SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Larsson Mårten)
 

Sökning: WFRF:(Larsson Mårten) > Label free quantifi...

  • Aftab, Obaid,1984-Uppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin (författare)

Label free quantification of time evolving morphologies using time-lapse video microscopy enables identity control of cell lines and discovery of chemically induced differential activity in iso-genic cell line pairs

  • Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2015
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-234563
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-234563URI
  • https://doi.org/10.1103/PhysRevC.91.024602DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Label free time-lapse video microscopy based monitoring of time evolving cell population morphology has potential to offer a simple and cost effective method for identity control of cell lines. Such morphology monitoring also has potential to offer discovery of chemically induced differential changes between pairs of cell lines of interest, for example where one in a pair of cell lines is normal/sensitive and the other malignant/resistant. A new simple algorithm, pixel histogram hierarchy comparison (PHHC), for comparison of time evolving morphologies (TEM) in phase contrast time-lapse microscopy movies was applied to a set of 10 different cell lines and three different iso-genic colon cancer cell line pairs, each pair being genetically identical except for a single mutation. PHHC quantifies differences in morphology by comparing pixel histogram intensities at six different resolutions. Unsupervised clustering and machine learning based classification methods were found to accurately identify cell lines, including their respective iso-genic variants, through time-evolving morphology. Using this experimental setting, drugs with differential activity in iso-genic cell line pairs were likewise identified. Thus, this is a cost effective and expedient alternative to conventional molecular profiling techniques and might be useful as part of the quality control in research incorporating cell line models, e.g. in any cell/tumor biology or toxicology project involving drug/agent differential activity in pairs of cell line models.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Fryknäs, MårtenUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)mafry516 (författare)
  • Hassan, SaadiaUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)sadihass (författare)
  • Nygren, PeterUppsala universitet,Enheten för onkologi(Swepub:uu)peterng (författare)
  • Larsson, RolfUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)rolflars (författare)
  • Hammerling, UlfUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)ulfha787 (författare)
  • Gustafsson, MatsUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)matsgust (författare)
  • Uppsala universitetCancerfarmakologi och beräkningsmedicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems141, s. 24-320169-74391873-3239

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy