smith, Albert V.; Ruczinski, Ingo; Gudnason, Vilmun ...; Mathias, Rasika ...; Harris, Tamara B ...; Hansel, Nadia N.; Launer, Lenore J ...; Barnes, Kathleen ...; Hansen, Joyanna ...; Albrecht, Eva; Aldrich, Melinda ...; Allerhand, Micha ...; Barr, R. Graham; Brusselle, Guy G ...; Couper, David J.; Curjuric, Ivan; Davies, Gail; Deary, Ian J.; Dupuis, Josee; Fall, Tove; Foy, Millennia; Franceschini, No ...; Gao, Wei; Glaeser, Sven; Gu, Xiangjun; Hancock, Dana B.; Heinrich, Joachi ...; Hofman, Albert; Imboden, Medea; Ingelsson, Erik; James, Alan; Karrasch, Stefan; Koch, Beate; Kritchevsky, Ste ...; Kumar, Ashish; Lahousse, Lies; Li, Guo; Lind, Lars; Lindgren, Cecili ...; Liu, Yongmei; Lohman, Kurt; Lumley, Thomas; McArdle, Wendy L ...; Meibohm, Bernd; Morris, Andrew P ...; Morrison, Alanna ...; Musk, Bill; North, Kari E.; Palmer, Lyle J.; Probst-Hensch, N ...; Psaty, Bruce M.; Rivadeneira, Fer ...; Rotter, Jerome I ...; Schulz, Holger; Smith, Lewis J.; Sood, Akshay; Starr, John M.; Strachan, David ...; Teumer, Alexande ...; Uitterlinden, An ...; Voelzke, Henry; Voorman, Arend; Wain, Louise V.; Wells, Martin T.; Wilk, Jemma B.; Williams, O. Dal ...; Heckbert, Susan ...; Stricker, Bruno ...; London, Stephani ...; Fornage, Myriam; Tobin, Martin D.; O'Connor, George ...; Hall, Ian P.; Cassano, Patrici ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Lungmedicin och ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinsk biotek ...; och Medicinsk biotek ...

Artiklar i publikationen: PLOS ONE

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se